免疫共沉淀（Co-Immunoprecipitation，Co-IP）的局限性主要包括：可能检测不到低亲和力和瞬间的相互作用：低亲和力和瞬间的蛋白质-蛋白质之间的相互作用可能检测不到，这可能导致某些重要的相互作用被遗漏。不能确保直接相互作用：免疫共沉淀不能保证沉淀的蛋白复合物是由直接相互作用的两种蛋白组成。两种蛋白质的结合可能不是直接结合，而可能有第三者在中间起桥梁作用。灵敏度限制：免疫共沉淀的灵敏度不如某些其他技术，如亲和色谱，这可能影响到对低丰度蛋白或微弱相互作用的研究。样本纯度要求高：如果将蛋白复合物直接进行质谱分析，需要得到较高纯度和浓度的蛋白复合物样品，这并非易事，并且成本较高。对抗体要求高：用于免疫共沉淀的抗体不是总是与操作相合适，与Western blotting或者 ELISA相比容易出现假阳性反应。IP-Mass技术结合免疫沉淀与质谱分析，研究蛋白互作与差异，助力生物医学研究！河北相互作用蛋白检测CoIP-mass spectrometry检测
免疫共沉淀（Co-Immunoprecipitation，Co-IP）是一种经典的用于研究蛋白质相互作用的方法，它基于抗体和抗原之间的专一性作用。该技术主要用于确定两种蛋白质在完整细胞内的生理性相互作用。基本原理：当细胞在非变性条件下被裂解时，细胞内蛋白质-蛋白质间的相互作用被保留下来。通过利用预先固化在agarose beads上的蛋白质A的抗体来免疫沉淀A蛋白，与A蛋白在体内结合的蛋白质B也能一起沉淀下来。随后，通过蛋白变性分离，可以对B蛋白进行检测，从而证明两者之间的相互作用。重庆CoIP-mass spectrometry检测IP-Mass技术是一种结合了免疫沉淀和质谱分析的方法。
免疫共沉淀实验步骤主要包括以下五个部分：样品处理：将细胞或组织样品进行裂解，得到待检测的蛋白质混合物，并加入蛋白酶抑制剂以避免目标蛋白被降解。抗体处理：将专一的抗体连接到亲和树脂上，如蛋白A的亲和树脂或蛋白G的亲和树脂，或将蛋白与其特异性抗体结合，新形成的复合物与封闭剂缓慢摇摆在二氧化硅珠上，使碘酸钙交联后节制反应。免疫共沉淀：将有抗体树脂的样品与吸附抗体树脂形成免疫复合物。洗涤：采用洗涤缓冲液对样品进行洗涤，以去除非特异性的蛋白质和杂质，同时尽量避免对复合物的影响。洗涤缓冲液选择对样品不会引起较大影响的缓冲液和洗涤剂。蛋白鉴定：将沉淀的复合物通过SDS-PAGE分离出来，并进行Western blotting检测目标蛋白及其配偶蛋白。另一方面，也可以直接使用质谱分析检测。
CoIP-Mass和CoIP-WB检测要点：
互作蛋白筛选和验证：数据分析以非标定量信号强度（LFQintensity和FC>10）作为强阳筛选，以文献查阅，功能匹配，批量CoIP-WB验证，提高验证成功率。理想CoIP-MS结果的蛋白定量都到超过1000种蛋白。其中绝大部分蛋白为非特异结合或背景蛋白。以目的蛋白的富集信号强度和差异倍数作为参考（相对强信号和差异），分析实验组中明显定量较高且差异较大的蛋白，作为重要候选蛋白。同时对重要候选蛋白进行STRING互作分析，文献分析，目的蛋白功能匹配分析，选择Top的4-5个蛋白进行CoIP-WB验证，提高CoIP-WB成功率。 Co-IP实验要点：样品新鲜、抗体特异、偶联充分、洗涤彻底，确保结果准确可靠！
IP-WB（免疫沉淀-Western Blot）实验流程主要包括以下步骤：样品制备：收集细胞或组织样品，进行适当的裂解处理，以释放细胞内的蛋白质。免疫沉淀：将特异性抗体与目标蛋白结合，形成抗原-抗体复合物。随后，将复合物与固相载体（如磁珠）结合，通过洗涤去除非特异性结合的杂质。电泳分离：将免疫沉淀得到的蛋白质复合物进行SDS-PAGE凝胶电泳，根据分子量大小将蛋白质分离成不同的条带。转膜：将凝胶上的蛋白质转移到固相膜上，以便进行后续的Western Blot检测。Western Blot检测：利用特异性抗体检测目标蛋白或其相互作用伙伴的存在。通过显色反应可视化目标蛋白，观察并记录结果。以上步骤完成后，可以对Western Blot结果进行分析，从而验证蛋白质之间的相互作用情况。CoIP实验内源检测与外源检测的优缺点。内蒙古免疫共沉淀检测CoIP-WB
Co-IP技术直接、特异、灵敏，是研究蛋白质相互作用的有力工具，揭示生命奥秘！河北相互作用蛋白检测CoIP-mass spectrometry检测
Co-IP（免疫共沉淀）技术是一种在生物学研究中广泛应用的实验方法，主要用于研究蛋白质之间的相互作用。该技术利用特异性抗体与目标蛋白结合，形成免疫复合物，并通过与磁珠或琼脂糖等固相支持物的结合，将复合物从复杂的细胞或组织提取物中分离出来。这种分离过程是在非变性条件下进行的，因此可以保留蛋白质间的天然相互作用状态。Co-IP技术的主要优势在于其直接性、特异性和灵敏度。通过选择特异性强的抗体，研究人员能够准确地捕获目标蛋白及其相互作用伙伴，从而揭示蛋白质在生命过程中的功能和调控机制。此外，该技术还可以用于研究间接相互作用的蛋白，如蛋白复合物的多种成分。总之，Co-IP技术为深入研究蛋白质相互作用提供了有力工具，有助于揭示蛋白质在生命活动中的重要作用。河北相互作用蛋白检测CoIP-mass spectrometry检测