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北京植物靶向代谢组学分析研究

来源: 发布时间:2022-03-15

代谢组学是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生物整体、组织的内源性代谢物质的代谢途径及其所受内在或者外在因素的影响及随时间变化的规律。代谢组学通过揭示内在和外在因素影响下代谢整体的变化轨迹来反映某种病理生理过程中所发生的一系列生物事件。代谢组学在系统生物学的末端。以人体为例,对基因序列信息研究是基因组学的范畴。转录组学研究基因在外在或内在环境刺激下不同的表达。基因信息翻译成蛋白质后,各种蛋白的形状、功能、相互关系是蛋白组学的研究范畴。各种营养物质经过人体的消化、代谢后的代谢物,就是代谢组学的研究范围。代谢组学主要技术手段是色谱(HPLC,GC)。北京植物靶向代谢组学分析研究

代谢组学应用方向:肠道菌群代谢组学,运用代谢组学检测肠菌代谢物的动态变化,了解肠道菌群在宿主中的代谢状态,直观的研究肠道菌群与疾病发生的发展的关系,为疾病的预防,调高宿主的健康水平提供新的思路。经典脂质组学:对生物体、组织或细胞中的脂质以及与其相互作用的分子进行全方面系统的鉴定分析。了解脂质的结构和功能,揭示脂质代谢与细胞乃至机体的生理、病理过程之间的关系,普遍运用于分子生理学、功能基因组学以及环境与健康等重要领域。上海动物靶向代谢组学主要技术代谢组学是要涉及研究每一个代谢组分的共性、特性和规律。

代谢组学介绍:通过液质联用(LC-MS)方法检测生物体受外界刺激前后体内大多数小分子代谢物的动态变化,重点寻找在实验组和对照组中有明显变化的代谢物,进而研究这些代谢物与生理病理变化的相关关系,其研究对象大多是分子量1500Da以内的小分子物质。技术优势:较高的灵敏度、分辨率;较宽的动态范围;适合对标本中未知代谢物的探索研究;适合于生物样本中复杂代谢产物的检测和潜在标志物的鉴定。代谢组学应用方向: 土壤代谢组学。研究土壤中有机质及土壤微生物代谢含量变化及相互作用,了解土壤微生物多样性及其碳代谢能力,为探索调节、控制和改善土壤环境质量提供重要的参考。

药物代谢和代谢组学区别:代谢组学与药物代谢不同是它关注的对象不是外源性的药物而是生物体本身就有的内源性代谢物。这些代谢物是糖,脂肪,蛋白质,核酸,胆汁酸等等代谢得到的。还有共生菌代谢的,是一个庞大的混合物。目的是通过样本的对比,发现潜在标志物,指导疾病早期诊断甚至基因水平的研究。而药物代谢的目标是只要只要追踪到这种药物分子在体内变化就好,相当具有靶向性,因此使用的技术手段就是LC-MS。检测药物的中间体,和具体的药效,药代动的效应。代谢组学的研究处于生物信息流的中游。

代谢组学样本收集指南:1.血浆样本收集:(1)从合适的静脉采集血液(典型10mL)到标记的肝素锂血浆收集管中(肝素锂用作抗凝剂)。(2)立即于4 °C离心(3000g)20min,上清液即为血浆。(3)离心完毕,取出血浆收集管,取上清液(血浆),分等份(0.5mL或0.1mL),转移到冻存管中(冰上),旋盖。(4)保存于-80℃冰箱。寄样需足量干冰。2.血清样本收集:(1)从合适的静脉采集血液(典型10mL)到血清收集管中。(2)将血清收集管冰水浴(4℃)凝集至少1h(2h以内),记录凝集时间。(3)将血清收集管放到冷冻离心机中低温(4℃)离心15min(2500 g)。(4)离心完毕,取出血清收集管,取上清液,分等份(0.5mL或0.1mL),转移到冻存管中(冰上),旋盖。(5)保存于-80℃冰箱。寄样需足量干冰。代谢组学是继基因组学和蛋白质组学之后新近发展起来的一门学科。河南靶向代谢组学定性分析

在食品安全领域,利用代谢组学工具发现农兽药等在动植物体内的相关生物标志物也是一个热点领域。北京植物靶向代谢组学分析研究

代谢组学研究方法:代谢组学的研究方法与蛋白质组学的方法类似,通常有两种方法。一种方法称作代谢物指纹分析 (metabolomic fingerprinting),采用液相色谱-质谱联用(LC-MS)的方法,比较不同血样中各自的代谢产物以确定其中所有的代谢产物。从本质上来说,代谢指纹分析涉及比较不同个体中代谢产物的质谱峰,然后了解不同化合物的结构,建立一套完备的识别这些不同化合物特征的分析方法。另一种方法是代谢轮廓分析(metabolomic profiling),研究人员假定了一条特定的代谢途径,并对此进行更深入的研究。北京植物靶向代谢组学分析研究

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