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广州外泌体microRNA转录组学应用

来源: 发布时间:2022-01-28

转录组是特定发育阶段或生理条件下细胞内的完整转录信息的汇合,表示了基因表达的中间状态。转录组测序可以对所有转录物进行分类、确定基因的转录结构、量化转录物的表达水平。蛋白质是生命功能的直接执行者,蛋白组是一种细胞乃至一种生物所表达的全部蛋白质。整合转录组学和蛋白质组学的表达数据对生物样本进行研究,可以从整体上解释生物学问题,探究生物体生理和疾病机理等。转录组学应用于胃肠瘤发生机制研究:利用转录组学可检测瘤细胞恶化过程中的RNA(编码RNA及非编码RNA)的变化,有助于更好地理解胃肠瘤的发生机制。转录组学能准确地识别可变剪切位点及cSNP,UTR区域。广州外泌体microRNA转录组学应用

转录组是干什么用的,和表达谱有什么区别?转录组,指细胞某一时期所有基因的转录水平。转录组学,是一门在整体水平上研究细胞中基因转录的情况及转录调控规律的学科。简而言之,转录组学是从RNA水平研究基因表达的情况。对RNA的分析。分析应该是分几个维度的DNA到RNA,RNA的剪切拼接,RNA的翻译。表达谱有两种,分别是基因表达谱和蛋白质表达谱。基因表达谱是指细胞中所有基因表达的格局。通过比较分析基因表达谱,可从整体水平研究代谢机制,认识基因相互作用的网络关系,发现重要基因。武汉外泌体microRNA转录组学检测价格转录组学无需预先设计特异性探针。

转录组学测序流程:1、样品RNA准备。2、测序文库构建。3、DNA成簇(Cluster)扩增。4、高通量测序(Illumina)。5、数据分析。转录组的分析大致有以下几种情况:1、同一物种在发育过程中的各时间节点的基因表达特点及存在的差异;2、不同品系之间存在的差异表达基因;3、不同的外界条件处理,如细菌、病毒、光照、紫外、干旱、高温、高盐胁迫,对基因表达的影响;4、同一个体,不同组织之间的基因表达差异。简而言之,转录组学是从RNA水平研究基因表达的情况。

转录组学测序类型:1.根据RNA种类:可以分为mRNA测序,SmallRNA测序,LncRNA测序、CircRNA测序、全转录组测序等。2.根据物种特点:比如真核生物或者原核生物,是否有参考基因组,测序平台的不同,分为真核有参和无参转录组测序,原核转录组测序,全长转录组测序等。3.根据相互关系:分为互作转录组,比较转录组等等;此外,基因组甲基化会影响到基因的转录调控,也属于转录调控测序范畴;还有用于研究转录因子与DNA的交互作用或组蛋白修饰在基因组上的分布的ChIP-Seq,研究RNA与蛋白互作关系的RIP-Seq,以及研究RNA甲基化的MeRIP-Seq等。转录组学有高通量、更精确的数字信号。

circRNA转录组学:是一类具有闭合环状结构的非编码RNA分子,没有5′帽子结构和3′poly(A)结构,主要位于细胞质或储存于外泌体中,不受RNA外切酶影响,表达更稳定且不易降解,已被证明普遍存在于多种真核生物体内[1]。大多数circRNA是由外显子环化而成,也有部分circRNA是由内含子环化而成的套索结构。同时由于circRNA含有大量的miRNA应答原件(MREs),能与AGO蛋白形成RNA诱导沉默复合体(RISC)的催化关键,然后导致circRNA降解。根据来源,circRNA可大致分为四类:全外显子型的circRNA,内含子和外显子组合的EIcircRNA,内含子组成的套索型ciRNA,由病毒RNA基因组、tRNA、rRNA、snRNA等环化产生的circRNA。转录组学可应用于基因点突变及多态性检测。北京circ RNA转录组学主要技术

转录学组测序可对任意物种的整体转录活动进行检测。广州外泌体microRNA转录组学应用

转录组学(Transcriptome)广义上指某一生理条件下,细胞内所有转录产物的汇合,包括信使RNA(mRNA)、核糖体RNA(rRNA)、转运RNA(tRNA)及非编码RNA(ncRNA);狭义上指所有mRNA的汇合。转录组具有很强的时间和空间特性,是基因功能及结构研究的基础和出发点,掌握了生物个体基因转录水平的变化,可深入了解其生命活动特征和调控机制。通过新一代高通量测序,能够全方面快速地获得某一物种特定组织在某一状态下的几乎所有转录本的基因序列信息。广州外泌体microRNA转录组学应用

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