除了作为反应的溶剂，三氟乙酸因为其较好的溶解性，在高效液相色谱中常常被用作流动相，用来分离一些难以区分的化合物，在化合物核磁共振检测中，也常常利用氘代三氟乙酸作为溶剂，用来区分一些诸如卟啉类的大环分子内的氢的变化。三氟乙酸除了作为反应的催化剂和溶剂之外，还是很好的保护剂和脱保护剂，作为保护剂常用来保护氨基和羟基，作为脱保护剂，经常用来脱Boc；此外，三氟乙酸还可以用来制备合成一些三氟乙酸衍生物，例如三氟乙酸酐，它是一种重要的中间体，在医药、农药等化学合成中有很好的用途，市场前景广阔。三氟乙酸的生产主要集中在欧洲、北美、印度和中国，其中国内三氟乙酸的产能约占全球的一半，主要集中在浙江、山东、江苏等地，三氟乙酸在未来一段时间仍将是化工领域的宠儿。三氟乙酸是许多有机化合物的良好溶剂，如与二硫化碳合用，可溶解蛋白质。农药中间体三氟乙酸电子级

在一些反应中，三氟乙酸作为母液需要回收，其重要目的是为了出去其中的水分，但由于三氟乙酸易与水形成共沸物，因此不能采用蒸馏的方法进行分离。参照三氟乙酸纯化工艺，将三氟乙酸母液制成钠盐，然后再用浓硫酸酸化，蒸出三氟乙酸。在中和反应中，放热较小，但由于反应会产生大量的二氧化碳气体，所以，过快的滴加速度将导致二氧化碳浓度瞬间增加，体系有产生憋压的可能。三氟乙酸钠易溶于水，在过滤中容易吸收空气中的水形成过饱和溶液而堵塞滤孔并流失，所以较好的方法是蒸除大部分水后，直接进行干燥处理。农药中间体三氟乙酸电子级受吸电子性的三氟甲基的影响而有强酸性,酸性比乙酸强十万倍。

三氟乙酸（TFA）普遍用于合成多肽的工艺中作为切割剂及脱保护剂，临床使用存在毒性。目前我国药典将其纳入需控制的溶残，归为四类溶剂，但对其控制限量尚无明确规定，通常按三类溶剂的限度0.5%限定。多肽药物固相合成中，对于合成含有半胱氨酸、组氨酸、精氨酸、等带侧链功能基的氨基酸多肽来说，为了避免由于侧链功能团所带来的的副反应，一般需要用适当的保护基将侧链基团暂时保护起来。保护基的选择既要保证侧链基团不参与形成酰胺的反应，又要保证在肽合成过程中不受破坏，同时又要保证在后面的肽链裂解时能被除去。因使用TFA将肽链从树脂上切下的同时能对R侧链的保护基进行脱保护，且不同侧链对应的不同保护基，基本都能用TFA进行去保护，故目前几乎所有固相合成工艺均会在工艺中使用TFA。

1941年，美国教授开始研究利用电化学对有机物进行氟化，并与1949年申请了专利，由此揭开了有机氟化物快速发展的大幕。1961年，利用三氟乙烷为原料，水为介质，氧气作为氧源，利用电解的方法得到了三氟乙酸，这种方法原料比较廉价易得，反应的选择性比较好，不会发生副反应，产品的收率达到了50%，但是需要在高电压下才能发生反应，安全性比较差。后来美国3M公司受电解氧化法的启发，开发出了生产三氟乙酸的新工艺，一乙酸酐货乙酰卤为原料，经过电解氟化、水解成盐、硫酸酸化后，蒸出三氟乙酸成品。三氟乙酸的沸点比较低，挥发性好，并且酸性强，因此它可以催化很多酸催化的化学反应。

三氟乙酸在有机合成中得到广泛应用。它可以用作催化剂、溶剂和脱水剂，促进各种有机反应的进行。例如，它可以用于合成酯、酰胺、酮和醚等有机化合物。此外，三氟乙酸还可以用于有机合成中的氧化反应和脱水反应。除了有机合成，三氟乙酸还在其他领域有应用。例如，在电子工业中，三氟乙酸可以用作清洗剂和蚀刻剂，用于清洗和蚀刻电子元件。在表面处理中，三氟乙酸可以用于去除金属表面的氧化物和污染物，提高金属的质量和表面光洁度。三氟乙酸在不流动的地表水中富集则会影响农业和水生系统。华东脂肪含氟中间体三氟乙酸电子级储存条件

三氟乙酸可以比较方便地脱去氨基、羟基的保护基团，例如，N-苄氧羰基、N-甲氧甲基 、N-叔丁氧羰基 等。农药中间体三氟乙酸电子级

与水相比，TFA具有更低的表面张力。这是由TFA中的三个氟基团引起的，它们相互排斥。你几乎可以说TFA在某种程度上讨厌自己。如果没有稳定溶剂例如水的添加，“爬行”液体沿容器壁向上形成TFA蒸气，并导致了一个或多个物质的溶解，如果多个样品同时蒸发，例如使用微量滴定板时，这种情况会导致材料泄漏或交叉污染。因此，在从样品制备到放置以及蒸发后的所有阶段使用高浓度的TFA时，必须小心。TFA的蠕变通常可以通过用水稀释(40%v / v)来限制。农药中间体三氟乙酸电子级