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南京微量数字PCR原理

来源: 发布时间:2023-03-18

引物的设计对于这个实验至关重要,因为Real-time PCR的检测灵敏度比较高,所以相应的对引物设计的要求就很高。普通的要求规则大家都知道,还有几点必须注意:1,引物的错配率(引物错配形成引物二聚体,但是SYBR照样能嵌入进去,结果导致实验结果的误差很大,重复性也不好)。2,引物的特异性一定要高(不像常规PCR,引物同源性不高,只要两条产物的片段长度相差足够大,在电泳的时候能够区分开就可以。Real-time PCR只有在熔解曲线的时候能分开,所以这就造成整个实验结果误差很大,不可信)。实时荧光定量PCR技术有效地解决了传统定量只能终点检测的局限。南京微量数字PCR原理

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Real-time PCR实验常用的RNA酶抑制剂:1.焦磷酸二乙酯(DEPC):是一种强烈但不彻底的RNA酶抑制剂。它通过和RNA酶的活性基团组氨酸的咪唑环结合使蛋白质变性,从而抑制酶的活性。2.异硫氰酸胍:目前被认为是较有效的RNA酶抑制剂,它在裂解组织的同时也使RNA酶失活。它既可破坏细胞结构使核酸从蛋白中解离出来,又对RNA酶有强烈的变性作用。3.氧钒核糖核苷复合物:由氧化钒离子和核苷形成的复合物,它和RNA酶结合形成过渡态类物质,几乎能完全抑制RNA酶的活性。4.RNA酶的蛋白抑制剂(RNasin):从大鼠肝或人胎盘中提取得来的酸性糖蛋白。RNasin是RNA酶的一种非竞争性抑制剂,可以和多种RNA酶结合,使其失活。5.其它:SDS、尿素、硅藻土等对RNA酶也有一定抑制作用。深圳特殊样本定量PCR聚合酶链式反应的模板的取材主要依据PCR的扩增对象,可以是病原体标本如病毒、细菌、菌类等。

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Real-time PCR相对定量中的标准曲线法如何进行:主要是相对定量标准品的制作,一般有三种方法:1、比较复杂的方法:质粒,采用Biotnt提供内参基因的特异性Real-time PCRmRNA引物,对目的基因进行Real-time PCR实验,得到PCR扩增产物;PCR扩增产物转入质粒中,得到相对定量的标准品;2、一般采用的方法1:比较强的CDNA模板,3、一般采用的方法:PCR扩增产物,如果在方法2中找不到比较强的CDNA模板,则选用PCR产物作为相对定量的标准品也是可以的;需要注意的事项是:PCR产物浓度很高,而Real-time PCR的产物片段比较短,容易在稀释的过程中造成PCR污染,要注意操作。

聚合酶链式反应的试验污染:阳性对照,在建立PCR反应实验室及一般的检验单位都应设有PCR阳性对照,它是PCR反应是否成功、产物条带位置及大小是否合乎理论要求的一个重要的参考标志。阳性对照要选择扩增度中等、重复性好,经各种鉴定是该产物的标本,如以重组质粒为阳性对照,其含量宜低不宜高(100个拷贝以下)。但阳性对照尤其是重组质粒及高浓度阳性标本,其对检测或扩增样品污染的可能性很大。因而当某一PCR试剂经自己使用稳定。实时荧光定量PCR(QuantitativeReal-time PCR)是一种在DNA扩增反应中。

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Real-time PCR链反应的常见问题分析与解决方法:反应缓冲液未完全融化或未充分混匀。确保反应缓冲液融化完全并彻底混匀。引物特异性差。利用BLAST检查引物特异性或重新设计引物。引物量过多。减少反应体系中引物的用量。模板量过多。质粒DNA的用量应<50ng,而基因组DNA则应<200ng。外源DNA污染。确保操作的洁净。阴性对照出现条带:试剂,头,工作台污染。使用全新的试剂和头,对工作台进行清洁。条带大小与理论不符:污染。使用全新的试剂和头,对工作台进行清洁。模板或引物使用错误。更换引物和模板?;蜓切?。对研究的基因进行序列分析和BLAST研究。逆转录-聚合酶链反应较广用于表达谱,以确定基因的表达或鉴定RNA转录物的序列。热启动聚合酶链式反应:一种在PCR的初始建立阶段减少非特异性扩增的技术。徐州组织RT-PCR检测技术设计公司

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Real-time PCR链式反应的特点:灵敏度高:PCR产物的生成量是以指数方式增加的,能将皮克(pg=10-12)量级的起始待测模板扩增到微克(μg=-6)水平。能从100万个细胞中检出一个靶细胞;在病毒的检测中,PCR的灵敏度可达3个RFU(空斑形成单位);在细菌学中很小检出率为3个细菌。简便、快速:PCR反应用耐高温的TaqDNA聚合酶,一次性地将反应液加好后,即在DNA扩增液和水浴锅上进行变性-退火-延伸反应,一般在2~4小时完成扩增反应。扩增产物一般用电泳分析,不一定要用同位素,无放射性污染、易推广。纯度要求低:不需要分离病毒或细菌及培养细胞,DNA粗制品及RNA均可作为扩增模板??芍苯佑昧俅脖瓯救缪?、体腔液、洗嗽液、毛发、细胞、活组织等DNA扩增检测。武汉微量Real-time PCR供应商聚合酶链反应的试剂应分配到一次性的等分试样中。南京微量数字PCR原理

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