蛋白质组学在生物学领域的研究中的应用是怎样的？研究对象涉及到生物体且生物体内表达蛋白，理论上都可以应用蛋白质组学。蛋白质组学是以研究生物体蛋白组成及其变化规律为目的的应用科学。主要使用的仪器为液质联用高分辨率质谱仪。详细来说，蛋白质组学包含许多分支：非标定量蛋白质组学（定性研究生物体的蛋白组成），定量蛋白质组学（对生物体蛋白表达含量进行测定），修饰蛋白质组学（对蛋白质翻译后修饰进行检测）及相互作用蛋白质组研究（蛋白质直接相互作用机制解析）等。蛋白质组学属于后基因组时代的科学研究，针对基因表达产物进行检测与定量。因此更能反应出生物体生理条件下的水平与状态。蛋白质组学包括蛋白质的表达水平。贵阳高通量蛋白质组学分析方法

蛋白组究竟研究的是什么呢？第1，蛋白质定性，或者说大规模检测某些蛋白质是否存在于样品当中；第2，蛋白质定量，也就是大规模检测某些蛋白质的含量（包括一定含量与相对含量）；第3，蛋白质翻译后修饰，这些修饰主要包括磷酸化，泛素化，糖基化，乙酰化等等，也包括对这些翻译后修饰的定量研究。这三大块中所提到的大规模，既可以是样品数量的大规模高通量，也可以是少量样本中蛋白数量的大规模高通量。研究原因：首先，由于翻译调控和翻译后调控的存在，RNA的表达量与实际对应蛋白质的含量相关性并不高，就简单地测试了酵母中mRNA和对应蛋白质的定量相关性，结果是，低丰度蛋白与mRNA的相关性尤其低，而高丰度蛋白和其mRNA的相关性则高，经过平均后r值只为0.4。贵阳高通量蛋白质组学分析方法蛋白质组学由此获得蛋白质水平上的关于疾病发生，细胞代谢等过程的整体而全方面的认识。

LabelFree(非标记蛋白质组学技术)：在非标记策略的定量模型中，主要涉及两种不同的算法：其一，以肽段的色谱峰积分面积为基础，通过比较一对生物样品中相对应到蛋白质酶解多肽的色谱积分面积而得到两者的相对丰度；其二，以肽段被质谱检测的计数为基础，通过归一化来表征被检测蛋白质的相对丰度。非标记技术认为肽段在质谱中被捕获检测的频率（Counts）与其在混合物中的丰度成正相关，因此蛋白质被质谱检测的计数反映了蛋白质的丰度，通过适当的数学公式可以将质谱检测计数与蛋白质的量联系起来，从而对蛋白质进行定量。

Labelfree非标记定量蛋白质组学技术特点：（1）不需要标记处理，操作简单，成本低、实验周期短；（2）每个样品单独处理、上机；（3）可以做任意样本的总蛋白质差异定量，样品类型不受限制；（4）对单个样品的蛋白总量要求相对较低，对于组织本身蛋白量不高，可以选择Label-Free，适用于一些难收集样品；（5）定性没有问题，但是定量的准确性较标记定量稍差，会受到质谱稳定性等因素的影响；（6）适合于大样本量的定量比较（大于24个样本）。蛋白质组学在医学的研究应用：蛋白质组学(Proteomics)是研究细胞、组织或生物体中蛋白质组成、定位、变化及其相互作用规律的科学。蛋白质组学技术有等电聚焦。

PRM靶向定量蛋白质组学分析流程是怎样的？要做PRM首先要明确目标蛋白（或多肽）是什么，设计和建立针对这些目标蛋白PRM质谱采集方法，然后对待测样品进行PRM数据采集，将得到的原始谱图数据导入分析软件提取子离子信息进行定量。另外，如果配制已知浓度的标准肽段，用PRM额外做一个标准曲线，即可实现一定的定量。PRM靶向定量蛋白质组学技术能应用到哪些方面？研究工作中涉及到蛋白或多肽定量的都可以通过PRM技术来实现。具体说来，比如验证定量蛋白质组学中某些蛋白的变化，多肽的相对和一定的定量，想做蛋白定量却没有抗体，针对蛋白修饰位点的定量，想同时定量多个蛋白的情况等，都可以用PRM来做。蛋白质组研究技术在研究对象上，覆盖了原核微生物、真核微生物、植物和动物等范围。贵阳高通量蛋白质组学分析方法

蛋白质组学将成为寻找疾病分子标记和药物靶标比较有效的方法之一。贵阳高通量蛋白质组学分析方法

蛋白质组学在医学的研究应用：蛋白质组学(Proteomics)是研究细胞、组织或生物体中蛋白质组成、定位、变化及其相互作用规律的科学，包括对蛋白质表达模式和蛋白质组功能模式的研究。蛋白质组学的发展对寻找疾病的诊断标志、筛选药物靶点、毒理学研究等有重要意义，也因此被普遍应用于医学研究。蛋白质组学研究，总体可分为一下几个步骤：（1）差异筛选（Discovery）（2）初步验证（Verification）（3）然后确诊（Validation）。基于质谱的蛋白质组学是目前比较主流的高通量蛋白质研究手段，当前在医疗健康方面的应用主要集中于基础研究和转化医学。贵阳高通量蛋白质组学分析方法

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