实时荧光定量PCR（Real-time fluorescence quantitative PCR，qPCR）通过在普通 PCR 反应体系中加入了荧光标记探针或荧光染料，利用荧光信号的变化实时检测PCR扩增反应中每一个循环扩增产物变化。通过荧光强度变化监测产物量的变化，从而得到一条荧光扩增曲线图。具有专一性更高、可实时监控、可重复精确定量等优势。qPCR的种类根据qPCR的化学发光原理一般分为2大类：一类是探针法，利用与靶序列特异杂交的探针来指示扩增产物的增加；一类是基于SYBR Green I 的染料法，通过荧光染料来指示产物的增加。qPCR实现了通过Ct值和标准曲线的分析对起始模板进行定量分析。湛江qPCR仪消毒

交联和裂解——稳定复合物并分离核组分:第一步对时间要求严格并且需要优化。体内共价交联稳定蛋白质-DNA相互作用并于特定时间点进行分析。通常采用甲醛交联，加入甘氨酸以终止反应。交联剂渗透到完整细胞中并将蛋白质-DNA复合物锁定在一起从而进行分析。交联剂在整个过程中保持复合物稳定，但其作用必须是可逆的才能用于ChIP。一些非常稳定的蛋白质-DNA相互作用则不需要交联。接下来，使用裂解液透化细胞膜，释放细胞组分，然后蛋白质-DNA复合物变得可溶。去除细胞溶质蛋白以减少背景信号并增加灵敏度。注意：此时可以停止ChIP测定。 经过交联，淬灭和洗涤细胞沉淀后，将裂解物于-80℃储存。华南地区高效qPCR仪使用说明qPCR面对小的差异较弱，dPCR则可识别差异较小的拷贝数。

染色质片段化——DN段化:细胞核材料片段化是获得良好的ChIP 分辨率的关键因素，理想情况下的片段大小在 200 到 800 bp对之间。剪切是难控制的步骤之一。通过超声处理和/或核酸酶/酶促消化可以实现剪切，各有利弊。超声处理需要大量的手动操作时间，但非常适合难以裂解的细胞；酶促消化不需要手动操作，适用于大量样品的处理，但其剪切位点不是随机的。两种方法都需要根据具体细胞系进行优化。注意：此时可以停止ChIP。经过剪切/消化染色质后，可以将样品于-80°C储存。避免反复冻融。

免疫沉淀——捕获并分离蛋白质-DNA复合物使用抗体捕获蛋白质-DNA复合物中的目标蛋白质是实验成功的关键因素。抗体免疫沉淀并从细胞核组分中分离蛋白质，去除不相关的细胞物质。使用抗体结合磁珠完成所得抗体-蛋白质-DNA复合物的纯化。经过孵育后，充分洗涤磁珠-抗体-蛋白质-DNA复合物，纯化并洗脱蛋白质-DNA复合物。制备DNA——解交联和DNA纯化:现在含有目标蛋白质的染色质片段已分离，需要解交联并纯化DNA。解交联通常采用高热孵育和/或消化来完成。注意：此时可以停止ChIP。经过解交联和/或DNA纯化后，可以将样品于-20°C储存。Taqman探针法因特异性高，被广泛应用于等位基因鉴别、SNP分型、病原体和病毒检测、多重定量等。

常规PCR中，PCR产物通过凝胶电泳，然后进行成像分析，常规PCR只能通过终点法对扩增产物进行定性分析，而不能进行定量分析；荧光定量PCR中，PCR反应体系中加入了荧光分子，通过荧光信号的变化来反应扩增产物的变化，使PCR产物的实时检测成为可能。相对常规PCR而言，荧光定量PCR的主要优点是准确地确定初始模版拷贝数和较高的检测灵敏度；荧光定量PCR不仅可用于定性，如判断一段序列的有无，也可用于定量，如确定起始模版的拷贝数；常规PCR的定量方法，测定的都是PCR的终产物，而不是起始DNA拷贝数。而从图中可以看出，虽然相同模版在同一台PCR仪上进行96次扩增，终点处检测产物量不恒定，但96次PCR扩增曲线都有一个共同的拐点，即荧光定量PCR中Ct值的重现性，恒定的Ct值为荧光定量PCR的分析提供了理论依据。q225 加样孔板侧壁和金属热块能够严密贴合，使液体样品迅速达到设定温度，从而减少实验时间。湛江qPCR仪消毒

qpcr在扩增每个循环中模板DNA通过变性、复性、延伸三个阶段形成更多的子代DNA，为下一个循环提供模板DNA。湛江qPCR仪消毒

实时荧光定量PCR所使用的荧光物质可分为两种：荧光探针和荧光染料。现将其原理简述如下：1. TaqMan荧光探针：PCR扩增时在加入一对引物的同时加入一个特异性的荧光探针，该探针为一寡核苷酸，两端分别标记一个报告荧光基团和一个淬灭荧光基团。探针完整时，报告基团发射的荧光信号被淬灭基团吸收；PCR扩增时，Taq酶的5'－3'外切酶活性将探针酶切降解，使报告荧光基团和淬灭荧光基团分离，从而荧光监测系统可接收到荧光信号，即每扩增一条DNA链，就有一个荧光分子形成，实现了荧光信号的累积与PCR产物形成完全同步。2. SYBR荧光染料：在PCR反应体系中，加入过量SYBR荧光染料，SYBR荧光染料非特异性地掺入DNA双链后，发射荧光信号，而不掺入链中的SYBR染料分子不会发射任何荧光信号，从而保证荧光信号的增加与PCR产物的增加完全同步。SYBR与双链DNA进行结合，因此可以通过溶解曲线，确定PCR反应是否特异。3.分子信标：是一种在5和3末端自身形成一个8个碱基左右的发夹结构的茎环双标记寡核苷酸探针，两端的核酸序列互补配对，导致荧光基团与淬灭基团紧紧靠近，不会产生荧光。PCR产物生成后，退火过程中，分子信标中间部分与特定DNA序列配对，荧光基因与淬灭基因分离产生荧光。湛江qPCR仪消毒

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