蛋白组究竟研究的是什么呢？第1，蛋白质定性，或者说大规模检测某些蛋白质是否存在于样品当中；第2，蛋白质定量，也就是大规模检测某些蛋白质的含量（包括一定含量与相对含量）；第3，蛋白质翻译后修饰，这些修饰主要包括磷酸化，泛素化，糖基化，乙酰化等等，也包括对这些翻译后修饰的定量研究。这三大块中所提到的大规模，既可以是样品数量的大规模高通量，也可以是少量样本中蛋白数量的大规模高通量。研究原因：首先，由于翻译调控和翻译后调控的存在，RNA的表达量与实际对应蛋白质的含量相关性并不高，就简单地测试了酵母中mRNA和对应蛋白质的定量相关性，结果是，低丰度蛋白与mRNA的相关性尤其低，而高丰度蛋白和其mRNA的相关性则高，经过平均后r值只为0.4。蛋白质组可以随着组织、甚至环境状态的不同而改变。贵州修饰蛋白组学技术服务

定量蛋白质组学分析（QuantitativeProteomics）是对一个基因组表达的全部蛋白质或一个复杂混合体系内所有蛋白质进行精确鉴定和定量。可用于筛选和寻找任何因素引起的样本之间的差异表达蛋白，结合生物信息学揭示细胞生理病理等功能，同时也可对某些关键蛋白进行定性和定量分析。目前定量蛋白质组学技术常见标记（Label）和非标记的（LabelFree）定量策略。定量蛋白质组学技术常见的几类主要包括：LabelFree定量蛋白组分析、SILAC与免疫共沉淀蛋白互作分析、MRM/PRM定量蛋白组学分析、SILAC/Dimethyl标记定量蛋白组分析、SWATH定量蛋白组学、TMT/iTRAQ/multinotch定量蛋白组学分析。哈尔滨DIA定量蛋白质组学一般流程蛋白质组学技术有等电聚焦。

定量蛋白质组学方法学介绍：Label-free：Label-free定量，即非标记的定量蛋白质组学，不需要对比较样本做特定标记处理，只需要比较特定肽段/蛋白在不同样品间的色谱质谱响应信号便可得到样品间蛋白表达量的变化，通常用于分析大规模蛋白鉴定和定量时所产生的质谱数据。Label-free定量不需要标记处理，操作简单，可以做任意样本的总蛋白质差异定量，但对实验操作的稳定性、重复性要求较高，准确性也较标记定量差。因此，Label-free技术适合于大样本量的定量比较，以及对无法用标记定量实现的实验设计。

PRM靶向蛋白组学：PRM技术是一种根据已知实测信息或质谱检测规律的假定信息对样品中的蛋白质进行靶向定量的技术。该技术主要应用仪器为QExactive系列质谱仪，首先以四极杆作为质量过滤器，特异性地选择与预先设定质荷比相同的肽段离子（母离子）通过，随后在高能碰撞池中碎裂母离子，之后通过Orbitrap分析碎片离子（子离子）得到肽段的二级质谱信息。四极杆的高选择性离子过滤与Orbitrap高分辨率测量技术的结合使得PRM技术有很高的特异性，并且有效的降低了背景噪音，去除了干扰离子，提高了灵敏度。在确保数据质量的前提下，为了在一次分析中检测更多的蛋白质，可用预置PRM（ScheduledPRM,sPRM）的方法，这种方法需要知道每个肽段的保留时间信息，使得每个肽段只在其洗脱时间窗口内执行PRM检测，很大程度上提高了检测效率，可同时检测上百种蛋白质。PRM技术是目前应用较普遍的质谱蛋白质靶向定量技术。有很多蛋白质组学的研究者在工业界和医院进行相关研究和日常工作。

蛋白质组学：常用技术：靶向蛋白组（PRM靶向蛋白/肽段定量），修饰蛋白组学（定量磷酸化修饰组学、定量糖基化修饰蛋白组学、定量乙酰化修饰蛋白组学和定量泛素化修饰蛋白组学），互作蛋白组学（代谢物与蛋白互作研究）。什么样本能做蛋白组学检测？大概可以测到多少的蛋白种类？原则上只要能提取到蛋白，就可以做蛋白组检测。样本测到的蛋白种类跟数据库和样本本身蛋白浓度有关，一般数据库越大，可以鉴定到的蛋白质数量越多。也与样本的类型有关，通常，组织细胞相比于体液样本，能够鉴定到更多的蛋白。定量蛋白质组学通过对蛋白质的定量分析，以了解基因在不同的生理、病理和逆境条件下的表达情况。北京高通量蛋白质组学报价

蛋白质组学研究不仅是探索生命奥秘的必须工作，也能为人类健康事业带来巨大的利益。贵州修饰蛋白组学技术服务

定量蛋白质组学技术：TMT定量蛋白组学技术：TMT(TandemMassTags)定量蛋白质组学技术多肽体外标记定量技术。这种技术采用多个（2-10）稳定同位素标签，特异性标记多肽的氨基基团进行串联质谱分析，能够同时比较多达10种不同样本中蛋白质的相对含量，可用于研究不同病理条件下或者不同发育阶段的组织样品中蛋白质表达水平的差异。iTRAQ定量蛋白组学技术是多肽体外标记定量技术。这种技术同TMT定量蛋白组学技术相似，可研究不同病理条件下或者不同发育阶段的组织样品中蛋白质表达水平的差异。贵州修饰蛋白组学技术服务

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