在用户程序执行阶段，PLC始终按从上到下的顺序扫描用户程序（梯形图）。扫描每一个梯形图时，总是先扫描由梯形图左侧触点组成的控制电路，由触点组成的控制电路先按左、右、上、下顺序逻辑操作。然后，根据逻辑运算的结果，对逻辑线圈在系统RAM存储区的相应位置进行刷新。状态；或刷新I/O图像区域中输出线圈的相应位置；或确定是否执行梯形图中指定的特殊功能指令。 也就是说，在用户程序执行过程中，只有I/O图像区输入点的状态和数据不会改变，而I/O图像区或系统RAM存储区的其他输出点和软设备的状态和数据可能会改变，上面的梯形图将低于程序的执行结果。使用这些线圈或数据工作的梯形图；相反，下面梯形图中刷新的逻辑线圈的状态或数据只能用于下一个扫描周期中梯形图顶部的程序。如果在程序执行期间使用即时I/O指令，则可以直接访问I/O点。即使使用I/O指令，输入过程图像寄存器值也不会更新。程序直接从I/O模块获取值，输出过程图像寄存器将立即更新，这与直接输入不同。

在输出刷新阶段，扫描用户程序完成后，PLC进入输出刷新阶段。在此期间，CPU根据I/O图像区域中的相应状态和数据刷新所有输出锁存电路，然后通过输出电路驱动相应的外设备。此时，它是PLC的实际输出。