负对照有信号引物设计不够优化:应避免引物二聚体和发夹结构的出现。引物浓度不佳:适当降低引物的浓度,并注意上下游引物的浓度配比。镁离子浓度过高:适当降低镁离子浓度,或选择更合适的mix试剂盒。模板有基因组的污染:RNA提取过程中避免基因组DNA的引入,或通过引物设计避免非特异扩增。扩增效率低反应试剂中部分成分特别是荧光染料降解。反应条件不够优化:可适当降低退火温度或改为三步扩增法。反应体系中有PCR反应抑制物:一般是加入模板时所引入,应先把模板适度稀释,再加入反应体系中,减少抑制物的影响。SYBRGreen法qPCR机构哪家靠谱?河南相对定量qPCR服务Real-time PCR 中引物设计的好...
实时荧 光 定 量 PCR 的 扩 增 曲 线可 由 4 个 时 期 进 行 描 述,即基线期、指数增长期、线性增长期与平台期。在基线期 部分,强背景信号掩盖了微弱的荧光信号,故此时期无法对模 板的起始量进行分析。反应进入平台期,反应管内的 dNTP、 酶等被耗尽,反应环境已不适合 PCR 反应的进 行,此 时 的 PCR 产物不再增加,荧光信号达到水平状态,且同一模板的 多次技术重复的扩增曲线在该时期重复性差、可变性高,故 在这一时期同样不适合进行模板初始量的分析。在线性增 长期,虽然 PCR 反应仍在进行,但产物已不再呈指数形式增 ...
切断探针后 , FAM 与 TAM RA 分离 ,荧 光信号得到释放。这时荧光探测系统就能检测到光 密度有所增加。模板每复制 1 次, 就有 1 个探针被 切断 ,并有 1 个荧光信号被释放。由于理论上被释 放的荧光基团数和 PCR 产物数是一对一的关系 ,且 光密度同被释放的荧光基团数也呈正比关系 ,因此 该技术可对模板进行准确定量。但 T aqM an 也存 在一定不足 ,主要表现在:①由于采用荧光和淬灭基 团双末端标记,因此淬灭难以彻底,本底较高。 ②报 告基团的水解利用的是 Taq 酶的 5' ※3' 外切活性, 因此定量时容易受酶活性影响。 ③探针标记成本较 高 ,不便普及应用。Ta...
耐药基因表达的研究:目前研究中发现主要的 耐药机制有:ATP结合盒基因超家族的膜转运蛋白介导 的耐药,这些蛋白包括:MDR-1基因编码的P-糖蛋白, 多药耐药相关蛋白,肺耐药相关蛋白,乳腺耐药蛋 白等;酶介导的耐药,包括拓扑导构酶,谷胱甘肽及谷 胱甘肽-S-转移酶,蛋白激酶C,脱氧胞嘧啶核苷激酶等, 凋亡基因介导的耐药,如bcl-2家族,p53基因,c-myc 等。多药耐药是多因素,多种机制共同作用的结果。 real-time反转录 PCR是了解耐药指导临床策 略的有用手段,它能观测用药前后及复发时细胞的 耐药基因mRNA表达变化...
实时荧光定量 PCR 技术的分类:荧光探针法:水解探针法。水解探针的结构特点是寡核苷酸序列 的 5′端为荧光报告基团,3′端 为 荧 光 淬 灭 基 团。PCR 扩 增 前,探针游离于靶序列外,报告基团发出的荧光被淬灭基团 吸收,检测不到荧光,但有时会因淬灭不彻底,会检测到微 弱的荧光。在 PCR 退火时,探针特异性地结合到靶序列上, 在延伸阶段,利用 Taq 酶 5′-3′外切酶的活性将探针水解, 荧光报告基团与荧光淬灭基团分离,荧光信号被释放,并与 PCR 产物的数量成正相关。由于水解探针的作用机理依赖 于 Taq 酶 5′-3′外切酶的...
x - 轴表示 PCR 循环数, y - 轴表示扩增 反应的荧光值 ,与反应管中扩增产物的量有比例关 系。扩增曲线有指数增长期和非指数平台期 2 个阶 段。在指数增长阶段,每个循环 PCR 产物量大约增 加一倍。然而随着反应的进行, 反应体系组成成分 的消耗,反应进入平台期。只有在荧光信号扩增期 PCR 产物量的对数值 与起始模板量之间存在线性关系 , 可以在指数期的 某一点上来检测 PCR 产物的量,并由此推断模板初始的含量。设定一定的荧光信号的域值 (thresh - old)。如果检测到荧光信号超过域值, 就被认为是 真正的信号 ,它可用于定义样本的域值循环数 Ct (C 表示循环 cy...
实时荧光定量 PCR 的数据分析 在指数增长期,PCR 产物量以指数形式增加,根据这一 原 则,假设扩增效率为 E,模 板 起 始 量 为 N0,m 个 循 环 后 PCR 产物量为 Nm,则有 Nm=N0(1+E)m(1),对 该 等 式 两边 取 对数,则有 LgN0=-m·lg(1+E)+Lg Nm(2),若循环数达到某一 CT 值时,荧光阈值为 Q,式(1)可写成:Q=N0(1+E)CT,式(2) 可 写 成 :LgN0=-CT·lg (1 +E) +LgQ。 当 需 要 对 靶 基 因 在 mRNA 水平上进行表达量分析时,通 常 采 用...
Absolute Quantification 标准曲线的各 项指标:斜率、扩增效率(E)、相关系数(R2 )、间距均需进行 严格评价,从而确保该曲线的可用性。各点间距应相等,间 距以及斜率的Absolute 值应满足 3.100~3.582,相关系数 R2>0.99, 扩增效率(E)在 90%~110%之间。扩增效率、斜率以及间距 三者相互关联,扩增效率(E)=10(-1/斜 率 ) -1,斜率的Absolute值恰 是各点之间的平均间距。当扩增效率<90%时,间距以及 斜 率的Absolute 值会>3.582;当扩增效率>110%...