industryTemplate对模板量要求高,过多会导致无法定量,过少会导致信号过低。四川数字PCR经验丰富
与传统qPCR技术相比,数字PCR技术具有极高的灵敏度、特异性和精确性,但截止目前而言,数字PCR对广大科研工作者仍然是一种全新的检测方法,我们在看待数字PCR的应用前景时,更应该保持一种开放的心态,与其说数字PCR技术是一个新的检测平台,不如把它视为一种全新的技术思路和手段,在这个平台上必将有更多的应用帮助我们深入到分子生物学研究的更高层次。数字PCR被称为第三代PCR技术,相比于传统的PCR技术和荧光定量PCR技术,其具有诸多优势:(1)***定量,不依赖标准品和参考曲线,定量结果更加准确可靠;(2)高灵敏度,可实现单分子级检测;(3)高分辨率,适合在大量背景模板的干扰下对罕见的目标分子进行检测;(4)高稳定性,对抑制剂的耐受程度**增强。凭借这些优势,数字PCR被广泛应用于多个不同的领域[4],特别是生物医学领域,包括稀有突变检测、基因拷贝数变异检测、基因表达研究、甲基化水平检测、**液体活检、无创产前检测、微生物(病毒、细菌等)检测、移植排斥监控和二代测序辅助建库等。此外,此技术也被用于农业、食品安全和环境科学等诸多领域。上海数字PCR数字PCR售后服务对干扰分子(背景信号、PCR抑制剂等)耐受度高,通过信号的“有”“无”定量而不是Ct值。
数字PCR (Digital PCR) 技术作为新一代核酸检测和***定量技术,目前在痕量核酸样本检测、复杂样本稀有突变检测和微小表达差异鉴定等方面表现出的优势已被普遍认可。NGS和CRISPR等分子生物学技术的发展,为数字PCR技术在microRNA研究、基因组拷贝数精细鉴定、致病微生物鉴定、转基因成分鉴定及基因细胞***等诸多领域带来了新的契机。良好的引物探针设计是数字PCR实验获得成功的关键因素之一。这正是众多研究人员选择LNA(锁核酸技术)的原因——LNA修饰的引物和探针采用了成熟可靠的算法设计,获得了全世界科学家的信赖。
PCR扩增效率的高低直接影响**终信号的判读和实验结果分析。在进行热循环实验时,需检查样品的密封性以及PCR反应板是否和PCR仪热盖完全接触,确保PCR过程中样品反应液没有蒸发。QIAcuity数字PCR系统采用**的微反应腔室封闭方式,固态的物理分割和封闭可有效避免PCR过程中微反应体系的水分蒸发,确保微反应体系中样本反应液浓度的恒定,更易实现准确和精确的定量。原始数据中往往发现阳性信号与阴性背景之间存在许多弱阳性信号。因此需要对引物探针进行重新设计和优化(详见引物探针优化设计)或提升退火温度(探针通常比引物高5~10℃),以消除疑似荧光信号的“雨区“现象;此外,阳性信号和阴性背景间隙过小,导致**终结果无法准确判读。因此需要调整引物探针浓度(建议总反应体系引物浓度为600~800nM;探针浓度为200-400nM)或5' 端**个碱基如有G出现,则将其互补序列设计为实验所用探针,以提高阴阳性信号间隙,便于分析结果的准确判读。一体化全自动的QIAcuity数字PCR系统很大程度解放了实验人员的双手,同时又避免由于手动操作而引入的误差。
常规PCR和实时荧光PCR定量检测都需要已知拷贝数的标准DNA制定标准曲线,由于样品测定在各种条件上不会完全一致,会造成PCR扩增效率的差异,从而影响定量结果的准确性。而ddPCR不受标准曲线和扩增动力学影响,可以进行***定量。dPCR也有一些缺点,数字PCR系统成本高,通量有限、操作繁琐等不足。芯片式dPCR由于芯片加工成本高,系统复杂度高,使得商业化优势不是特别明显,特别是目前大多数分子诊断qPCR也能够很好的满足需求,dPCR增加的收益成本比并不算高。液滴式相对芯片式成本有所下降,但典型的液滴式dPCR液滴形成和PCR扩增和检测都分别在不同仪器中完成,增加了很多操作,也增加了系统的复杂性,从这点上看全自动荧光定量PCR做的更好。目前有超过130万条经锁核酸修饰的引物,提供至少3种设计方案以满足不同跨外显子区域的检测需求。四川数字PCR经验丰富
基因丰度非常低的,或者样本浓度低的,可以选择数字化PCR。四川数字PCR经验丰富
CRISPR-Cas9基因编辑结果验证:CRISPR-Cas9技术的发明,是基因编辑技术的一大突破,但如何验证实验是否成功,仍需要高灵敏度的检测方法,数字PCR技术可以满足这一需求。Broad研究所张锋团队发明了以CRISPR为基础的SHERLOCK技术可以对核酸进行高灵敏度的定性检测,但精确定量评估时仍采取了数字PCR进行确认。*****的伴随诊断:常用体液来源(如血液,胸腹水,唾液及尿液等)的待检标本中的DNA,有正常脱落体细胞和病变脱落细胞两种来源,前者的量远大于后者。通过微液滴处理能在每个微液滴中有效减少正常体细胞DNA的干扰,实现**标记物的有效检测,如EGFR,ALK,ROS1,KRAS、BRAF等基因的突变检测、乳腺*/胃*的HER2基因扩增检测等,应用于**精细医学的伴随诊断。四川数字PCR经验丰富