转录组学为什么原核物种只能做有参转录组分析？由于原核生物的基因组中存在大量基因重叠区域、操纵子及多顺反子，如果按照无参转录组分析策略进行组装的话，难度较大，组装结果存在较大风险。转录组学差异基因数目多少比较合理？不同的处理，不同的研究目标，差异基因的数目是不同的，从几十个到几千个都有可能。但是如果差异基因数目是个位数或者上万，那么就需要和分析人员沟通一下，查一查是否有问题。转录组学差异基因太多，注释信息太杂乱，怎么挑选目标基因？对不同的差异组合进行维恩图分析，挑选共有或者特有的差异基因作为后续的研究对象；根据前人的文献报道，挑选相关差异基因，不要局限在自己研究的物种上。转录组学是一门在整体水平上研究细胞中基因转录的情况及转录调控规律的学科。北京全长转录学组

转录组学和基因组学目前有实用价值吗?二者实用价值非常大，尤其是对有瘤的患者的医治，简直颠覆了传统医治的模式。转录组和基因组月在生物学研究中有着重要价值。例如研究某个基因功能的时候，可以构建该基因的敲除或者过表达生物，然后对比野生型进行转录组分析看看该基因涉及什么表达网络。此外在医学方面的应用也很大，例如在有的瘤病人中进行基因组学测序和分析能够了解其中的发生的发展的驱动基因，然后能根据发展的驱动基因研究靶向药物，从而推动瘤的药物研发和医治！广州mRNA-seq转录组学技术转录组具有时间特异性的特点。

单细胞转录组学技术：10×genomics技术：首先在凝胶微珠上种上特定的DNA的片段，DNA的片段由三部分组成：Barcode、UMI、PolyT组成。Barcode是16个碱基的长度。一共有400万种Barcode，一个微珠是对应于一种Barcode，通过这400万种Barcode，可以把凝胶微珠给区分开（通过barcode可以把cell分开）。UMI是一段随机序列，也就是说每一个DNA分子，都有自己的UMI序列（一个微珠上有很多种UMI，通过UMI可以把RNA分子分开，并可以标记RNA分子的数量）。10个碱基长的UMI，有100万种序列的变化（4^10=1,048,576），UMI的作用是为了区分哪些reads是来自于一个原始cDNA分子区分基因片段重复还是duplication及区分是真实的SNP位点还是PCR产生的突变。通过10×genomics仪器将单个细胞与单个凝胶微珠通过油相混在一起，形成油包水的小微滴。

转录组是干什么用的，和表达谱有什么区别？转录组，指细胞某一时期所有基因的转录水平。转录组学，是一门在整体水平上研究细胞中基因转录的情况及转录调控规律的学科。简而言之，转录组学是从RNA水平研究基因表达的情况。对RNA的分析。分析应该是分几个维度的DNA到RNA，RNA的剪切拼接，RNA的翻译。表达谱有两种，分别是基因表达谱和蛋白质表达谱。基因表达谱是指细胞中所有基因表达的格局。通过比较分析基因表达谱，可从整体水平研究代谢机制，认识基因相互作用的网络关系，发现重要基因。转录组学能够同时鉴定和定量稀有转录本和正常转录本。

单细胞转录组学测试步骤：第1步就是把单个细胞分选出来。分选的方式也比较多，物理切割，酶消化，FACS分选等。假如已经分到了一个单细胞，跟常规的转录组步骤上是一样的。下一步就是把单细胞里的RNA提取出来去建库测序。但是一个细胞里的RNA含量是比较少的，难建库成功。这个里面“量”的概念很有意思。比如说单细胞量少，需要特殊处理。因为单细胞里面RNA的量少，所以说整个富集的过程中会出现一部分基因在一个细胞里能检测到，在另外一个细胞里面检测不到，而每个细胞里面的检测存在一个随机性，同时单细胞测序深度比较低，所以说分析时相比于普通转录组有一些是需要特别注意，但整体的分析思路是类似的。转录组学广义上指在某一生理条件下，细胞内所有转录组产物的组合。广州mRNA-seq转录组学技术

转录组学可以在单核苷酸水平对任意物种的整体转录活动进行检测。北京全长转录学组

转录组学即特定细胞在某一功能状态下转录出来的所有RNA的总和，包括mRNA和非编码RNA。转录组学（transcriptomics），是一门在整体水平上研究细胞中基因转录的情况及转录调控规律的学科。简而言之，转录组学是从RNA水平研究基因表达的情况。转录组即一个活细胞所能转录出来的所有RNA的总和，是研究细胞表型和功能的一个重要手段。转录组学（transcriptomics），是一门在整体水平上研究细胞中基因转录的情况及转录调控规律的学科。简而言之，转录组学是从RNA水平研究基因表达的情况。北京全长转录学组

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