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广东定量N糖基化蛋白质组学领域

来源: 发布时间:2022-02-12

蛋白质组学:质谱分析蛋白质组学的基本原理主要是通过测定被测样品离子的理化性质来进行分析,根据样品的质量谱图和相关信息从而得到定性和定量结果。目前,蛋白质组学质谱分析一般是根据保留时间(retentiontime)、质荷比(m/z)、离子强度(intensity)这三个维度对肽蛋白质进行鉴定和定量,即3D蛋白质组学。4D蛋白质组学在3D蛋白质组学的基础之上增加了第四维度,离子淌度(mobility),主要根据离子的形状和截面对离子进行分离,能够区分m/z差值非常小的肽段,使低丰度蛋白信号能够被区分和识别出来。4D蛋白质组学基于timsTOFPro质谱仪,结合PASEF(ParallelAccumulationSerialFragmentation,同步累积连续碎裂)与TIMS(TrappedIonMobilitySpectrometry,离子迁移谱),可重复测量所有检测离子的碰撞截面(CCS),能更快、更灵敏的进行蛋白质组定性和定量。蛋白质组学在应用中,更多地用于提供高通量蛋白质定性定量信息。广东定量N糖基化蛋白质组学领域

蛋白质组学在医疗和健康方面有什么应用?具体而言,蛋白质组学在此类应用中,更多地用于提供高通量蛋白质定性定量信息。作为检测手段的蛋白质组学:事实上,在当前的生物医学研究和临床诊断中,蛋白质组学相关技术有非常多的应用。因为蛋白质组学技术的本质(从分析化学角度来看),就是对蛋白质的定性定量分析。生物医学和临床诊断中,需要大量表征一种或多种蛋白质的含量、氨基酸序列、翻译后修饰等信息。蛋白质组学相关技术目前在一小部分]应用中具有独特优势。有很多蛋白质组学的研究者在工业界和医院进行相关研究和日常工作。很容易发现,当前蛋白质组学的临床应用更多地集中在第二类。第1类的应用更接近于生物医学基础研究,目前还没有和大部分人的现实生活产生关系。浙江PRM定量蛋白质组学分析方法蛋白质组学研究不仅是探索生命奥秘的必须工作,也能为人类健康事业带来巨大的利益。

蛋白质组学在医疗和健康方面有什么应用?基于质谱的蛋白质组学是目前比较主流的高通量蛋白质研究手段,当前在医疗健康方面的应用主要集中于基础研究和转化医学。随着质谱、系统生物学、生物信息学等相关学科的发展,我认为今后我们会更多地在现实生活中见到蛋白质组学相关的应用。如定量胰岛素、鉴定血红蛋白氨基酸突变(镰刀形红细胞症)、糖化血红蛋白比例测定等。从测试体量估计,应该远小于1%的ELISA测试量。由于成本和通量等原因,蛋白质组学技术并不如ELISA适合大量的日常分析。但对于一些分析有问题的项目,采用基于质谱(或二维胶等手段)的蛋白质组学有独特的技术优势。另外,蛋白质组学方法开发和验证周期短,在中高级特殊应用(如极少使用的特殊蛋白指标临床检测、未知疾病研究和控制)中也有其独特优势。

蛋白质组学技术:电喷雾质谱:ESI-MS是利用高电场使质谱进样端的毛细管柱流出的液滴带电,在N2气流的作用下,液滴溶剂蒸发,表面积缩小,表面电荷密度不断增加,直至产生的库仑力与液滴表面张力达到雷利极限,液滴爆裂为带电的子液滴,这一过程不断重复使液滴非常细小呈喷雾状,这时液滴表面的电场非常强大,使分析物离子化并以带单电荷或多电荷的离子形式进入质量分析器。ESI-MS从液相中产生离子,一般说来,肽段的混合物经过液相色谱分离后,经过偶联的与在线连接的离子阱质谱分析,给出肽片段的精确的氨基酸序列,但是分析时间一般较长。目前,许多实验室两种质谱方法连用,获得有意义的蛋白质的肽段序列,设计探针或引物来获得有意义的基因。随着蛋白质组研究的深入,又有多种新型质谱仪出现,主要是在上述质谱仪的基础上进行改进与重新组合。有很多蛋白质组学的研究者在工业界和医院进行相关研究和日常工作。

Labelfree非标记定量蛋白质组学技术特点:(1)不需要标记处理,操作简单,成本低、实验周期短;(2)每个样品单独处理、上机;(3)可以做任意样本的总蛋白质差异定量,样品类型不受限制;(4)对单个样品的蛋白总量要求相对较低,对于组织本身蛋白量不高,可以选择Label-Free,适用于一些难收集样品;(5)定性没有问题,但是定量的准确性较标记定量稍差,会受到质谱稳定性等因素的影响;(6)适合于大样本量的定量比较(大于24个样本)。蛋白质组学在医学的研究应用:蛋白质组学(Proteomics)是研究细胞、组织或生物体中蛋白质组成、定位、变化及其相互作用规律的科学。蛋白质组学的研究是生命科学进入后基因时代的特征。广东Label free多肽组学检测价格

蛋白质组随着基因组学研究的不断深入,蛋白质组学已逐渐成为研究热点。广东定量N糖基化蛋白质组学领域

定量蛋白质组学方法学介绍:iTRAQ:iTRAQ定量是目前定量蛋白质组学应用比较普遍的技术,该技术的关键原理是多肽标记和定量,将多肽的含量转化为114、115、116和117同位素的含量(或113、114、115、116、117、118、119和121的8标记),从而简化了定量的复杂性,然后通过多肽定量值回归到蛋白的定量值,从而测定出不同样本之间蛋白质的差异。iTRAQ定量不依赖样本,可检测出较低丰度蛋白,胞浆蛋白、膜蛋白、胞外蛋白等,且定量准确,可同时对8个样本进行分析,并可同时得出鉴定和定量的结果,特别适用于采用多种处理方式或来自多个处理时间的样本的差异蛋白分析。广东定量N糖基化蛋白质组学领域

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