免疫共沉淀（Co-Immunoprecipitation，Co-IP）是一种在生物药物领域广泛应用的技术，主要用于研究蛋白质之间的相互作用。该技术通过利用特异性抗体将目标蛋白与其相互作用的蛋白一同沉淀下来，从而揭示蛋白质间的相互作用关系。在蛋白泛素化研究方面，Co-IP技术也发挥着重要作用。通过该技术，研究人员可以鉴定并验证与泛素连接酶和泛素受体相互作用的蛋白质，进一步揭示泛素化修饰的调控机制。同时，结合质谱分析，Co-IP技术还可以鉴定泛素化修饰的靶标蛋白质及其相互作用蛋白质，揭示泛素化修饰在细胞信号传导、代谢调控等生命过程中的功能和调控网络。Co-IP（免疫共沉淀）技术应用场景。广西蛋白蛋白互作检测CoIP-MS检测
CoIP实验免疫沉淀方法如下：
将25μL(0.25mg)的Pierce蛋白A/G的磁珠加入1.5mL离心管中。
向磁珠中加入175μL免疫沉淀裂解/漂洗缓冲液，轻微涡旋混匀。
将离心管放入磁力架中收集磁珠到离心管的一边。去除上清。
向离心管中加入1mL免疫沉淀裂解/漂洗缓冲液。颠倒离心管数次或轻微涡旋混匀1min。用磁力架收集磁珠。去除上清。
将抗原样品/抗体混合物加入盛有磁珠的离心管中，保持混匀室温下孵育1h。
用磁力架收集磁珠，除去未结合的样品，保存以备分析。
向离心管中加入500μL免疫沉淀裂解/漂洗缓冲液，轻柔混匀。收集磁珠，弃上清。再重复洗两次。
向管中加入500μL超纯水，轻柔混匀。用磁力架收集磁珠，弃上清。
低pH洗脱：向离心管中加入100μL洗脱液。保持混匀在室温下孵育离心管10min。通过磁力分离磁珠，保留含有目的抗原的上清。每100μL洗出液中加入10μL中和液来中和低pH。备选洗脱方法：向离心管中加入100μL1X电泳上样缓冲液，将样品置于加热器中，96-100℃加热10min。通过磁力架分离磁珠，保留含有目的抗原的上清。
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Co-IP（免疫共沉淀）和ChIP（染色质免疫沉淀）是两种常用于研究蛋白质与DNA或蛋白质与蛋白质相互作用的实验方法。实验原理方面的区别：Co-IP利用抗体与抗原之间的特异性结合，将目标蛋白及其与之相互作用的蛋白一起拉下来，进而研究它们之间的相互作用。而ChIP则是在活细胞状态下固定蛋白质-DNA复合物，并通过超声或酶处理将其随机切断为一定长度范围内的染色质小片段，然后通过抗原抗体的特异性识别反应沉淀此复合体，特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段。
Co-IP技术作为研究蛋白质相互作用的重要手段，其结果在多数情况下是可靠的。然而，该技术也存在一些潜在的限制和影响因素，需要研究人员予以注意。在实际应用中，由于细胞内蛋白质种类繁多且相互作用复杂，可能会出现非特异性结合或背景噪声，这要求研究者选择特异性强的抗体，并通过洗涤步骤去除杂质。此外，样品的纯度、抗体的质量和实验条件等也会对结果产生影响，因此，对抗体的选择和验证、样品的准备以及实验条件的控制都至关重要。为了进一步提高结果的准确性，研究人员通常会结合多种方法进行相互验证，如使用不同抗体或实验条件重复实验，或结合质谱技术来验证Co-IP的结果。这些措施共同增强了Co-IP技术结果的可靠性。免疫共沉淀强大但局限，需谨慎分析数据，避免冒险性。
CoIP-Mass是一种检测细胞内蛋白互作组的套餐技术。该技术通过联合免疫共沉淀技术和质谱检测技术，对目的蛋白在特定细胞/组织内的互作蛋白，进行系统的检测和分析。该技术适用于目的蛋白在特定细胞/组织中的蛋白互作组数据检测，或用于不同遗传背景/实验条件下的互作组差异研究。因此，该技术是研究细胞内蛋白互作调控网络的常规前置技术。CoIP-WB是一种检测细胞内蛋白互作的验证技术。该技术通过联合免疫共沉淀技术和WesternBlot蛋白检测技术，对目的蛋白在特定细胞/组织内的互作关系进行探究，明确蛋白直接的相互作用关系。该技术适用于目的蛋白在特定细胞/组织中的蛋白互作检测验证，或用于不同遗传背景/实验条件下的互作差异研究。因此，该技术是研究细胞内蛋白互作调控网络的常规检测技术。在CoIP（免疫共沉淀）实验对照组的设计。山西免疫沉淀CoIP-mass spectrometry检测
Co-IP实验要点：温和裂解、验证抗体、充分结合、沉降分离、洗脱纯化，确保结果准确可靠！广西蛋白蛋白互作检测CoIP-MS检测
结合了抗体的磁珠或树脂（Beads）与样本裂解液孵育，通过”抗原-抗体“之间的免疫作用，诱饵蛋白被吸附在Beads上，与此同时，诱饵蛋白的互作蛋白，也一起“共沉淀”到Beads上。洗涤去掉未结合的蛋白后，再用洗脱缓冲液将互作蛋白复合物从Beads上洗脱下来，得到免疫共沉淀（Co-IP）产物。Co-IP产物既可以用WesternBlot检测已知蛋白，也可以用质谱鉴定未知蛋白。当没有合适的诱饵蛋白抗体时，还可以通过表达融合了Flag标签的诱饵蛋白，利用Flag标签抗体做免疫沉淀。即样本过表达Flag-Bait，经裂解后与anti-Flag珠子孵育，诱饵融合蛋白与Beads结合，其互作蛋白“共沉淀”到Beads上，再经洗涤、洗脱后，用WB或质谱检测。广西蛋白蛋白互作检测CoIP-MS检测