CoIP-Mass和CoIP-WB优劣势：优势：高通量获得目的蛋白的专属蛋白互作库。劣势：CoIP的蛋白库鱼龙混杂，包含目的蛋白的直接/间接互作蛋白，非特异结合，残留蛋白。常规理想IP-Mass项目可鉴定到1000-2000个蛋白，其中绝大部分是非特异性结合及清洗残留的背景蛋白，导致CoIP-Mass假阳性高，CoIP-WB验证成功率低，导致研发进展反复跌宕，时间和经费成本占用较大，严重影响士气。其次，项目受限于蛋白表达量和IP抗体有效性，达到理想状态的CoIP-Mass较难，同时分析门槛较高。因此，该项目成功实施，比较依赖成熟和有分析经验的团队。建议整包交给专业的服务商开展检测。IP-Mass实验流程：样品制备、免疫沉淀、洗脱、蛋白酶消化、质谱分析、数据分析，鉴定互作蛋白！四川互作机制CoIP WB检测

免疫共沉淀CoIP实验，细胞的收集及裂解方法如下：

收集2E7个细胞样品，加入PBS洗涤细胞，离心后弃上清收集细胞沉淀。

准备500μl预冷的CellLysisBuffer,分别加入5μlProteaseInhibitor、5μlPMSF，混匀后加进细胞沉淀中吹打均匀，冰上孵育30min，期间涡旋混匀几次。

4℃,12000rpm离心10min，取上清，进行蛋白浓度测定及后续实验。广州基云生物，在IP互作组检测和关键机制分子筛选验证领域，具有丰富的经验，助力您的互作机制研究，欢迎垂询合作。 四川互作机制CoIP WB检测CoIP实验内源检测与外源检测的优缺点。

免疫共沉淀也存在一些局限性。例如，它可能无法检测到低亲和力和瞬间的蛋白质-蛋白质相互作用。此外，两种蛋白质的结合可能不是直接结合，而可能有第三者在中间起桥梁作用。此外，实验前需要预测目的蛋白以选择相应的抗体，因此，如果预测不正确，实验可能无法得到结果，这使得这种方法具有一定的冒险性。总的来说，免疫共沉淀是一种强大的技术，它能够为我们提供关于蛋白质相互作用的宝贵信息。然而，为了得到准确和可靠的结果，我们需要谨慎地解释和分析实验数据，并考虑到这种方法的局限性。

CoIP实验Western检测目的蛋白方法如下：

配胶。

上样，跑电泳，恒压100min。

转膜，湿转250mA恒流转1-2h。

封闭，将PVDF膜放入5%的脱脂牛奶中，封闭1h。

孵育一抗（PBS稀释），4℃孵育过夜。

TBST洗膜3次，每次5min。

孵育二抗（TBST稀释），室温孵育1h。

TBST洗膜3次，每次5min。

按1：1的比例将ECL发光液均匀滴到膜上

曝光，显影，定影。

广州基云生物，在IP互作组检测和关键机制分子筛选验证领域，具有丰富的经验和专业的技术，助力您的互作机制研究。 免疫共沉淀法证实蛋白互作，基于抗体专一性，揭示生理性相互作用。

在CoIP（免疫共沉淀）实验中，技术重复和生物重复设计建议如下：进行多次技术重复（在同一实验条件下使用不同的样品或样品批次）和生物重复（使用来自不同生物或不同实验条件的样品），以评估结果的稳定性和可靠性。在设置对照组时，还需要注意以下几点：对照组的设置应遵循科学原理，并充分考虑实验的具体需求和目标。确保对照组和实验组在实验条件和操作步骤上保持一致，以便进行准确的比较。在分析实验结果时，应综合考虑对照组和实验组的数据，以得出更准确的结论。总之，在CoIP实验中，通过精心设计和执行对照组实验，可以提高实验的准确性和可靠性，从而更准确地评估目标蛋白与诱饵蛋白之间的相互作用。Co-IP技术广泛应用于生物医学、药物研发、蛋白质组学等领域，助力科研人员探索生命奥秘！互作机制CoIP-mass spectrometry

Co-IP研究蛋白间互作，ChIP研究蛋白与DNA互作，实验原理各具特色！四川互作机制CoIP WB检测

Co-IP实验的内源检测注意事项如下：首先，确保使用的抗体具有高特异性和亲和力，这是内源检测成功的关键。由于细胞内蛋白表达复杂，非特异性结合可能导致实验结果失真。其次，严格控制实验条件，如细胞裂解和洗涤条件，以避免破坏蛋白质相互作用或引入非特异性蛋白。温和地释放细胞内蛋白，保证释放出的蛋白不被蛋白酶分解，同时实验过程需保持低温。此外，注意样本的采集和处理。样本应尽快处理，避免蛋白降解，同时防止样本在运输过程中温度过高导致变质。另外，结合其他实验方法进行验证，如Western Blot等，以确认Co-IP实验结果的可靠性。综上所述，Co-IP实验的内源检测需要关注抗体选择、实验条件控制、样本处理以及结果验证等方面，以确保实验结果的准确性和可靠性。四川互作机制CoIP WB检测