甲基化是表观修饰的重要部分，DNA甲基化可以引起DNA构象、稳定性及DNA与蛋白质相互作用方式的改变，从而影响基因表达。DNA链中含有很多CpG结构，双链DNACpG中的胞嘧啶五位碳原子通常容易被甲基化，基因组中60~90%的CpG都被甲基化，未甲基化的CpG成簇出现在基因启动子**序列或者转录起始位点。DNA甲基化转移酶可以催化CpG的甲基化反应。DNA甲基化转移酶有两种，Dnmt1是一种持续性甲基化转移酶，作用于只有一条链甲基化的DNA双链，使其完全甲基化，参与DNA复制过程中新合成链的甲基化修饰；Dnmt3a/Dnmt3b是一种从头甲基化转移酶，可以在CpG上产生新的甲基化修饰，首先半甲基化，继而全甲基化，该甲基化转移酶可能参与细胞生长分化的调控，在**基因甲基化中起到重要作用。近年来CRISPR/Cas9技术得到快速发展，在基因切割活性失活的dCas9的5’端融合一个Dnmt3a，能够通过dCas9介导特定位点的甲基化修饰，调控相关基因的表达。 850K芯片为半金标准，价格低，分析简单，较为适合EWAS类型的课题。重庆焦磷酸测序技术服务服务

    Agilent平台因为MeDIP技术本身的特点，都不能到达单碱基的分辨率，而Illumina的Infinium和GoldenGate检测技术却做得到。Illumina的Infinium甲基化检测技术来源与前期的SNP检测，采用的是单碱基延伸的原理。分析利用两个位点特异的探针检测这些序列差异的位点，一个探针是为甲基化位点(M磁珠类型)设计的，而另一个是为未甲基化位点(U磁珠类型)设计的。探针的单碱基延伸掺入了一个标记的ddNTP，它随后被荧光试剂染色。通过计算甲基化与未甲基化位点的荧光信号比例，可确定检测位点的甲基化水平。Illumina公司早期推出的InfiniumHumanMethylation27BeadChip芯片覆盖27,578个CpG位点。这款芯片在医学领域有***的应用，除了和**相关的甲基化筛选之外，也能用于其他疾病相关甲基化检测。因此对这款产品，研究者给予了很高的评价，目前此产品已停产，取而代之的是InfiniumHumanMethylation450BeadChip芯片。它以单碱基分辨率覆盖了基因组中超过45万个甲基化位点，实现了基因区域和CpG岛的***覆盖。此外，还包括CpG岛之外的CpG位点，在人类干细胞中鉴定出的非CpG甲基化位点，以及**和正常组织中差异表达的甲基化位点等等。它的高覆盖度、高通量以及低价格。 重庆焦磷酸测序技术服务服务细胞、全血、组织样本干冰运输。

    大豆驯化和改良过程中的DNA甲基化足迹(1):128.(IF=)本课题通过WGBS技术比较了野生大豆、地方品种和改良品种(n=45)在大豆驯化与改良过程中DNA甲基化的变化，鉴定了5412个甲基化差异区域(DMR),而这些DMR基因富集在碳水化合物代谢途径。这为大豆不同品种间DNA甲基化提供了有价值的图谱，拓展了大豆驯化与改良的认识。血浆DNA甲基化分析提示EBV病毒相关疾病的病因(1):3256(IF=)本研究通过对鼻咽*(NPC,n=15)、EBV相关性淋巴瘤(n=9)和传染性单核细胞增多症患者(n=5)的血浆游离DNA进行WGBS测序分析，发现EBVDNA甲基化图谱呈现疾病相关模式。这表明在鼻咽*诊断中进行血浆EBVDNA甲基化分析具有重要的潜力。

DNA甲基化对基因表达调控起着动态的重要作用。 借助MethylationEPIC BeadChip，研究人员可以基于单核苷酸分辨率定量检测基因组中的850,000多个甲基化位点。包括FFPE在内的多重样本可以并行分析，以便在每样本比较低成本的情况下实现高通量功能。依托业界**的Infinium实验分析方法，MethylationEPIC BeadChip是全表观基因组关联研究(EWAS)的理想之选。它提供了由**精选的***的覆盖范围，囊括99%的RefSeq基因，95%的CpG岛，高覆盖度的增强子区域和其他内容类别。由于超过90%的Infinium HumanMethylation450K位点内容都涵盖在内，因此新一代MethylationEPIC试剂盒对这些位点也完全支持。在哺乳动物中CpG以两种形式存在。

    **预防和***的一个手段是通过去甲基化恢复某些关键的抑*基因或DNA修复基因的活性，目前研究**多的是DNMTs***剂，它通过***DNMT活性以逆转异常的DNA甲基化。**个表型修饰药物为5-azacytidine及其类似物5-aza-2'-deoxycytidine（5-aza-CdR），这类药物已经美国FDA批准用于白血病前骨髓增生异常综合征的***。5-aza-CdR是胞嘧啶的类似物，在DNA复制过程中可以掺入到DNA链中，一方面它可以降低DNA接收甲基的能力，另一方面它***DNMT活性，导致DNA甲基化水平的降低。体外和体内试验均表明，5-aza-CdR具有降低超甲基化的抑*基因甲基化水平从而*****的能力，临床表明应用5-aza-CdR可提高部分IV期小细胞肺*患者生存率，但该药也存在着不可忽视的毒副作用（如特异性不强，不能针对某一特定抑*基因进行靶向***；高剂量的5-aza-CdR可能诱发**的转移），因此其在临床上的应用受到了很大限制。也有研究表明，低剂量的As2O3可起到***肝*的目的。 羟甲基化DNA免疫沉淀测序是通过5hmC特异性抗体富集结合高通量测序技术。重庆焦磷酸测序技术服务服务

FFPE样本只需要室温运输。重庆焦磷酸测序技术服务服务

    亚硫酸盐结合测序是DNA甲基化检测的“金标准”方案。除了全基因组甲基化测序等研究手段，对于目标基因/位点检测或者转化医学应用研究来说，需要灵活的靶向甲基化测序方案。BSP(BisulfiteSequencingPCR)结合高通量测序的TargetBisulfiteSequencing满足几个到上百个基因/位点的验证需求,具有高通量、低成本的优势,***用于临床大样本多位点的甲基化biomarker筛选及高水平文章甲基化验证环节。微生物定植对肠道免疫和代谢相关基因DNA甲基化的影响——团队成员发表.(IF=)我们以早产幼猪为模型，利用RRBS测序比较正常(n=7)和口服***(n=7)的肠道DNA甲基化差异，发现与先天免疫应答、吞噬和代谢等相关基因的DNA甲基化和表达存在***的差异，并通过高通量BSP测序对EGFL7、LBP8、PTPRE差异甲基化基因进行了验证。 重庆焦磷酸测序技术服务服务