转录组学(Transcriptomics)，是一门在真整体水平上研究细胞中基因转录的情况及转录调控规律的学科，从RNA水平研究基因的表达情况。转录组测序是通过二代测序平台快速全方面地获得某一物种特定细胞或组织在某一状态下的几乎所有的转录本及基因序列，可以用来研究基因表达量、基因功能、结构、可变剪接和预测新的转录本等等。转录组（transcriptome），是指特定生长阶段某组织或细胞内所有转录产物的汇合，狭义上指所有mRNA的汇合。转录组学即特定细胞在某一功能状态下转录出来的所有RNA的总和，包括mRNA和非编码RNA。转录组学测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和。单细胞转录组学研究

RNA-seq转录组学：也被称为整个转录组鸟测序（wts）。RNA-seq包含三个步骤：测序文库的建立，在特定平台中测序和生物信息学分析。RNA-Seq是一种基于NGS技术的新的转录分析方法。采用NGS技术对从感兴趣的RNA样本序列反转录得到的cDNA进行测序。简而言之，就是对剪切变体、转录后RNA编辑、内含子表达水平和特定等位基因的表达情况进行定性和定量分析。RNA-Seq原理：在对基因组测序和分析研究的同时，复杂的转录组研究也普遍发展起来。利用高通量测序技术平台分析转录组的结构和表达水平情况，更能挖掘未知转录本和稀有转录本信息，精确地识别RNA的选择性剪切以及编码序列的单核苷酸多态性（SPN），进一步解析复杂的转录组信息。南京外泌体microRNA转录组学研究转录组学测序必须做生物学重复么？

转录组学：随着越来越多的基因组序列相继被测定,生命科学的研究进入了后基因组时代,各类组学技术得到迅速地发展与普遍地应用包括以基因为研究对象的基因组学(Genomics)、以转录过程为研究对象的转录组学(Transcriptomics)。意义：1．转录组谱可以提供特定条件下某些基因表达的信息,并据此推断相应未知基因的功能,揭示特定调节基因的作用机制.2．通过基于基因表达谱的分子标签,不只可以辨别细胞的表型归属,还可以用于疾病的诊断.3．转录组的研究应用于临床的另一个例子是可以将表面上看似相同的病症分为多个亚型,尤其是对原发性恶性瘤,通过转录组差异表达谱的建立,可以详细描绘出患者的生存期以及对药物的反应等。

单细胞转录组学基本概念：普通转录组的思路也可以应用到单细胞转录组。普通转录组相当于把一群细胞混合到一起去提取RNA，获得的是每个细胞中RNA表达量的平均值。单细胞是把每个细胞单独分出来去提取RNA，然后建库测序，获得是是单个细胞的表达值。在每个细胞里面基因的表达具有随机性，且存在异质性。而且这些细胞群中会存在不同类型的细胞，尤其是当我们对整个组织进行测序时，它们本身就是由不同类型的细胞组成的，而我们用普通转录组来测序，相当于掩盖住了这些不同的细胞类型的差异，展示的是整个组织的平均的状态，所以说单细胞从这个来看跟普通转录组就不同在是用一个细胞测，不是用一堆细胞测。转录组学分析转录本的结构和表达水平的同时，还能发现未知转录本和稀有转录本。

转录组学测序比其他研究方法有哪些优势?转录组学测序具有以下优势：（1）可以直接测定每个转录本片段序列、单核苷酸分辨率的准确度，同时不存在传统微阵列杂交的荧光模拟信号带来的交叉反应和背景噪音问题；（2）灵敏度高，可以检测细胞中少至几个拷贝的稀有转录本；（3）可以对任意物种进行全基因组分析，无需预先设计特异性探针，因此无需了解物种基因信息，能够直接对任何物种进行转录组分析，同时能够检测未知基因，发现新的转录本，并准确地识别可变剪切位点及cSNP，UTR区域。（4）检测范围广，高于6个数量级的动态检测范围，能够同时鉴定和定量稀有转录本和正常转录本。转录学组测序能够提供更高的检测通量。单细胞转录组学研究

转录组具有时间特异性的特点。单细胞转录组学研究

circRNA转录组学生物学功能：circRNA主要存在于细胞质或外泌体中，具有组织特异性、疾病特异性、时序特异性及高稳定性等特征。近几年，大量的研究表明circRNA在生物的生长发育、胁迫应答、疾病发生和发展等方面密切相关，并预测其在疾病诊断标记物等方面的应用前景，但其生物学功能在很大程度上仍然未知。目前认可度比较高的circRNA生物学功能。miRNAsponge。circRNA富含miRNA结合位点来充当miRNA海绵作用，阻止miRNA在3′非翻译区与mRNA相互作用，进而间接调控miRNA下游靶基因的表达。单细胞转录组学研究

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