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Recombinant Biotinylated Human TPBG/5T4 Protein

来源: 发布时间:2024-11-19

牛痘DNA拓扑异构酶I(VacciniaVirusDNATopoisomeraseI)与细菌DNA拓扑异构酶的主要区别如下:1.**来源不同**:-牛痘DNA拓扑异构酶I来源于牛痘病毒,是一种真核生物病毒中的酶。-细菌DNA拓扑异构酶则来源于原核生物,如大肠杆菌的ω蛋白等。2.**功能特性**:-牛痘DNA拓扑异构酶I能够解旋DNA的超螺旋结构,并且识别并切割双链DNA末端[5’C(T)CCTT],与DNA形成共价连接形成稳定复合物,遇到DNA的5’-OH基团后,重新连接形成完整DNA链。-细菌DNA拓扑异构酶,如大肠杆菌的ω蛋白,主要功能是催化DNA链断开和结合的偶联反应,以改变DNA的拓扑结构。3.**活性条件**:-牛痘DNA拓扑异构酶I即使在Mg2+不存在的条件下也显示活性。-细菌DNA拓扑异构酶可能需要Mg2+等金属离子作为辅因子来发挥活性。4.**作用的DNA链**:-牛痘DNA拓扑异构酶I能使正负两方的超螺旋分子均形成松散型。-原核生物由来的DNA拓扑异构酶I只作用负链的超螺旋分子。5.**共价键形成**:-牛痘DNA拓扑异构酶I与DNA形成共价连接,此酯键中所贮存的能量可能在切断端的再结合上起着作用。-细菌DNA拓扑异构酶在原核生物中是游离型的5′-OH末端扣3′-磷酸末端与酶形成共价键。


UDG在结构上属于单功能DNA糖基化酶,它通过沿着DNA链滑动,识别尿嘧啶分子,进行碱基切除。Recombinant Biotinylated Human TPBG/5T4 Protein,His-Avi Tag

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牛痘DNA拓扑异构酶I(VacciniaVirusDNATopoisomeraseI)是一种来源于牛痘病毒的I型真核拓扑异构酶,具有以下功能和应用:1.**功能**:-牛痘DNA拓扑异构酶I可以催化双链DNA分子中单链DNA特定序列位置的磷酸二酯键的断开和连接。-具有解超螺旋的酶(DNARelaxingEnzyme)活性,能够通过快速的酶切和连接使双链共价闭合环状的正或负超螺旋DNA发生解超螺旋,形成含有较少的正或负超螺旋的双链环状DNA分子。-能够使双链DNA形成绳结(knotting)或解开绳结(unknotting),联结互补的单链环状DNA成为双链环状DNA。2.**应用**:-作为一种DNA重组连接的新型工具酶,用于DNA载体和重组片段的连接、缺刻修复、接头连接等。-适用于TOPO克隆载体的制备、NGS建库中的接头连接等。-在TOPO克隆技术中,DNA拓扑异构酶I同时具有限制酶和连接酶特性,其生物学功能是在复制期间切割并重新连接DNA。3.**使用方法**:-用于DNA快速酶切流程,包括配制体系反应液、轻柔混匀、37℃孵育15分钟等步骤。4.**储存条件**:-建议在-25~-15℃保存,有效期为3年。5.**注意事项**:-避免起泡或剧烈搅拌、涡旋等操作,以防止酶失活。牛痘DNA拓扑异构酶I因其独特的功能,在分子生物学研究和基因工程中扮演着重要的角色。XeninUBE2L3在调节NF-κB信号通路中的作用可能对免疫反应和炎症过程至关重要。

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T5核酸外切酶在基因编辑中确实有应用,并且具有一些优势:1.**提高编辑效率**:根据一篇研究文章,T5核酸外切酶可以与CRISPR/Cas系统共表达或融合,以提高基因编辑的效率。这种共表达或融合可以增加indel(插入和缺失)频率,尽管增加的幅度可能不大。2.**增强基因编辑效果**:在另一项研究中,通过使用螺旋-螺旋二聚体肽(coiled-coilpeptides)将T5核酸外切酶招募到Cas9或Cas12a蛋白上,可以提高基因编辑的效率,这种方法被称为CCExo(CRISPR-Coiled-coil-Exonuclease)。这种招募方式优于共表达和直接融合,其中强的亲和力CC对显示出高的突变频率和删除长度。3.**应用于多种细胞类型**:CCExo系统在多种细胞系和原代细胞中都能有效地提高基因失活效率,并且在慢性髓性白血病(CML)患者的原代细胞以及异种移植动物模型中展示了其应用潜力,这表明CCExo方法可能成为CML和其他遗传性疾病的潜在选择。T5核酸外切酶与CRISPR核酸酶蛋白进行融合,并引入了核定位信号(NLS)序列以构建表达载体,用于基因编辑。综上所述,T5核酸外切酶在基因编辑中的应用可以增强编辑效率和效果,尤其是在与CRISPR/Cas系统结合使用时。

