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湖北常规靶向代谢组学领域

来源: 发布时间:2022-02-23

代谢组学发展至今,代谢组学技术已经远远超出了标准临床化学技术的范围,能够精确分析数百至数千种代谢物。代谢组学提供了代谢表型的详细表征,并可以在许多水平上进行精密医学研究,包括表征疾病基础的代谢紊乱,发现新的治靶标以及发现可用于诊断疾病或监测药物的活性。比较常见的代谢组学分析方法是质谱(MS)核磁共振(NMR)光谱。质谱技术又分为LC-MS和GC-MS。其基本原理是使试样中各组分在离子源中发生电离,生成不同荷质比的带电荷的离子,经加速电场的作用,形成离子束,进入质量分析器。与基因组学和蛋白质组学相比,代谢组学与生理学的联系更加紧密。湖北常规靶向代谢组学领域

代谢组学样本收集植物组织:果实、种子:1)对于含水量高、体积较大的果实(番茄、西瓜、苹果等)需要先将样品分成“均匀”的小块(≈ 200 mg/样本)分装至2 mL离心管中,标号后迅速放入液氮中冷冻处理至少15 min。2)对于细小的颗粒种子(拟南芥种子、谷物种子等),可以先将同一组的植株种子混匀后再分装(≈ 200 mg/样本)至离心管中,标号后迅速放入液氮中冷冻处理至少15 min。3)对于要求对整个果实进行提取的(整粒葡萄等),需要把果实装在50 mL离心管/自封袋中,标号后迅速放入液氮中冷冻处理至少15min,-80 ℃冻存,干冰寄送。湖北常规靶向代谢组学领域代谢组学的研究对象与层次有哪些?

代谢组学有哪些特点?(1) 代谢处于系统生物学的末端,更能反映基因与外部环境互作的真实情况,因此,在多数生物表型研究上更加适用。(2) 常规代谢组学只关注内源性化合物,也有使用代谢组学技术测定外源性化合物的。内源性化合物的上调和下调指示了与疾病、毒性、基因修饰或环境因子的影响。(3) 高通量定量和定性研究生物小分子化合物。(4) 内源性化合物的结果可以作为疾病的诊断、药物筛选或者其他分型评估等潜在生物标志物。谢组学通过揭示内在和外在因素影响下,生物体的代谢整体的变化轨迹来反映某种生理或病理的一系列发展过程。

代谢组学什么类型的样本更适合,样本采集需要注意什么?绝大多数可以可靠收集的生物样本都适用于代谢组学研究。常见的样本主要有:临床和动物的血清、血浆、尿液、粪便、各类组织、体液;细胞和微生物、培养液和发酵液;植物的根、茎、叶、花等。代谢每时每刻都在发生变化,我们需要研究的是某个或多个瞬时状态,因此样本采集一般需要保证“快速、一致、简单”的,采集后通过低温淬灭(如液氮淬灭或低温冻存等)的方法阻止离体后的样本的代谢活动。另外,不同的检测要求也需要配合不同的收集方法,具体步骤请参照谱领生物样本收集步骤文件。代谢组学主要研究的是各种代谢路径的底物。

代谢组学的研究领域有哪些?1、疾病机制研究。2、疾病诊断与防治。3、新药筛选和开发。4、药物作用机制的研究。5、药物毒性评价。6、植物的细胞代谢组学研究。7、微生物代谢组学研究。代谢组能够检测到的代谢物含量是多少?不同检测平台的灵敏度不一样,灵敏度比较高,可达到fM级。另外,相同含量的不同物质,由于自身化学性质不同,质谱的离子化效率、信号响应强度会差异很大。物质的检测灵敏度跟自身的化学性质有关,化学性质的影响主要表现在离子化效率和质谱碎裂行为两方面。因此,相同含量的不同物质,可能一个能检测出来,另一个检测不出来。代谢组学研究对象大都是相对分子质量1000以内的小分子物质。浙江个性化定制靶向代谢组学方法

相比于其他组学,代谢组学有哪些特殊的优势?湖北常规靶向代谢组学领域

靶向代谢组学的一般分析流程为:1. 数据采集 第1步是得到标准品。如果无法从市场上买到,就必须定制合成。然后通过优化产物离子碰撞能量以得到的信号,再通过测定三重串联四极杆测定代谢物的 MRM 跃迁值。2. 定量 接下来用定量分析软件对 MRM 数据进行处理,得到报告。3. 统计分析和解释 将定量报告输入统计分析软件包,用统计工具,如ANOVA,对数据进行处理。靶向分析:在基于质谱的代谢组学分析中,要意识到离子强度和色谱保留时间都会随着时间的推移而产生漂移,所以在实验中,要按随机顺序对样本进行检测,且数据需要在同天同一批次进行采集,以减少误差。湖北常规靶向代谢组学领域

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