翻译后修饰蛋白组学分析:蛋白质组学的研究的工作不只聚焦于细胞不同生长时期或是疾病条件下的蛋白质表达水平变化,许多至关重要的生命进程不只由蛋白质相对丰度控制,更重要的是被时空特异分布的、可逆的翻译后修饰所调控,因而揭示翻译后修饰发生规律是解析蛋白质复杂多样的生物功能的一个重要前提。蛋白质发生翻译后修饰时其分子质量会发生响应的改变,通过质谱能够精确测定蛋白质或多肽的分子质量。同时,发生翻译后修饰的蛋白质再样本中含量低且动态范围广,所以在质谱检测前需要对发生修饰的蛋白质或肽段进行富集。蛋白质翻译后修饰的作用主要是改变蛋白质的活性。北京蛋白质氧化修饰组学主要方式
蛋白质翻译后修饰组学:血浆蛋白糖基化修饰分析:蛋白质糖基化指碳水化合物通过共翻译或翻译后修饰的方式附着到蛋白质上的过程,是一种常见的蛋白质翻译后修饰。分泌的细胞外蛋白常被糖基化,糖基化蛋白通常是重要的整合膜蛋白。血浆中的蛋白质包括维持机体正常生理状态的蛋白质和机体分泌、渗漏、脱落的蛋白质,其中不乏存在一些糖基化蛋白质。而蛋白质糖基化修饰不只影响蛋白质的空间构象、生物活性、运输和定位,而且在分子识别、细胞通信、信号转导等特定生物过程中发挥着至关重要的作用。因此对血浆蛋白糖基化进行分析,有助于研究血浆蛋白的生理功能等。四川泛素化修饰蛋白质组学研究蛋白质翻译后修饰的作用主要是改变蛋白质的功能。
蛋白翻译后修饰:蛋白质氨基酸序列的特定位置可以与化学基团或者小分子量的蛋白共价结合从而发生蛋白质翻译后修饰(post-translational modifications,PTMs)。翻译后修饰是蛋白质生物合成的一个步骤,翻译后多肽链在成为成熟的蛋白质产品之前要经过修饰,PTMs的类型包括磷酸化、乙?;⑻腔?、泛素化和二硫键等等,它导致蛋白质组复杂性的大幅增加。对于任何给定的蛋白质,各种各样的PTMs提供了一种通过改变蛋白质的结构和功能来促进细胞快速变化的方法。PTMs在信号转导、蛋白质稳定性和周转率、蛋白质与蛋白质识别和相互作用以及空间定位中起着至关重要的作用。
蛋白质乙?;奘巫檠Ф糠治觯?. SILAC细胞标记,组织/细胞破碎,提取、提纯目的蛋白质(基于SILAC的乙?;奘巫檠Ф浚?. 使用胰蛋白酶将目的蛋白酶解成多肽片段。3. 对多肽片段进行iTRAQ标记(基于iTRAQ的乙酰化修饰组学定量)。4. 使用高效特异性乙酰化抗体对乙?;奘坞亩谓忻庖吒患?。5. 使用LC-MS/MS对富集的乙?;亩谓行蛄蟹治觥?. 数据分析,比对不同样本中蛋白乙酰化修饰水平差异,并对产生变化的生物学意义进行解释。常见的蛋白质翻译后修饰包括磷酸化。
蛋白质磷酸化修饰类型:根据磷酸氨基酸残基的不同,可将磷酸化蛋白质分为4类,即O-磷酸盐蛋白质、N-磷酸盐蛋白质、酰基磷酸盐蛋白质和S-磷酸盐蛋白质。1、O-磷酸盐蛋白质通过羟氨基酸(如丝氨酸、苏氨酸或酪氨酸)的磷酸化形成。2、 N-磷酸盐蛋白质通过精氨酸、赖氨酸或组氨酸的磷酸化形成。3、 酰基磷酸盐蛋白质通过天冬氨酸或谷氨酸的磷酸化形成。4、 S-磷酸盐蛋白质通过半胱氨酸磷酸化形成。蛋白质磷酸化修饰鉴定方法:免疫印迹技术是在凝胶电泳和固相免疫测定技术基础上发展起来的、根据特定抗原-抗体的特异性反应来检测复杂样品中的某种蛋白质的免疫生化分析方法。蛋白质乙?;奘?,顾名思义指的就是在蛋白质原有基础上面嫁接上乙?;?。贵州棕榈?;奘蔚鞍字首檠в心男?/p>
蛋白质翻译后修饰在蛋白质中磷酸化位点分析时应该注意些什么问题?北京蛋白质氧化修饰组学主要方式
蛋白磷酸化修饰过程:蛋白磷酸化修饰这一过程是通过蛋白激酶催化,将磷酸基团从ATP转移到多肽底物的丝氨酸、苏氨酸,或酪氨酸残基上。并且磷酸化修饰的过程是可逆的,去磷酸化反应由蛋白磷酸酶催化完成。蛋白磷酸化检测方法:Western Blot检测方法:Western Blot是检测蛋白磷酸化水平的常用方法,主要过程为先利用SDS-PAGE分离蛋白质,随后将蛋白质转移到PVDF膜上,然后使用特异性识别磷酸化蛋白的抗体来鉴定目标蛋白的磷酸化水平。只有被磷酸化修饰的蛋白才会在相应分子质量的地方显现特异性蛋白条带。北京蛋白质氧化修饰组学主要方式
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