2019国自然基金解析—甲基化研究专题。从生命科学部和医学科学部总体来看：2019年度，生命科学部获自然科学基金委批准资助6478项（不含杰出青年基金项目），批准资助金额共计，单项平均资助金额。2019年度，医学科学部共批资助10138项（不含杰出青年基金项目），批准资助金额共计，单项平均资助金额。从甲基化研究方向来看，与甲基化研究相关的项目总数达283项，项目总金额超过12669万元。其中生命科学部项目总数62项，项目金额3235万元，医学科学部项目总数221项，项目金额9434万元。从2011-2019年甲基化研究方向的项目金额和项目数目分析，整体呈上升趋势；从医学科学部来看，甲基化研究项目获批数量221项，项目金额达到9434万，较之2018年度项目获批金额（7166万元）上升趋势尤为明显，可以看出，甲基化研究日益成为国自然的研究热点。 通过甲基化数据与耐药基因Panel数据联合分析。辽宁hMeDIP-Seq技术服务售后服务

    甲基化-焦磷酸测序（升级版）之前的仪器是Q96，也就是说同时可以上96个反应，但是有效读长只有50bp左右（50bp之后开始衰减，后面的序列只能作为参考）；升级版的Q48，也就是48孔，每次上48个反应，但有效长度可以到100bp左右，而且之前很多不能测过去的特殊结构，现在大部分也能测了。甲基化--------焦磷酸测序的优势。样品要求·样品类型细胞、新鲜组织或DNA样品·样品量细胞样品请提供至少1×106个细胞，组织样品请提供至少100mg的组织块或切片，DNA样品请提供1μg以上的DNA·样品质量基因组DNA无明显降解，主带清晰，大于23Kb，无明显弥散。OD260/280值在～，浓度≥50ng/μl·样品保存细胞样品或新鲜组织块（切成～50mg的小块）可液氮冻存后，-80℃保存。DNA样品可溶于乙醇或超纯水中，-80℃保存。样品保存期间避免反复冻融·样品运输样品置于ml冻存管中，封口膜封好。 辽宁hMeDIP-Seq技术服务售后服务WGBS用于人、哺乳动物及农林牧渔方向的高水平甲基化研究。

    芯片平台作为目前比较成熟的筛选工具，已经在很多领域有了相应的应用。多家芯片公司在DNA甲基化这块儿有了相应的产品提供，其中应用**为***的就Agilent平台和Illumina平台，相应的产品包括AgilentHumanCpGIslandMicroarrayKit，InfiniumHumanMethylation27BeadChip和InfiniumHumanMethylation450KBeadChip。另外RocheNimbleGen和Affymetrix也有相应的芯片推出，但是NimbleGen的芯片今年下半年已经停产。不同的芯片平台，各自的实验过程也是不一样的。安捷伦前期采用的甲基化DNA免疫共沉淀（MeDIP）技术。将基因组DNA分成两份，一份用来做MeDIP，另一份作为对照。两个样品都标记荧光(富集的样品用Cy5标记，对照用Cy3标记)，然后与芯片杂交。芯片上每个探针的Cy5/Cy3强度比例显示出该区域的甲基化程度。

    Agilent甲基化芯片通过SurePrint芯片合成**技术，结合优化的探针设计及实验方法，可灵活进行甲基化研究，得到高灵敏度、高特异性、高重复性的结果。技术流程：1.将基因组DNA超声打断成400-500bpDN**段；2.加热变性并将变性后的单链DNA样品分成两份；3.其中一份单链DNA样品加入抗5'-甲基化胞嘧啶核苷抗体。使用免疫磁珠法分离样品中甲基化DN**段的抗体复合物，样品中其余的非甲基化DN**段被洗脱；4.纯化免疫共沉淀的DN**段；对MeDIP(Cy5)与Input(Cy3)样品分别进行标记；5.标记后的MeDIP与Input样品混合、变性，与芯片杂交；6.检测杂交信号并进行数据分析。芯片种类：Agilent**甲基化芯片，8x60K●和合作伙伴在Agilent公司定制的Promoter芯片。●绝大多数基因是针对基因启动子区域的CpG岛设计探针。●芯片上一共有4160个功能注释比较明确的基因，其中2128个和**发生有关系。●从功能上分，有256基因和细胞凋亡有关，1273个基因和信号传导有关，487个基因和压力和衰老有关。●特别适用于**甲基化研究。 芯片平台作为目前比较成熟的筛选工具。

    cfDNABS-Seq送样要求一、送样类型分离好的血浆二、保存方式分离后的血浆，用ml离心管分装，例如：1ml/管；放-20℃冰箱中保存（短暂保存，1-2周）；放-80℃冰箱中长期保存(1年以内)；保存期间不能冻融。三、运输条件干冰运输：顺丰陆运（3-4天时间），夏季10-15公斤干冰；秋冬季10公斤干冰四、抽血要求1、使用Streck**管（不建议使用普通的EDTA-钠抗凝管），采集10ml外周静脉血（客户没有Streck**管，公司配送）；2、室温或者放置4℃冰箱中半小时以上，不超过8小时，进行血浆分离步骤五、血浆分离步骤1、4℃条件下以1600g离心10min，离心后将上清（血浆）分装到2、4℃条件下以16000g离心10min去除残余细胞，将上清移入新的离心管中，每管分装1ml;3、血浆样本存放于-80℃冰箱中保存;使用干冰运输,提取之前不能冻融。备注1：血浆分离在4℃条件进行，如果客户没有冷冻离心机，也可以在室温条件下进行；备注2：离心后取血浆上清，避免吸取白细胞；通常10ml全血可以获得4-5ml血浆。 甲基化验证是甲基化研究必不可少的一环。北京ATAC技术服务活动

DNA甲基化是生物界神奇的“帽子”。辽宁hMeDIP-Seq技术服务售后服务

Chip-Seq 是指通过染色质免疫共沉淀技术（ChIP）特异性地富集目的蛋白结合的DN**段，并对其进行纯化和文库构建；然后对富集得到的DN**段进行高通量测序，通过将获得的数百万条序列标签精确定位到基因组上，从而获得全基因组范围内与组蛋白、转录因子等互作的 DNA 区段信息，是目前在全基因组水平研究蛋白结合靶DNA序列的重要手段，为转录因子、组蛋白修饰、核小体定位等表观遗传学的研究提供有效方法。

应用领域

1、确定组蛋白修饰的位置及其与基因表达的关系。

2、完成对转录因子及其它蛋白在基因组上结合位点的精细定位。

3、研究特定的核小体或组蛋白的分布。 辽宁hMeDIP-Seq技术服务售后服务