空间转录组数据分析的重要是根据每个芯片上每个spot的基因表达信息进行聚类，然后将spot根据坐标位置序列放回到组织的图像上，同时可以对每个gene在组织上表达的空间位置进行定位。获得测序数据后，首先利用Space Ranger 软件可以自动化的对图像进行处理、数据比对和Barcode处理。另外一个软件Loupe Cell Browser是一个适用于Windows和MacOS的桌面应用程序，它可以快速、轻松地可视化和分析10X Visium数据。欧易生物具有上百例空间转录组项目执行经验，致力通过质量的服务，助力各位科研工作者取得新的突破。转录本的空间位置信息可以通过在原位阵列上捕获的组织切片中的转录本来获取，?如空间转录组技术。广东空间转录组应用

基于原位测序的空间转录组技术。基于原位测序（ISS）的方法通过测序产生空间转录组信息，这种方法只依靠连接酶连接两段DNA—一段已知序列的引物和一个探针与模板匹配，不匹配的探针就会被洗掉。2013年开发的ISS中，每个探针使用一个查询碱基来测序基因条形码。FISSEQ和后来的EXeq使用了SOLiD，每个探针使用两个查询碱基来测序环化和RCA扩增的cDNAs。在STARmap中，基因条形码由SEDAL测序，其中还使用了两个类似固体的查询碱基来避免错误。BARseq还用基因条形码放大了RCA探针。基于ISS技术的优势包括：单细胞分辨率、亚细胞转录物定位和可应用于更大的组织区域。缺点是：检测效率较低。河北应用空间转录组除大脑以外的其他***的技术现代化，将为开发有用的空间转录组学地图集提供广阔的前景。

空间转录组数据分析的是根据每个芯片上每个 spot 的基因表达信息进行聚类，然后将 spot 根据坐标位置序列放回到组织的图像上，同时可以对每个 gene 在组织上表达的空间位置进行定位。获得测序数据后，首先利用 Space Ranger  软件可以自动化的对图像进行处理、数据比对和 Barcode 处理。另外一个软件 Loupe Cell Browser 是一个适用于 Windows 和 MacOS 的桌面应用程序，它可以快速、轻松地可视化和分析10X Visium 数据。欧易生物具有上百例空间转录组项目执行经验，致力通过质量的服务，助力各位科研工作者取得新的突破。

美国脑计划启动的 BICCN 项目，该项目将整合不同类型细胞的分子、解剖学和生理学特性，创建小鼠脑细胞 3D 参考图谱，同时也将基于人类和非人类灵长类脑组织样本，绘制脑细胞参考图谱 ，其涉及空间转录组学技术主要包括 MERFISH 和 seqFISH。一些实现空间转录组学的重要技术，可以追溯到二十世纪七十年代，长期以来，各种形式的原位杂交技术（ISH）已用于可视化空间中的基因表达。从技术原理中不难看出，空间转录组技术重要为特殊的载玻片。空间转录组使得在mRNA样品处理和后续测序过程中位置信息的编码和获取成为可能。

许多当前时代空间转录组技术的基础都是在自七十年代以来的几十年间建立的。例如，于1976 年首先使用紫外线激光来切割组织。当前流行的技术，例如空间转录组学（ST）和 10X Visium 依靠这种微阵列技术，区别就在于是从放置在微阵列载玻片上的组织上而不是从溶液中来捕获转录本信息。当前时代的空间转录组技术大致分为五类方向：激光显微切割（LCM），单分子荧光原位杂交（smFISH），靶向原位测序（ISS），原位阵列捕获和 其他非成像技术。只听名字就想尝试，不清楚空间转录组的原理及通过该技术究竟能拿到什么结果。四川欧易生物空间转录组是什么

除了皮肤、胰腺和骨头组织外，其余样本类型均可开展10x Genomics空间转录组研究。广东空间转录组应用

本文利用空间转录组学研究了在AD小鼠模型中，淀粉样斑块周围直径为100mm的组织域中发生的转录变化。发现了富含髓鞘和少突胶质细胞基因（OLIGs）的基因共表达网络的早期改变，而斑块诱导的基因（PIGs）的多细胞基因共表达网络涉及补体系统、氧化应激、溶酶体和炎症，在疾病的后期非常突出。此外作者通过对小鼠和人脑切片进行原位测序（ISS），证实了大多数观察到的细胞水平的变化。空间转录组学分析为探究AD和其他脑部疾病致病特征附近失调的细胞网络提供了可能。广东空间转录组应用

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