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湖北N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究

来源: 发布时间:2024-06-18

我们测量了FucosEXO从一组dai表不同键的不同寡糖底物中释放的岩藻糖。FucosEXO可有效释放α1-2、α1-3和α1-4连接的岩藻糖,对α1-6连接的岩藻糖残基没有活Genovis的FucosEXO的底物特异性:岩藻糖以不同的键存在于N-和O-聚糖上。α1-2、α1-3 和 α1-4 连接的岩藻糖常见于 O-聚糖中,并作为 N-聚糖的天线岩藻糖基化,而 α1-6 连接的岩藻糖被发现是 N-聚糖he心的修饰。β1-3,4半乳糖的水解:Genovis的GalactEXO 是一种β-半乳糖苷酶混合物,可水解 N-和 O-糖基化蛋白中的 β1-3,4-连接末端半乳糖。上海倍笃生物涵盖药物研发的全流程,抗体结构域分析蛋白酶、蛋白聚糖分析水解酶等。湖北N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究

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C1抑制剂的去糖基化:在O-糖基化生物制药的生产过程中,由于he心GalNAc残基的加工不完全,可能会出现Tn抗原。这表现为具有 203 Da HexNAc 单位差异的重复质量位移。为了确认 Tn 抗原的存在,可以应用以下工作流程,此处在重度(26 个位点)O-糖基化 C1 抑制剂上演示。首先,使用PNGaseF修剪糖蛋白的N-糖,使用Genovis的OglyZOR和SialEXO修剪he心1 O-糖。依那西普的磷性能测试?:依那西普是另一种具有挑战性的生物制药模型分子,携带 13 个 O-聚糖位点,其中平均 9 至 10 个位点被占用。山东N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶疾病机理研究与丝氨酸或苏氨酸连接的 GalNAc(称为 Tn 抗原)被 GalNAcEXO 快速有效地水解。

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为了研究 OglyZOR 对天然糖蛋白的活性,将该酶与依那西普、TNFR 和阿巴西普在 37°C 下有或没有 SialEXO 孵育 1 小时。当唾液酸被去除时,OglyZOR酶有效地水解了所有三种底物中的O-聚糖。Genovis的OglyZOR 酶可有效水解天然糖蛋白中的he心 1 二糖 (Gal-β1,3-GalNAc)。这使得这些酶适合在LC-MS分析之前制备样品,以鉴定其他PTM或确认氨基酸序列O-糖基化生物制药的全去糖基化:O-糖基化生物制药(如依那西普)很难表征。为了能够通过质谱法测定完整质量数,我们进行了酶促总去糖基化。N-聚糖被Genovis的PNGase F裂解,而O-聚糖可以与OglyZOR和SialEXO一起去除。。

从依那西普水解β1-3和β1-4半乳糖:Genovis的GalactEXO Immobilized 对 β1-3 和 β1-4 连接的半乳糖均具有酶活性,这些半乳糖存在于装饰有 N- 和 O-连接糖基化的生物制药中,例如 Fc-融合蛋白依那西普。将依那西普与GalactEXO固定化孵育60分钟,并在FabRICATOR消化后使用LC-MS在亚基水平上研究酶活性。TNFR和Fc/2片段分别分析。与GalactEXO Immobilized孵育导致N-连接和O-连接聚糖上的半乳糖残基水解,这在半乳糖基化物种中被视为信号丢失。对游离的N-聚糖分析证实了LC-MS数据。用SialEXO处理血清,上样于GlycOCATCH,洗涤,洗脱O-糖基化蛋白。Swiss Prot 数据库鉴定蛋白质列表。

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GalNAcEXO固定化离心柱含有与琼脂糖珠共价偶联的GalNAcEXO酶,用于水解糖蛋白上的GalNAc残基,而不会用酶污染制剂。Microspin 色谱柱可用于水解 5 或 10 x 0.5 mg 糖蛋白。1. 易于使用的离心柱;2. 提高酶与底物的比例,提高消化效率;3. 终样品中不含酶。用于水解离心柱中糖蛋白上的Genovis的GalNAc残基的固定化酶。GalNAcEXO 酶是一种n 外α-N-乙酰半乳糖氨酸酶,可快速有效地水解来自天然 O-糖蛋白的 z es GalNAc 残基。 该酶来源于Akkermansia muciniphila,在大肠杆菌中表达,带有His标签,分子量为52 kDa。 该酶在 Tn 抗原和 α1-3 连接末端 GalNAcs 上均显示活性。在这里,我们展示了如何使用GalNAcEXO来表征复杂的生物制药。因此,其水解需要底物蛋白以与酶活性相容的方式变性。广东用于自动化系统的96孔板形式PNGaseF去糖基化酶生物药物开发

GalactEXO 是一种β-半乳糖苷酶混合物,可水解 N-和 O-糖基化蛋白中的 β1-3,4-连接末端半乳糖。湖北N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究

用于水解离心柱中糖蛋白上的N-聚糖的固定化酶。 Genovis的PNGase F 固定化微离心柱含有与琼脂糖珠共价偶联的 PNGase F 酶,用于在样品中酶峰减少的糖蛋白上水解 N-糖。 将糖蛋白样品与PNGase F一起在离心柱中固定,然后通过离心步骤轻松收集去糖基化的蛋白质。由于空间位阻,PNGase F对某些糖蛋白的活性可能缓慢或受到抑制 - 在这些情况下可能需要更长的孵育时间或糖蛋白变性。 Microspin 色谱柱可用于水解 5 或 10 x 0.2 mg 糖蛋白。1. 易于使用的离心柱;2. 提高酶与底物的比例,提高消化效率;3.z终样品中的酶峰减少。湖北N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究

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