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复杂性：生态系统是一个具有复杂结构和功能的系统，系统内部具有负反馈的自我调节机制，对外界干扰具有一定的调节能力和时滞性。人为活动与自然干扰都会对生态系统产生影响，这两种影响常常很难准确区分．这给监测及数据解释带来了较大难度 ，分散性：生态监测平台或生态监测站的设置相隔较远，监测网络的分散性很大。同时由于生态过程的缓慢性，生态监测的时间跨度也很大，所以通常采取周期性的间断监测。 具有独特的时空尺度根据生态监测的监测对象和内容。生态监测可分为宏观生态监测和微观生态监测两个。任何一个生态监测都应从这两个尺度上进行。即宏观监测以微观监测为基础，微观监测以宏观监测为主导。生态监测的宏观、微观尺度不能相互替代，二者相互补充才能真正反映生态系统在认为影响下的生物学反应在全国的口碑是很不不错的。

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