代谢组学比较常用到的数据分析方法：多变量分析：多变量分析方法能同时处理数百或数千个变量，并且能处理变量之间的相互关系。利用变量之间的协方差或相关性，使原始数据在较低维空间上的投影能尽可能地捕获数据中的信息。但是如果存在大量无信息变量可能会妨碍多变量分析的能力，无信息变量的数量越多，减少真阳性数量的效果就越明显。多变量分析分为无监督分析方法和有监督分析方法。在代谢组学分析中无监督学习有主成分分析只需要数据集X，而有监督分析方法主要是偏比较小二乘判别分析和正交偏比较小二乘判别分析，这类方法在分析时除了需要数据集X，还需对样品进行指定并分组, 这样分组后模型将自动加上另外一个隐含的数据集Y，通常Y的赋值用-1/1或者0/1表示类别信息。代谢组学研究对象大都是相对分子质量1000以内的小分子物质。贵阳脂质代谢组学多定性分析

代谢组学在系统生物学中有什么作用？它的地位如何？代谢物作为生物体表型的基础能够帮助我们更直观有效地了解生命现象揭示生命本质。代谢组学本质上是指从整体上研究生物体的代谢物，是对某一生物、组织或细胞中的所有低分子量代谢产物进行定性与定量分析的一门科学。代谢组学以指标分析为基础，高通量检测为手段，通过研究生物体内代谢物的种类与数量及其变化规律来阐述机体在正常生命状态及环境变化后的代谢过程。代谢组是系统生物学的分支学科之一。其研究内容主要包括对代谢物进行定性或定量分析，不同基因型的生物体进行代谢组学表型研究，不同生长环境及加物理、化学或生物性刺激后个体代谢产物的应答，进行代谢途径或代谢网络解析与转基因评价。广东农学靶向代谢组学质谱分析代谢组学是继基因组学、蛋白质组学、转录组学后出现的新兴“组学”。

代谢组学比较常用到的数据分析方法：代谢组学分析数据用于统计分析时，数据集通常为一个N × K的矩阵（X矩阵），N表示N个样本数，每一行表示一个样品， K表示K个变量，每一列表示一个变量，在代谢组学中变量通常是指代谢物含量。单变量分析方法只分别分析单个变量，不考虑多个变量的相互作用与内在联系。具有简单性、易应用性和可解释性。但是无法基于整体数据对所测样品的优劣、差异进行综合评价和分析。差异倍数变化大小（Fold Change，FC）表示实验组与对照组的含量比值，可以快速考察各个代谢物在不同组别之间的含量变化大小。

代谢组学：代谢组学 （metabolomics）的出现是生命科学研究的必然。是对某一生物或细胞中相对分子量小于1,000的小分子代谢产物进行定性和定量分析的一门新学科。代谢组作为系统生物学的重要组成部分，在临床医学领域具有普遍的应用前景。 代谢产物是基因表达的产物，在代谢酶的作用下生成。虽然与基因或蛋白质相比，代谢产物较小，但是不能形成代谢产物的细胞是死细胞，因此不能小看代谢产物的重要性。 研究人员通过对机体代谢产物的深入研究，可以判断机体是否处于正常状态，而对基因和蛋白质的研究都无法得出这样的结论。事实上，代谢组学研究已经能诊断出一些代谢类疾病，如糖尿病、肥胖症，代谢综合症。目前，已经研究清楚的普通代谢途径包括三羧酸循环（TCA），糖酵解，花生四烯酸 （AA）/炎症途径。非靶向代谢组学（Untargeted metabolomics）即非目标代谢组学或发现代谢组学。

代谢组学发展前景：代谢组学是继基因组学、蛋白质组学、转录组学后出现的新兴“组学”,每年发表的代谢组学研究的文章数量都在不断增加。代谢组学的发展很迅速，尽管还没有经典论文出现,但是研究人员相信，与基因组学和蛋白质组学相比，代谢组学将在临床上发挥更大的作用。许多公司通过市场研究发现，健康人并不希望进行基因型分析，所以，对于这些人群来说，基因组学研究在临床上的应用很有限。而代谢组学与临床化学较为相似，且相对于基因组学来说，提供的个人信息更少，故其在临床上的应用有可能产生一定的影响。代谢组学技术可应用于病因病机研究。贵阳脂质代谢组学多定性分析

代谢组学技术可应用于功能基因组学。贵阳脂质代谢组学多定性分析

代谢组学尿液样本收集：1）取空腹晨尿、中段尿（临床）或晨间1 h尿（动物）于50 mL离心管中；2）4 ℃ 下10000 rpm离心10 min取上清，用1.5 mL离心管分装，保存于-80 ℃。3）动物1 h尿量不够的情况下，可分多次收集尿液；如需收取24 h尿液，需要使用带低温装置的代谢笼收集，并且及时冻存样本。4）收集完尿液样本后，建议使用液氮淬灭15 min后，再分装多管后于-80 ℃冻存。组织样本收集：动物组织（包括脑、心、肝、脾、肺、肾、肌肉和皮肤等；软体动物如血吸虫）：1）取适量组织，用预冷的PBS缓冲液或生理盐水清洗干净；2）迅速剥去非必需的脂肪和结缔组织，再用PBS缓冲液或生理盐水冲洗干净；3）用干净的无尘吸水纸吸干水分，将组织分成50-100 mg / 管分装待用；4）管子上做好标记后迅速放入液氮中冷冻处理至少15 min，-80 ℃冻存；干冰运输。贵阳脂质代谢组学多定性分析

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