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山东靶向代谢组学分析价格

来源: 发布时间:2022-02-20

代谢组学细胞样本收集:悬浮细胞:1)连同培养基转移到1.5 mL的进口离心管中。2)低速离心5 min(低于3000 rpm),使细胞沉淀于离心管的底部(1*107个细胞为宜)。3)倒掉培养基(尽量倒干净),用预冷的PBS反复冲洗2 ~ 3次,低速离心5 min,弃上清。4)标记离心管,将离心管的尖的一端插入液氮中,淬灭细胞沉淀1 min,-80 ℃冻存,干冰寄送。注意事项:1. 培养基倾倒时尽量倒干净,可使用滤纸将残留培养液吸净;2. 甲醇/水请使用色谱纯及以上规格;3. 液氮淬灭细胞时,请小心避免离心管破碎导致样本受损;4. 建议细胞样本在进行培养时多准备样本,以备后续使用。代谢组学作为系统生物学的一个重要的分支,与其他组学相比有着其特有的优势。山东靶向代谢组学分析价格

代谢组学样本收集注意事项:(1)血液离开动物或人体后,应尽快开展血清、血浆的分离,并严格按照操作说明进行。(2)采集到的血清为黄色透明液体、血浆为淡黄色半透明液体,如果发现样本中是红色,说明在已经发生了了溶血现象,样本需重新制备。(3)血清与血浆的主要区别在于血清中不含纤维蛋白原。血清和血浆中脂质,氨基酸,核苷酸等代谢谱存在差别。粪便样本收集:1.人粪便:(1)用无菌勺挖取新鲜的,排泄中后部的内侧粪便(避免尿液及其他壁对样本污染);(2)分装样本20mg/管。(3)迅速放入液氮中冷冻处理至少15min.(4)-80℃冰箱冻存。寄样需足量干冰。山东靶向代谢组学分析价格非靶向代谢组学(Untargeted metabolomics)即非目标代谢组学或发现代谢组学。

代谢组学疾病诊断应用: 代谢组学研究人员已经对此进行了研究。新生儿是否缺失酶基因,可以在出生时就检测出来??杉觳獬霭ㄉ婕昂铣赏揪吨械幕境煞郑ㄈ绨被幔┑拿浮C溉笔У慕峁褪窍嘤Φ拇徊锕倩蚬?。尿症(PKU)是一种常见的婴儿疾病。这种疾病是由于缺失将苯丙氨酸水解成酪氨酸所必须的苯丙氨酸水解酶基因,导致血液中苯丙氨酸累积造成的。若是不能及时检测出这种天生的代谢缺乏,在婴儿出生后九个月内,就会引起无法挽救的大脑损伤。这种疾病通过简单的血样和尿素化验就可以确诊。而血样和尿素化验以后也将成为代谢指纹研究方法的一部分。像尿症那样的疾病,研究人员正试图从疾病的生物化学基础着手,而不是只有检测生物标记物。他们希望通过代谢组学,可以找到更好的方法去治这些疾病。

代谢组学研究方法:代谢组学的研究方法与蛋白质组学的方法类似,通常有两种方法。一种方法称作代谢物指纹分析 (metabolomic fingerprinting),采用液相色谱-质谱联用(LC-MS)的方法,比较不同血样中各自的代谢产物以确定其中所有的代谢产物。从本质上来说,代谢指纹分析涉及比较不同个体中代谢产物的质谱峰,然后了解不同化合物的结构,建立一套完备的识别这些不同化合物特征的分析方法。另一种方法是代谢轮廓分析(metabolomic profiling),研究人员假定了一条特定的代谢途径,并对此进行更深入的研究。相比于其他组学,代谢组学有哪些特殊的优势?

GC-MS非靶向代谢组学能检测到哪些类别的代谢物?衍生化极大地拓展了GC/MS的检测分析范围。GC/MS能检测到有机酸、氨基酸、单糖、糖醇、胺类、脂肪酸、吲哚、单甘油酯、核苷、二糖、生育酚、甾醇和胆汁酸等代谢物。如何提高定性准确度?GC/MS的定性有双重标准,一是保留指数,二是质谱信息的相似度(similarity)。不同于LC/MS的软电离源,GC/MS使用的EI源属于硬电离,能量较强且稳定,在将代谢物分子电离后,分子离子峰进一步碎裂产生丰富的碎片离子。因此,我们很难在GC/MS上看到分子离子峰。GC/MS提供的是代谢物的“指纹图谱”,将仪器得到的实际指纹图谱和质谱库(如NIST库)进行比对后,我们将会得到一个叫相似度的指标。保留指数和相似度都必须满足设定的阈值,软件才会给出色谱峰的定性结果。然后采用标准品质谱信息进行完全比对定性,也就是说只有经过标准品比对,代谢物才是被100%定性。代谢组学关注的对象是分子量在1000以下的小分子化合物。山东靶向代谢组学分析价格

代谢组学主要研究的是产物的小分子代谢物(MW<1000)。山东靶向代谢组学分析价格

代谢组学什么类型的样本更适合,样本采集需要注意什么?绝大多数可以可靠收集的生物样本都适用于代谢组学研究。常见的样本主要有:临床和动物的血清、血浆、尿液、粪便、各类组织、体液;细胞和微生物、培养液和发酵液;植物的根、茎、叶、花等。代谢每时每刻都在发生变化,我们需要研究的是某个或多个瞬时状态,因此样本采集一般需要保证“快速、一致、简单”的,采集后通过低温淬灭(如液氮淬灭或低温冻存等)的方法阻止离体后的样本的代谢活动。另外,不同的检测要求也需要配合不同的收集方法,具体步骤请参照谱领生物样本收集步骤文件。山东靶向代谢组学分析价格

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