CUT&RUN和ChIC是两种用于研究蛋白质-DNA相互作用的技术,它们有一些关键的区别:1.**技术原理**:-**ChIC(ChromatinImmunocleavage)**:ChIC技术利用抗体将感兴趣的蛋白与ProteinA-MNase相结合来进行DNA切割。ChIC的优势在于使用TF特异性抗体系住MNase,并只在结合位点裂解。-**CUT&RUN(CleavageUnderTargetsandReleaseUsingNuclease)**:CUT&RUN技术则是在核的轻微MNase处理后释放单核小体和TF-DNA复合物,留下寡核小体。CUT&RUN通过在冰上进行简短的消化反应,在TF结合的MNase扩散到周边的基因组和裂解可接近的染色质之前在上清中恢复TF-DNA复合物。2.**操作步骤和简便性**:-**ChIC**:ChIC可能需要甲醛固定操作,这可能重新引入了ChIP-seq的一些问题,如交联导致的DNA和蛋白质的化学修饰。-**CUT&RUN**:CUT&RUN简化了操作步骤,使用磁珠固定细胞核,适用于新鲜和冷冻组织样本,缩短了生成DNA测序文库的时间(1-2天)。3.**背景信号和信噪比**:-**ChIC**:ChIC产生的背景信号可能较高,因为它可能涉及到非特异性的DNA切割。

Cas12a不仅具有顺式切割活性,还具备独特的反式切割活性,这使得它能够无差别地裂解附近的单链DNA。

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BstDNAPolymerase,LargeFragment(嗜热脂肪芽孢杆菌DNA聚合酶大片段)是一种经过改造的酶,它来源于嗜热脂肪芽孢杆菌(Bacillusstearothermophilus)DNA聚合酶I,通过重组技术在大肠杆菌中表达并纯化获得。这种酶具有5'→3'的DNA聚合酶活性,但不具有5'→3'的核酸外切酶活性,因此它在等温扩增反应中非常有用,如环介导的等温扩增(LAMP)和滚环扩增(RCA)等。以下是BstDNAPolymerase,LargeFragment的一些关键特点和应用:1.**等温扩增**:BstDNAPolymerase,LargeFragment具有很强的链置换能力,适用于多种等温扩增反应,这些反应通常在50-68°C之间进行,比较好反应温度为65°C。2.**快速测序**:由于其高聚合酶活性,BstDNAPolymerase,LargeFragment可以用于快速测序,特别是对于高GC含量的DNA模板或微量(纳克量级)DNA模板的测序。3.**全基因组扩增**:BstDNAPolymerase,LargeFragment也可用于全基因组扩增(WGA),这是一种在不需要热循环仪的情况下扩增整个基因组DNA的技术。4.**高dUTP耐受性**:与BstDNAPolymerase2.0相比,BstDNAPolymerase,LargeFragment在进行等温扩增时不具有将dUTP掺入合成的DNA链的能力,这使得它在某些应用中更具优势。FnCas12a系统的脱靶效应较低,这对于减少非目标效应和提高物质的安全性至关重要。Recombinant Biotinylated Human TPBG/5T4 Protein,His-Avi Tag

在cDNA末端快速扩增(RACE)技术中,Ultra-Long Master Mix 可以用来扩增5'和3'末端的长片段cDNA。Recombinant Biotinylated Human TPBG/5T4 Protein,His-Avi Tag

ExoIII(ExonucleaseIII)和Lambda核酸外切酶(λExonuclease)在DNA末端处理上的主要不同点如下:1.**作用方向**:-**ExoIII**:具有3'→5'外切脱氧核糖核酸酶活性,它从DNA链的3'-OH末端逐步切去单核苷酸。-**Lambda核酸外切酶**:是一种5'→3'核酸外切酶,能选择性地沿5'→3'方向消化5'端磷酸化的双链DNA。2.**底物特异性**:-**ExoIII**:适底物是平末端或5'末端突出的DNA,但也可以作用于双链DNA切刻位点产生单链缺口。由于对单链DNA无活性,因此难以切割3'突出末端。-**Lambda核酸外切酶**:适底物是5'磷酸化的双链DNA,对单链DNA和5'端未磷酸化修饰的DNA的酶切活性较低,不能从DNA的切刻或缺口处起始消化。3.**活性差异**:-**ExoIII**:对具有3'-突出末端(至少有4个碱基,且具有3'-末端C残基)的DNA、单链DNA、硫代磷酸酯连接的核苷酸无活性。-**Lambda核酸外切酶**:对5'-OH端的切割速度比5'-P端慢约20倍;对单链DNA的酶切速度比双链DNA慢约100倍。4.**应用场景**:-**ExoIII**:可以用于生产特定方向的单链DNA,将线性化DNA设计成为一端为不切割末端(3'突出端),另一端则设计为易切割末端(平端或5'突出端)。

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