与肽图谱相比,根据Genovis科学家的经验,尤其是对于像抗体这样的分子,许多人在常规实验中做了太多的肽图谱,而中级水平(Middle-level)的方法可以很好地工作。中级方法(IdeS酶切抗体)需要更少的实际操作步骤和较少的示例处理,所有这些都意味着过程中出错的事情更少。我们的许多酶可以作为平台方法,同样的方法适用于绝大多数的抗体,这不是肽图的情况下,可能需要优化整个样品制备,LC分离,质谱设置和数据分析的每个不同的抗体分析。这些变化可能是很小的,但没有一种适用于所有肽图的方法。由于分析和数据分析的简单性,中级方法非常适合自动化和高通量的工作流程。肽图当然可以自动用于样品制备,但高通量肽图生成大量数据,仍然需要彻底分析。事实上,肽图谱是一个多步骤的过程,每一个步骤都可能破坏方法,并可能导致破坏蛋白质的人工制品,很难交叉训练给非专业人员。中级水平的方法很容易交叉训练,我们的方法在质量控制实验室中被成功地使用。肽图谱是一种用于修饰分析和氨基酸确认的方法,但一旦完成了这一工作,我相信使用中级分析可以成功地更有效地完成抗体样本的大部分工作。可消化柔性富含甘氨酸的融合蛋白连接子,例如 Gly4Ser 和 GlyxSery (GS) 以及聚甘氨酸 (G) 接头。河北GingisREXIdeS蛋白酶蛋白组学
当你应用像肽图这样的方法时,你可以从Genovis中级方法中获得的信息量就没有那么多了。一个主要的区别是你不能像在肽水平上那样将修改定位到单个氨基酸。然而,中级分析比肽图谱具有快速和简单的巨大优势,因为需要分析的色谱峰要少得多,数据处理任务要简单得多。此外,在中级实验中,手工实验步骤要少得多,FabALACTICA(IdeS)酶切消化方法不需要针对不同的人体IgG1进行优化。一旦在氨基酸水平上进行了PTM表征,我们非常认为中级表征肽图的一种补充方法,可以在更常规的基础上应用。中级分析更适用于高通量或监测类型的方法,并可用于支持肽图分析。广东FabULOUSIdeS蛋白酶蛋白组学铰链上方的单个暴露赖氨酸残基,生成的片段可用于结晶和高阶(HOS)NMR研究、结合研究等。
Genovis的FabRICATOR MagIC自动样品制备可用于分析和监测不同的CQA。mAb在生产或储存过程中的氧化就是这样一种CQA,可能会影响zhiliao产品的质量。为了展示FabRICATOR MagIC如何解决这个问题,对6种mAb的混合物进行强制降解(室温下3个月),并通过反相LC-MS进行分析。当在完整水平上分析mAb时,可以检测到mAb5丰度的显着差异,同时出现许多新的峰。然而,无法获得可靠的质量数据。使用FabRICATOR MagIC,mAb5变化的来源在Fab区域内。随后还原为 Fc/2、LC 和 Fd' 片段,可以识别差异是由于 mAb5 Fd' 片段上的色氨酸氧化,通过形成氧代内酯 (+14 Da) 和二氧代内酯 (+30 Da) 以及 mAb5 LC (-18 Da) 的琥珀酰亚胺化来揭示。此外,还可检测到mAb3轻链的异构化。该示例说明了FabRICATOR MagIC在mAb中级分析中的强大功能,它创建的片段足够小,可以精确定位特定的修饰,而无需耗时耗费资源的肽图分析,所有这些都以相对较少的手动操作时间快速完成。
Genovis提供冻干和固定化的FabRICATOR(IdeS),为客户提供了许多选择,以满足他们的需求。 冻干形式用于高度灵活的方法开发的目的,并随时准备使用,只需重组和添加到IgG样本。 冻干酶的灵活性也意味着它可以应用于更高的通量和自动化的工作流程。 Genovis还提供了在琼脂糖树脂上固定化的酶,在随时可用的旋转柱中,这可以极大限度地减少在样品中残留的酶,这可能是有利的。 对于更多的制备应用,我们提供FabRICATOR Fab2试剂盒,这是IgG片段生成和纯化的强大工具。 这包括FabRICATOR固定化柱和CaptureSelect Fc纯化柱,用于亚基的亲和纯化。 由于FabRICATOR在非还原条件下是活性的,F(ab’)2片段保留其链间和链内二硫键,如果片段想用于结合研究,这一点尤为重要,因为结合效率和免疫反应性将被保留。Genovis酶的适应于克隆筛选,工艺开发和验证以及稳定性研究,也适用于受控环境中的批次放行方法。
Genovis的FabRICATOR(IdeS)是一种独特的酶,可在铰链区域下方的特定位点消化IgG,产生均匀的F(ab')2和Fc/2片段。除IgG外,没有其他底物是已知的。IgG在30分钟内消化,如果孵育时间延长,则不存在过度消化的风险。由于FabRICATOR在生理反应条件下消化IgG,因此保留了免疫反应性。在37°C下获得良好的活性,但也可以在室温下使用较长的反应时间进行消解。FabRICATOR可消化人类的所有亚类以及猴子、兔子和绵羊IgG的某些亚类。它对小鼠IgG2a和IgG3的活性有限-为了消化这些抗体物种,我们建议使用FabRICATORZ。FabRICATOR是从化脓性链球菌克隆而来的,并在大肠杆菌中表达。该酶含有His标签,分子量为37725Da。FabRICATOR是IdeS的重组修饰形式,由GenovisAB开发,用于需要高标准和一致性的生物技术应用。有一种检测FabRICATOR酶的方法。了解有关山羊多克隆抗体Anti-FabRICATOR的更多信息。使用GlySERIAS固定化酶和内切糖苷酶GlycINATOR消化度拉糖肽。湖南IgGZEROIdeS蛋白酶抗体酶切
FabRICATOR MagIC磁珠含有Ides固定化酶专为自动化平台(振动台)而设计。河北GingisREXIdeS蛋白酶蛋白组学
Blinatumomab(一种对 CD19 和 T 细胞标志物 CD3 具有特异性的 BiTE 分子)的研究级生物仿制药在室温下用固定化过夜的 Genovis的GlySERIAS 消化。通过LC-MS对消解样品的直接分析表明,所有三个连接子区域均被消解,α-CD3 VL和VH链洗脱为一个色谱峰,α-CD19 VH和VL链作为单独的峰洗脱。来自连接的 α-CD3 VH 和 α-CD19 VH 结构域的小峰显示该短连接子未完全消化,表明 GlySERIAS 对短连接子的活性较低。与完整的蛋白质分析相比,四个结构域的分离提供了具有单同位素分辨率的高质量光谱。可以观察到每个结构域的几个不同变体,剩余的连接子残基数量不同。在色谱分离过程中,α-CD3 VH结构域无法从α-CD19 VH结构域完全基线分离,导致在相关质谱中观察到一些共洗脱。四个结构域的分离产生了有关在完整蛋白质水平上鉴定的蛋白质修饰位置的信息。例如,在完整水平上鉴定的 37 Da 的蛋白质修饰被分配给 α-CD3 VH 链。此外,240Da 和 320da 的两个修饰分别被分配给 α-CD3 VL 结构域。后者还含有一个带有五六个组氨酸残基的 His 标签。这些数据证明了使用 Genovis的GlySERIAS Immobilized 对包含多个柔性连接子蛋白进行质量控制的中级工作流程的强大功能。河北GingisREXIdeS蛋白酶蛋白组学