单细胞转录组测序技术的如火如荼，伴随着空间转录组测序技术的蓬勃发展，可以看到，在现有的高通量检测技术领域，这两种技术已为科学研究的发展提供了前所未有的技术支撑。从2019年单细胞多组学被评为《Nature Methods》年度技术进展，到2020年空间转录组技术也被评为年度技术进展，相信在接下来的时间里，单细胞转录组和空间转录组将为生命科学的发展做出极其重要的贡献。单细胞转录组测序技术的特点在于提供详实的每个细胞的转录表达信息，但是缺失了来源组织的空间组成信息。现有商用空间转录组测序技术的特点在于提供了完整的组织空间位置信息，但是每个捕获spot的信息无法达到单细胞分辨率（10个左右细胞）。因此，这两个技术的存在是天然互补的，而将两者的结合也是水到渠成，完美结合。scRNA-seq 技术的进步启发了利用高分辨率转录组定量分析与空间转录组学数据的互补性质的新方法。湖北欧易生物空间转录组

如果只是通过空间转录组或者单细胞转录组，研究人员在两个样本中均可以发现淋巴细胞相关基因或者淋巴细胞群，无法解释两个样本预后之间的差异。但是通过空间转录组，就能很清晰看到两个样本之间的差异。作者借助空间转录组测序技术探究人类心脏在发育过程中的基因表达特征和细胞图谱变化，发现对于每个发育阶段的不同解剖区域，都有独特的基因表达特征。结合单细胞转录组测序技术，作者进一步确定和丰富了胚胎心脏基因表达的空间注释信息。 山东空间转录组使用该类工具的开发将简化不同类型空间转录组学数据的整合和分析。

广义上来说，目前一共有4种解析“空间性转录组”的策略：2.第一种是利用计算机算法，根据单细胞转录组数据来模拟重构组织的空间形态。例如Seurat，这是一个在单细胞数据分析中***用到的R包，我们可以利用scRNA-seq数据，加上对markegene进行原位测序的结果来重构组织的空间信息。3.第二种，激光显微切割+二代测序（LCM+NGS）。这种技术对仪器和实验人员的操作要求较高，而且获取的通量也比较低，如果组织非常珍贵或者研究的内容十分精细，可以考虑这个。但是这种策略比较难被官方干运用。4.第三种策略，就是基于高分辨图像的原位测序。**经典的是smFISH当然，这种方法的通量比较低。当然随着技术的发现，刚发布的FISH-seq技术通过多轮杂交的方式，已经把测序通量提高到了10000+个转录本。5.***就是“基于空间条形码（spatialbarcodes）的空间转录组技术。本文主要讨论的也就是这种技术。后面主要讨论的都是基于这种策略。

10x Genomics空间转录组的实现原理是什么？10x Genomics空间转录组用于文库构建的每张载玻片上有四个捕获区域，每个捕获区域的大小为6.5x6.5mm，包含5000个被条形码标记的点（barcoded spots），每个点的直径为55 μm，点和点之间中心的距离为100 μm，并且每个点都有一个barcode序列。组织切片的细胞中会释放出mRNA，迁移到每个spot的mRNA会被标记上相应的barcode序列，然后进行文库构建并进行测序。根据数据的条形码信息对数据进行分析，以确定哪些数据来自哪个位置，从而实现空间基因表达的可视化。 尽管当前空间转录组的数据在快速地增长，但尚未有对应的数据库来对这些数据进行汇总集成。

空间转录组研究的的必要性。研究单细胞我们想要探究细胞间的异质性，但是常规的单细胞是将细胞解离成单细胞悬液，然后利用单细胞分离技术（微孔，微板，液滴）等方法实现单细胞建库，这里比较大的问题是是细胞失去了原本在组织的空间信息。然而这个空间信息在实际研究中有很重要。特别是在研究细胞命运机制及细胞谱系发生空间位置的信息显得尤为重要，因此发展空间转录组技术实现细胞的位置信息的保留，对研究此类细胞状态尤为必要。空间转录组组织学板块包括样品的包埋、切片、固定、染色及成像，记录切片的形态学信息。北京生物技术空间转录组

尽管前传时代的空间技术被迅速弃用，但其思想和方法是当今时代空间转录组学发展的基础。湖北欧易生物空间转录组

发达地区已经形成较均衡的产业细分，而我国销售产业细分面临失衡，除医药及医药用品外其他细分产业均尚处开发初期。而我国销售产业占国民生产总值的4%—5%，潜力巨大，市场有待挖掘。如行家预判，服务型发展即将步入黄金时代，众多企业围绕医药产业、商业领域及新兴的互联网医药等领域正在进行厮杀。在我国政策的支持下，在社会资本的推动下以及技术升级的带动下，互联网巨头、科技巨头、地产巨头等企业纷纷跨界进入服务型。监管体系缺失，山东的疫苗事件中，体现出销往24个省市的疫苗各方面监管力度小。制药企业和各大医药机构由不同部门管理，这种分段监管方式存在很大的医药健康漏洞。在未来两三年内，主要科研服务，科研检测，学术研究，技术咨询公司和医药服务提供公司总收入中的2%至3％将来自“服务+”模式。随着业务模式向“平台即服务”和“数据即服务”的转变， “让数据说话”将成为创新的新源泉。湖北欧易生物空间转录组

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