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南京qPCR法病毒检测原理

来源: 发布时间:2024-02-25

复制型病毒/病毒载体回复突变(ReplicationCompetentVirus,RCV),可产生于病毒载体制造过程中的所有步骤当中。并且,RCV感   染宿主细胞后能随宿主细胞在培养液中增殖、扩增对人体健康具有严重的隐患,是免细胞治     疗类产品,如CAR-T产品的主要安全性风险之一。近年来,CAR-T细胞制备过程中,伴随载体的不断升级优化,重组产生的复制型逆转录病毒/慢病毒(ReplicationCompetentRetrovirus/Lentivirus,RCR/RCL)逐渐降低,但产生RCR/RCL的风险隐患至今仍不能完全排除。由2022年5月发布的《体外基因修饰系统学研究与评价技术指导原则(试行)》指出RCR/RCL检测作为安全性检测在细胞的研发和生产过程中至关重要,相关产品不得检出RCR/RCL,可知病毒载体相关产品中,RCR/RCL病毒检测至关重要。为什么要做复制型慢病毒检测?南京qPCR法病毒检测原理

用qPCR法进行rcAAV复制型腺相关病毒检测时,出现扩增曲线异常的可能原因是什么?①软件参数设置不当可能引起标曲参数或检测结果异常。如扩增曲线信号早出现在14个循环左右,基线却设置为3-15,导致仪器将14个循环出现的荧光信号默认为基线部分,出现结果异常。建议将BaselineEnd设置为扩增信号出现的前一个循环,或由软件自动设置。②扩增曲线飘起:该现象通常出现于高浓度模板情况下,扩增曲线Ct值在10以内的样品。针对此类样品检测,设置标曲时建议尽量控制标曲蕞浓度Ct值控制在10以上。检测样品时建议对样品进行稀释后再测试。南京qPCR法病毒检测原理复制型逆转录病毒检测。

用qPCR进行rcAAV复制型腺相关病毒检测时,哪些因素会对检测结果准确性和方法灵敏度存在较大影响?参考品DNA量值溯源及质量保证:参考品DNA的量值准确与否,直接关系到样品检测结果的准确性,因此需制定完善的参考品量值溯源程序,确保结果准确可靠。参考品DNA的质量要求可从条带大小、完整性、纯度、浓度等方面做多评估,细胞来源的参考品应考察支原体污染,质粒参考品应考察质粒宿主E.coli基因组DNA残留情况等,尽量排除干扰确保结果准确可靠。

尽管逆转录病毒和慢病毒载体被设计为具有复制缺陷,但仍有可能在生产过程中或输注到患者体内后发生重组,从而产生新的具有复制能力的逆转录病毒/慢病毒(RCR/RCL)。FDA在有关细胞产品和患者中检测RCR复制型逆转录病毒/RCL复制型慢病毒的指南中建议使用适当的生物学和/或分子检测方法进行病毒载体、细胞产品和输注后患者中的RCR复制型逆转录病毒/RCL复制型慢病毒检测。南京正扬生物自主研发了可用于基于细胞培养方法的qPCR检测以及CAR-T终产品qPCR检测的RCL及RCR检测专   用试剂盒,帮助研究者进行分析。南京正扬的重组腺相关病毒检测试剂盒性能如何?

RCL/RCR病毒检测的方法FDA推荐的RCL检测方法是利用敏感细胞对病毒载体中可能存在的RCL进行培养扩增,并在培养终点进行检测。?扩增期:将待测物与对HIV-1易感并且可大量扩增病毒的细胞系(通常用C8166)孵育,细胞传代5次以上,培养至少3周。?指示期:3周后收集培养上清,接种于C8166细胞中培养7d后检测RCL标志物。?检测:A:P24ELLISA的方法:适用于由载体制备过程中病毒基因组之间的重组形成RCL的检测。B:PERT法:当RCL进行扩增后,也可应用PERT检测方法测定逆转录酶活性。该方法的缺点是在某些细胞中存在高背景。C:qPCR方法:采用实时定量PCR方法(Q-PCR)测定假型病毒CAR-T细胞医治产品中重组腺相关病毒检测的监管要求。宁波RCL病毒检测优缺点

复制型病毒检测试剂盒适用性样品有哪些?南京qPCR法病毒检测原理

用qPCR进行rcAAV复制型腺相关病毒检测时,哪些因素会对检测结果准确性和方法灵敏度存在较大影响?①qPCR引物探针的序列特异性:为保证方法高灵敏度和检出率,用于qPCR检测的特异序列必须是存在于高度保守区域内的稳定序列,并且需要散布在基因组上,保证不会因工艺导致的残留偏好而引起漏检。②qPCR实验室能力验证:为满足检测要求,应对实验室硬件和软件能力进行确认。实验室设计应按实验流程分区操作,每个操作区域配置相应设施、设备及耗材,建立实验室质量管理体系,考核实验人员的操作能力及数据分析解读能力等。南京qPCR法病毒检测原理

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