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四川亚硝基化修饰蛋白质组学服务

来源: 发布时间:2022-01-30

蛋白质修饰位点分析:基于LC-MS/MS分析能够精确测定蛋白质或多肽分子质量这一特性,从而检测蛋白质或者多肽上位点发生何种修饰。可检测修饰类型如下: 磷酸化、糖基化、乙酰化、泛素化、丙酰化、丁酰化、丙二酰化、戊二酰化、琥珀酰化、单甲基化、二甲基化、三甲基化。1、磷酸化:信号转导、细胞周期、生长发育机理等;2、糖基化:蛋白质折叠、更新以及免疫应答等;3、乙酰化:基因表达调控、细胞凋亡、细胞代谢、蛋白质稳定性以及神经退行性的病变等;4、泛素化:细胞周期、细胞凋亡、转录调控、DNA修复以及信号转导等;5、甲基化:染色质结构及转录调控等;6、丙酰化 / 丙二酰化 / 戊二酰化 / 琥珀酰化:主要存在于线粒体和细菌中,与代谢过程密切相关。在蛋白翻译后修饰方式的鉴定过程中,蛋白会首先被酶切成肽段,然后进入质谱进行分析。四川亚硝基化修饰蛋白质组学服务

蛋白质乙酰化修饰组学技术:乙酰化修饰是体内保守的可逆转的蛋白修饰,对细胞核内转录调控因子的刺激有着重要的作用。此外,还存在的非组蛋白乙酰化修饰参与了代谢通路及代谢酶活性的调节。采用肽段预分离降低高丰度组蛋白对蛋白乙酰化鉴定的影响,再结合免疫共沉淀通过抗体富集乙酰化的肽段,从而实现乙酰化的鉴定及定量。样品要求:1、SDS-PAGE条带:5个以上可见考染条带。2、溶液(目标蛋白质):目标蛋白总量>50μg,目标蛋白浓度>80%。3、溶液(大规模混合蛋白质):蛋白总量>1mg,蛋白浓度>1μg/μl。四川琥珀酰化修饰蛋白质组学质谱鉴定蛋白质翻译后修饰组学磷酸化修饰具有可逆的特性。

蛋白质翻译后修饰组学:血浆蛋白糖基化修饰分析:蛋白质糖基化指碳水化合物通过共翻译或翻译后修饰的方式附着到蛋白质上的过程,是一种常见的蛋白质翻译后修饰。分泌的细胞外蛋白常被糖基化,糖基化蛋白通常是重要的整合膜蛋白。血浆中的蛋白质包括维持机体正常生理状态的蛋白质和机体分泌、渗漏、脱落的蛋白质,其中不乏存在一些糖基化蛋白质。而蛋白质糖基化修饰不只影响蛋白质的空间构象、生物活性、运输和定位,而且在分子识别、细胞通信、信号转导等特定生物过程中发挥着至关重要的作用。因此对血浆蛋白糖基化进行分析,有助于研究血浆蛋白的生理功能等。

蛋白质乙酰化修饰鉴定流程:1. 组织/细胞破碎,提取、提纯目的蛋白质。2. 使用胰蛋白酶将目的蛋白酶解成多肽片段。3. 使用高效特异性乙酰化抗体对乙酰化修饰肽段进行免疫富集。4. 使用LC-MS/MS对富集的乙酰化肽段进行鉴定分析。5. 数据分析,并对鉴定的乙酰化位点的生物学功能进行解释预测。随着蛋白质组研究的发展,我们越来越深刻地意识到,对于生物体生命活动的管理和调控过程,密切相关的不只是单个蛋白质层面的修饰状态,更重要的是研究蛋白质组学水平研究在翻译后修饰的动态变化。高质、高效的蛋白质翻译后修饰富集技术和丰富的、准确的定量手段使得研究蛋白质水平的翻译后修饰组学成为现实,借助这些组学研究手段能够实现不同生理病理状态下生物样本在翻译后修饰水平上的定量比较,深入地揭示翻译后修饰水平的波动与生物生命活动的密切联系。质谱是蛋白质翻译后修饰检测的常用技术之一。

蛋白质磷酸化修饰组学:蛋白质的磷酸化修饰是生物体内重要的共价修饰方式之一。磷酸化修饰本身所具有的简单、灵活、可逆的特性,以及磷酸基团的供体ATP的易得性,使得磷酸化修饰被真核细胞所选择接受成为一种比较普遍的调控手段。蛋白质的磷酸化和去磷酸化这一可逆过程,几乎调节着包括细胞的增殖、发育、分化、细胞骨架调控、细胞凋亡、神经活动、肌肉收缩、新陈代谢发生等生命活动的所有过程,并且可逆的蛋白质磷酸化是目前所知道的比较主要的信号转导方式。目前已经知道有许多人类疾病是由于异常的磷酸化修饰所引起,而有些磷酸化修饰却是某种疾病所导致的后果。蛋白质乙酰化修饰,顾名思义指的就是在蛋白质原有基础上面嫁接上乙酰化基团。四川琥珀酰化修饰蛋白质组学质谱鉴定

蛋白质翻译后修饰的作用主要是改变蛋白质的功能。四川亚硝基化修饰蛋白质组学服务

翻译后修饰蛋白组:翻译后修饰蛋白组分析是指在组学水平上对存在翻译后修饰的蛋白质进行分析。翻译后修饰蛋白组是指细胞或组织等整体水平上的翻译后修饰蛋白。蛋白质的翻译后修饰(Post Translational Modifications, PTMs)是蛋白质在翻译中或翻译后经历的一个共价加工过程。蛋白翻译后修饰通过在一个或多个氨基酸残基上加修饰基团或通过蛋白质水解去基团而改变蛋白质的性质,调节蛋白质的功能。经过翻译后修饰的蛋白质称为翻译后修饰蛋白。目前,已知的蛋白质翻译后修饰主要包括糖基化、磷酸化、乙酰化、泛素化、二硫键配对、甲基化和亚硝基化等等。四川亚硝基化修饰蛋白质组学服务

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