当前位置:首页>商城导航>immunetherapy免疫***收藏|分享immunetherapy免疫***价格:¥:标准套餐高级套餐购买数量:加入购物车立即购买产品详情产品评论(0)immunetherapy免疫疗法免疫疗法是指利用人体自身免疫系统,来终止**细胞。它通过操纵免疫系统,来实现靶向**抗原或突破T细胞浸润的障碍。免疫系统是**的重要***者。很多临床数据表明,**的发生与机体免疫功能密切相关,宿主免疫功能低下或受***往往都会导致**发生率增高。**能够发生的原因之一在于**细胞的免疫逃逸和其分泌的免疫***因子,导致**微环境中的免疫细胞获得免疫***性。因此重新***免疫细胞,逆转**微环境的免疫***状态,是免疫疗法的重要目标。应用场景预测单个样本或者某亚型对免疫***的响应可能性基本原理:通过靶向***免疫检查点受体——CTLA4,PD1及其配体(PDL1,PDL2),来抵抗**微环境的免疫***作用,进而解除机体免疫***,****功能发挥抗**作用。PD-1是共刺激受体B7/CD28家族的成员。它通过与其配体programmeddeathligand1(PD-L1)和programmeddeathligand2(PD-L2)结合来调节T细胞活化。CTLA-4介导的T细胞***。 按照斯普林格学术规范化处理准则提供文稿同行**投稿前意见评估。云南成果发表指导数据科学服务
术语解释:互斥性(mutuallyexclusive):一组基因中只有一个在一种**中发生改变,这种现象被称为互斥性。共现性(co-occurrence):不同途径功能的基因突变可能发生在同一**中,这种现象被称为共现性。数据要求:基因突变数据下游分析:对于存在共现性或互斥性的基因对/基因集基因集的功能分析基因集相关的生存分析基于基因集的潜在靶向药物分析文献一:Functionalgenomiclandscapeofacutemyeloidleukaemia急性髓性白血病的功能基因组图(于2018年10月发表在Nature.,影响因子)文献中使用DISCOVER40方法评估531例白血病患者中**常见的复发性突变的共现性或排他性,并用点图展示。文献二:ALPK1hotspotmutationasadriverofhumanspiradenomaandspiradenocarcinoma文献中利用DISCOVER共现性质和互斥性分析工具对ALPK1和CYLD的互斥性进行了评价。 天津生物/药物信息学分析数据科学方案胰腺疾病预后相关长链非编码RNA。
STEM基因表达趋势分析基因调控网络是一个连续且复杂的动态系统。当生物体按照一定顺序发生变化或者受到外界环境刺激(如受到不同浓度的化学药物诱导)时,基因表达变化也会呈现趋势特征。趋势分析就是发现基因表达的趋势特征,将相同变化特征的基因集中在一种变化趋势中,从而找到实验变化过程中相当有有代表性的基因群。STEM(ShortTime-seriesExpressionMiner),中文名短时间序列表达挖掘器。该软件主要用于分析短时间实验数据,也可用于多组小样本数据。推荐3至8组数据。一般可应用的研究方向有:多个时间点的时间序列数据,例如多个发育时期、处理后多个时间点取样。基本原理STEM采用了一种新的聚类算法来分析时间序列基因表达趋势。聚类算法首先选择一组不同的、有代表性的时间表达模式(temporalexpressionprofiles)作为模型(modelprofiles)。模型是**于数据选择的,并从理论上保证了所选择的模型剖面具有代表性。然后,根据每个标准化过后的基因表达模式,分配给模型中相关系数比较高的时间表达模式。由于模型的选择是**于数据的,因此该算法可以通过排列测试,确定哪些时间表达模式在统计意义上***富集基因。对每一个基因都分配时间表达模式完成后。
三角坐标统计图是采用数字坐标形式来表现三项要素的数字信息图像。三角形坐标图常用百分数(%)来表示某项要素与整体的结构比例。三条边分别表示三个不同分量,三个顶点可以看作是三个原点。三角图可以展示某特定值在一个整体中不同类型的分布。在生物信息中三角图可以方便地展示3种不同疾病或者3个不同分组之间某个指标的相关性。
数据要求
多个样本的三个变量值,或者多个基因在三个不同分组中的数据值,可以是突变频率数据、基因表达数据、甲基化数据等。 实验室致病类病原微生物数据分析平台。
GSEA术语解读Enrichmentscore(ES)ES是GSEA**初的结果,反应关注的基因集S在原始基因数据序列L的顶部或底部富集的程度。ES原理:扫描排序序列,当出现一个基因集S中的基因时,增加ES值,反之减少ES值,一个基因的ES值权重与差异表达度相关。ES是个动态值,**终ES是动态扫描过程中获得的**ES值。如果**终ES为正,表示某一功能基因集S富集在排序序列顶部。ES为负,表示某一基因集S富集在排序序列底部。NES由于ES是根据分析的排序序列中的基因是否在一个基因集S中出现来计算的,但各个基因集S中包含的基因数目不同,且不同功能基因集S与原始数据之间的相关性也不同,因此比较数据中基因在不同基因集S中的富集程度要对ES进行标准化处理,也就是计算NES。NES=某一基因集S的ES/数据集所有随机组合得到的ES平均值,NES是主要的统计量。nominalp-value(普通P值)描述的是针对某一功能基因集S得到的富集得分的统计***性,通常p越小富集性越好。FDR(多重假设检验矫正P值)NES确定后,需要判断其中可能包含的错误阳性发现率。FDR=25%意味着对此NES的判断4次可能错1次。GSEA结果中,高亮显示FDR<25%的富集基因集S。因为从这些功能基因集S中**可能产生有意义的假设。大多数情况下。 数据库建设、公共数据库挖掘。北京组学数据处理数据科学售后分析
糖尿病药物基因组学分析找到新的作用靶点。云南成果发表指导数据科学服务
术语解读:中位数Q2:二分之一分位数上四分位数Q1:序列由小到大排序后第(n+1)/4所在位置的数值下四分位数Q3:序列由小到大排序后第3(n+1)/4所在位置的数值**值:非异常范围内的**值,四分位距IQR=Q3-Q1,上限=Q3+最小值:非异常范围内的最小值,下限=数据要求:某一基因在各**及对应的正常组织的表达数据。应用示例1:(于2014年2月发表于Nature.,影响因子)文章研究了12种主要**类型的突变景观和意义,它首先使用小提琴图展示了12种**的突变频率分布情况,然后查找确定具有***意义的突变基因。应用示例2:(于2017年1月发表在NatCommun.,影响因子)文章研究了Pancancer建模预测体细胞突变对转录程序背景的特异性影响。研究人员基于开发的模型预测重要转录因子,然后使用预测出的突变转录因子的活性情况绘制泛*图谱。 云南成果发表指导数据科学服务