蛋白质组(Proteome)的概念指由一个基因组(genome),或一个细胞、组织表达的所有蛋白质(Protein).蛋白质组的概念与基因组的概念有许多差别,它随着组织、甚至环境状态的不同而改变.在转录时,一个基因可以多种mRNA形式剪接,并且,同一蛋白可能以许多形式进行翻译后的修饰.故一个蛋白质组不是一个基因组的直接产物,蛋白质组中蛋白质的数目有时可以超过基因组的数目.蛋白质组学(Proteomics)处于早期“发育”状态,这个领域的**否认它是单纯的方法学,就像基因组学一样,不是一个封闭的、概念化的稳定的知识体系,而是一个领域.蛋白质组学集中于动态描述基因调节,对基因表达的蛋白质水平进行定量的测定,鉴定疾病、药物对生命过程的影响,以及解释基因表达调控的机制.作为一门科学。蛋白质组(Proteome)一词,源于蛋白质(protein)与基因组(genome)两个词的组合。浙江外泌体蛋白质组学技术服务
蛋白组学样本要求:常规组织:(心、肝、脾、肺、肾、肠、脑、肌肉等)PBS洗涤去除残留血液和污染物,剔除无关的干扰组织(血管、脂肪、结缔组织等);冲洗干净,用组织剪或手术刀将组织分离成1cm3左右的小块;液氮速冻5min,保存于-80℃。软骨组织:PBS洗涤去除残留血液和污染物;用手术刀将软骨切成1cm3左右的小块;液氮速冻5min,保存于-80℃。软体动物(吸虫等)PBS洗涤去除来自宿主的污染;液氮速冻5min,保存于-80℃。蛋白质组的研究不但能为生命活动规律提供物质基础,也能为众多种疾病机理的阐明及攻克提供理论根据和解决途径。南京TMT/iTRAQ标记定量蛋白质组学项目蛋白质组学技术的本质(从分析化学角度来看),就是对蛋白质的定性定量分析。
定量蛋白质组学技术:TMT定量蛋白组学技术:TMT(TandemMassTags)定量蛋白质组学技术多肽体外标记定量技术。这种技术采用多个(2-10)稳定同位素标签,特异性标记多肽的氨基基团进行串联质谱分析,能够同时比较多达10种不同样本中蛋白质的相对含量,可用于研究不同病理条件下或者不同发育阶段的组织样品中蛋白质表达水平的差异。iTRAQ定量蛋白组学技术是多肽体外标记定量技术。这种技术同TMT定量蛋白组学技术相似,可研究不同病理条件下或者不同发育阶段的组织样品中蛋白质表达水平的差异。
蛋白质组学在医学的研究应用:蛋白质组学(Proteomics)是研究细胞、组织或生物体中蛋白质组成、定位、变化及其相互作用规律的科学,包括对蛋白质表达模式和蛋白质组功能模式的研究。蛋白质组学的发展对寻找疾病的诊断标志、筛选药物靶点、毒理学研究等有重要意义,也因此被普遍应用于医学研究。蛋白质组学研究,总体可分为一下几个步骤:(1)差异筛选(Discovery)(2)初步验证(Verification)(3)然后确诊(Validation)。基于质谱的蛋白质组学是目前比较主流的高通量蛋白质研究手段,当前在医疗健康方面的应用主要集中于基础研究和转化医学。蛋白质组学的研究方法将出现多种技术并存。
我国科学家已经在重大疾病如肝病、维甲酸诱导白血病细胞凋亡启动模型及维甲酸定向诱导胚胎干细胞向神经系统分化的模型等比较蛋白质组研究以及一些重要生理和病理体系的蛋白质组成分研究方面获得了重要成就。蛋白质组学的重要应用领域有:在临床疾病中的应用、在微生物蛋白质组学中的应用、在植物研究中的应用、在肾脏病学领域的应用。我们通过研究蛋白质组,可以为患者提供有用的疾病诊断、诊疗、预后评估信息;可以早期更为准确的诊断出胰腺病;也可以为AD的诊断、诊疗药物的设计和筛选奠定基础。这项研究技术其实离我们生活非常近,对我们生命而言尤为重要。近年来,高通量蛋白质分离与鉴定技术,如双向电泳、生物质谱、蛋白质芯片、酵母双杂交系统、生物信息学等相继建立并日趋完善,加速了蛋白质组学的发展。定量蛋白质组学是蛋白质组研究的重要内容。上海定量蛋白组学主要技术
蛋白质组学将成为寻找疾病分子标记和药物靶标比较有效的方法之一。浙江外泌体蛋白质组学技术服务
蛋白组学技术:蛋白质组学研究的首要任务是建立获取和分析蛋白质的常规、可靠、有效的技术。为达到这一要求,就需要样品准备、数据获取标准化及自动化,也就是要有可重复的高通量的技术。蛋白质组学技术手段在不断完善,其工作流程,包括蛋白质样本的制备、分离、定量及鉴定。由双向凝胶电泳、质谱技术、酵母双杂交系统、蛋白质微阵列技术、能进行大规模数据处理的计算机系统和软件、软电离技术及生物信息学技术构成了蛋白质组学研究的主要技术体系。其中蛋白质组学技术中的质谱技术是现在比较常用的一种蛋白质鉴定技术。浙江外泌体蛋白质组学技术服务
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