PCR的反应条件:Tm=4(G+c)+(A+T),一般在45~55度,温度低容易退火但特异性低;温度高,不容易退火但特异性高。退火时间30秒。延伸温度一般在70~75度这时TaqDNA聚合酶活性很高(150个/S),当引物在16个碱基以下时可采用缓慢升高温度到70~75度的方法,使在低温下就开始合成。一般<1KB时间1分钟即可。当〈1KB时在较后的循环中延长扩增时间。循环次数25~30次。无产物时:取10ul扩增混合液作模板在进行PCR扩增;增加TaqDNA聚合酶浓度;增加循环次数;降低退火温度;加靶DNA量。电子聚合酶链反应用于计算理论聚合酶链反应结果。南通组织荧光PCR研究方案
聚合酶链反应的一个主要限制是,为了产生允许其选择性扩增的引物,需要关于目标序列的先前信息。这意味着,通常情况下,PCR用户必须知道两个单链模板中每个模板上目标区域上游的精确序列,以确保DNA聚合酶正确结合引物-模板杂交体,并随后在DNA合成过程中产生整个目标区域。像所有酶一样,DNA聚合酶也容易出错,这反过来会导致产生的PCR片段发生突变。PCR的另一个限制是,即使是很少量的污染DNA也可以被扩增,导致误导或模糊的结果。为了很大限度地减少污染的可能性,调查人员应该为试剂制备、聚合酶链反应和产品分析预留单独的房间。试剂应分配到一次性的等分试样中。应经常使用带有一次性柱塞和超长移液器吸头的移液器。南通组织荧光PCR研究方案聚合酶链式反应的特异性依赖于与靶序列两端互补的寡核苷酸引物。
聚合酶链式反应准备:10×扩增缓冲液、4种dNTP混合物(终浓度)、引物(终浓度)、模板DNA、Taq DNA聚合酶、Mg2+(终浓度)、补加双蒸水等。其中dNTP、引物、模板DNA、Taq DNA聚合酶以及Mg2+的加量(或浓度)可根据实验调整,以上表格只提供大致参考值。PCR反应五要素:参加PCR反应的物质主要有五种即:引物(PCR引物为DN段,细胞内DNA复制的引物为一段RNA链)、酶、dNTP、模板和缓冲液(其中需要Mg2+)。引物有多种设计方法,由PCR在实验中的目的决定,但基本原则相同。
聚合酶链反应的常见问题分析与解决方法:反应缓冲液未完全融化或未充分混匀。确保反应缓冲液融化完全并彻底混匀。引物特异性差。利用BLAST检查引物特异性或重新设计引物。引物量过多。减少反应体系中引物的用量。模板量过多。质粒DNA的用量应<50ng,而基因组DNA则应<200ng。外源DNA污染。确保操作的洁净。阴性对照出现条带:试剂,头,工作台污染。使用全新的试剂和头,对工作台进行清洁。条带大小与理论不符:污染。使用全新的试剂和头,对工作台进行清洁。模板或引物使用错误。更换引物和模板。基因亚型。对研究的基因进行序列分析和BLAST研究。聚合酶链式反应PCR技术的基本原理类似于DNA的天然复制过程。
聚合酶链反应有许多优点。它很容易理解和使用,并迅速产生结果。这项技术非常敏感,有可能产生数百万到数十亿份特定产品的拷贝,用于测序、克隆和分析。qRT-PCR具有与PCR相同的优点,同时还具有定量合成产物的优点。因此,它可以用于分析病症、微生物或其他疾病状态中基因表达水平的变化。聚合酶链反应是一种非常强大和实用的研究工具。许多疾病的未知病因的测序正在通过聚合酶链反应得到解决。这项技术可以帮助我们识别与已知病毒相关的未知病毒序列,从而让我们更好地了解疾病本身。如果该过程可以进一步简化,并且可以开发灵敏的非辐射检测系统,PCR将在未来几年在临床实验室中占据明显地位。逆转录聚合酶链反应(逆转录-聚合酶链反应):用于从RNA中扩增DNA。苏州血液荧光定量PCR供应商
聚合酶链式反应可看作是生物体外的特殊DNA复制。南通组织荧光PCR研究方案
聚合酶链式反应的常见问题:Mg2+浓度:Mg2+离子浓度对PCR扩增效率影响很大,浓度过高可降低PCR扩增的特 异性,浓度过低则影响PCR扩增产量甚至使PCR扩增失败而不出扩增条带。反应体积的改变:通常进行PCR扩增采用的体积为20ul、30ul、50ul。或100ul,应用多 大体积进行PCR扩增,是根据科研和临床检测不同目的而设定,在做小体积如20ul 后,再做大体积时,一定要模索条件,否则容易失败。物理原因:变性对PCR扩增来说相当重要,如变性温度低,变性时间短,极有可能出现假阴性;退火温度过低,可致非特异性扩增而降低特异性扩增效率退火温度过高影响引物与模板的结合而降低PCR扩增效率。有时还有必要用标准的温度计,检测一下扩增仪或水溶锅内的变性、退火和延伸温度,这也是PCR失败的原因之一。南通组织荧光PCR研究方案