免疫共沉淀（Co-Immunoprecipitation，Co-IP）的局限性主要包括：可能检测不到低亲和力和瞬间的相互作用：低亲和力和瞬间的蛋白质-蛋白质之间的相互作用可能检测不到，这可能导致某些重要的相互作用被遗漏。不能确保直接相互作用：免疫共沉淀不能保证沉淀的蛋白复合物是由直接相互作用的两种蛋白组成。两种蛋白质的结合可能不是直接结合，而可能有第三者在中间起桥梁作用。灵敏度限制：免疫共沉淀的灵敏度不如某些其他技术，如亲和色谱，这可能影响到对低丰度蛋白或微弱相互作用的研究。样本纯度要求高：如果将蛋白复合物直接进行质谱分析，需要得到较高纯度和浓度的蛋白复合物样品，这并非易事，并且成本较高。对抗体要求高：用于免疫共沉淀的抗体不是总是与操作相合适，与Western blotting或者 ELISA相比容易出现假阳性反应。免疫共沉淀法可信度高，可发现新蛋白搭档，但存局限，需结合其他方法验证。湖北免疫共沉淀CoIP
免疫共沉淀CoIP实验，细胞的收集及裂解方法如下：
收集2E7个细胞样品，加入PBS洗涤细胞，离心后弃上清收集细胞沉淀。
准备500μl预冷的CellLysisBuffer,分别加入5μlProteaseInhibitor、5μlPMSF，混匀后加进细胞沉淀中吹打均匀，冰上孵育30min，期间涡旋混匀几次。
4℃,12000rpm离心10min，取上清，进行蛋白浓度测定及后续实验。广州基云生物，在IP互作组检测和关键机制分子筛选验证领域，具有丰富的经验，助力您的互作机制研究，欢迎垂询合作。 北京互作机制CoIP-MS检测蛋白质与蛋白质分子互作实验方法介绍。
Co-IP（免疫共沉淀）实验操作的要点。1.细胞裂解：确保采用温和的裂解条件，以保持细胞内存在的蛋白间相互作用。使用非变性裂解液进行裂解和洗涤。2.抗体固定：选择经过验证的抗体，以减少假阳性结果。注意抗体与缓冲液的比例，避免抗体稀释过度或过多。3.抗体结合：将抗体与样品混合，确保抗体与目标蛋白充分结合。4.磁珠或琼脂糖添加：将抗体固定的磁珠或琼脂糖加入混合物中，使其与抗体-蛋白复合物结合。5.沉淀：通过磁珠或琼脂糖的沉降，分离出蛋白复合物。6.洗脱：使用洗脱缓冲液将蛋白质复合物从磁珠或琼脂糖上洗脱下来。7.增加洗脱之前的洗涤次数或在免疫共沉淀缓冲液中加入Triton X-100，以降低非特异性结合。遵循这些操作要点，可以确保Co-IP实验的准确性和可靠性，从而得到准确的蛋白质相互作用结果。
CoIP-Mass和CoIP-WB检测要点：
互作蛋白筛选和验证：数据分析以非标定量信号强度（LFQintensity和FC>10）作为强阳筛选，以文献查阅，功能匹配，批量CoIP-WB验证，提高验证成功率。理想CoIP-MS结果的蛋白定量都到超过1000种蛋白。其中绝大部分蛋白为非特异结合或背景蛋白。以目的蛋白的富集信号强度和差异倍数作为参考（相对强信号和差异），分析实验组中明显定量较高且差异较大的蛋白，作为重要候选蛋白。同时对重要候选蛋白进行STRING互作分析，文献分析，目的蛋白功能匹配分析，选择Top的4-5个蛋白进行CoIP-WB验证，提高CoIP-WB成功率。 Co-IP外源检测引入外源蛋白验证互作，敏感度高但需严控条件，结合内源检测更准确！
Co-IP实验原理主要基于抗原-抗体特异性结合以及蛋白质-蛋白质相互作用。具体来说，当细胞在非变性条件下被裂解时，细胞内存在的许多蛋白质-蛋白质间的相互作用会被保留下来。实验中，利用靶蛋白的特异性抗体与靶蛋白结合形成复合物，然后通过免疫反应将复合物与固定在固相支持物（如琼脂糖珠或磁珠）上的亲和剂（如Protein A/G）结合。经过一系列的洗涤步骤后，可以去除非特异性结合的蛋白质，将目标蛋白质及其相互作用的蛋白质富集在固相支持物上。通过电泳、质谱分析等技术对富集的蛋白质进行分析，从而鉴定和定量相互作用的蛋白质。Co-IP（免疫共沉淀）技术应用场景。天津互作机制CoIP-MS
Co-IP技术广泛应用于生物医学、药物研发、蛋白质组学等领域，助力科研人员探索生命奥秘！湖北免疫共沉淀CoIP
免疫共沉淀（Co-Immunoprecipitation）是以抗体和抗原之间的专一性作用为基础的用于研究蛋白质相互作用的经典方法。是确定两种蛋白质在完整细胞内生理性相互作用的有效方法。当细胞在非变性条件下被裂解时，完整细胞内存在的许多蛋白质－蛋白质间的相互作用被保留了下来。当用预先固化在agarose beads上的蛋白质A的抗体免疫沉淀A蛋白，那么与A蛋白在体内结合的蛋白质B也能一起沉淀下来。再通过蛋白变性分离，对B蛋白进行检测，进而证明两者间的相互作用。这种方法得到的目的蛋白是在细胞内与兴趣蛋白天然结合的，符合体内实际情况，得到的结果可信度高。这种方法常用于测定两种目标蛋白质是否在体内结合；也可用于确定一种特定蛋白质的新的作用搭档。湖北免疫共沉淀CoIP