逆转录实验的准备工作:1、实验器具与材料:(1)移液头:200ul、10ul;(2)吸头:200ul、20ul;(3)EP管1。5ml、100ul;(4)水浴箱。2、实验器具的处理与准备,塑料制品:(包括吸头、EP管等)将塑料制品逐个浸泡于1‰DEPC水中(必要时小头头需要用吸管打入DEPC水)37℃过夜,然后送至高压3次,后在80℃烘烤箱中烘干(或置于37℃中8小时左右烘干),试验前将头头放入吸头台。3、试剂配制和准备:(1)DEPC水:泡实验器具的DEPC水的配制:1000ml双蒸水中加1mlDEPC,放在1000ml容量瓶中静置4小时后备用。逆转录中所用的DEPC水的配制:100ml盐水瓶内装40ml双蒸水,加40ulDEPC,37℃过夜,送至高压,后分装到几个1。5mlEP管中,-20℃中保存备用。(2)RT中所需要的各种试剂。逆转录过程由逆转录酶催化,此酶也称依赖RNA的DNA聚合酶,即以RNA为模板催化DNA链的合成。上海一步法逆转录稳定性高
反转录酶(reversetranscriptase,也可写成逆转录酶)又称为依赖RNA的DNA聚合酶。1970年Temin等在致死RNA病毒中发现了一种特殊的DNA聚合酶,该酶以RNA为模板,以dNTP为底物,tRNA(主要是色氨酸tRNA)为引物,在tRNA3'-OH末端上,根据碱基配对的原则,按5'-3'方向合成一条与RNA模板互补的DNA单链,这条DNA单链叫做互补DNA(complementaryDNA,CDNA)。反转录酶(Reversetranscriptase)是以RNA为模板指导三磷酸脱氧核苷酸合成互补DNA(cDNA)的酶。哺乳类C型病毒的反转录酶和鼠类B型病毒的反转录酶都是一条多肽链。鸟类RNA病毒的反转录酶则由两上亚基结构。真核生物中也都分离出具有不同结构的反转录酶。绍兴一体化逆转录酶逆转录实验中引物设计时要注意反向引物特异性和长度,避免循环扩增和特异性问题。
逆转录的发现有重要的理论意义和实践意义。对分子生物学的中心法则进行了修正和补充。经典的中心法则认为:DNA的功能兼有遗传信息的传递和表达,因此,DNA处于生命活动的中心位置。逆转录现象说明:至少在某些生物中,RNA同样兼有遗传信息传递和表达功能。修正后的中心法则表示为:是指遗传信息从DNA传递给RNA,再从RNA传递给蛋白质,即完成遗传信息的转录和翻译的过程。也可以从DNA传递给DNA,即完成DNA的复制过程。这是所有有细胞结构的生物所遵循的法则。某些病毒中的RNA自我复制和在某些病毒中能以RNA为模板逆转录成DNA的过程(某些致死病毒)。有些亚病毒例如朊病毒,这种亚病毒没有核酸,是一种因错误折叠而形成的结构异常的蛋白质,以蛋白质直接形成蛋白质,可促使与自身具有相同氨基酸序列的蛋白质发生同样的折叠错误,从而导致大量结构异常的蛋白质的形成。当然,一般不认为亚病毒属于生物。
茎环法逆转录是一种逆转录反应的技术,它利用茎环结构的RNA分子作为反向引物,在逆转录过程中特异性地扩增目标RNA分子。该技术在分子生物学和医学研究中得到了普遍的应用,特别是在RNA的研究和检测中具有独特的优势。茎环法逆转录技术的基本原理是利用逆转录酶和茎环结构的RNA作为反向引物,将RNA逆转录成cDNA,并在PCR反应中扩增。茎环结构的RNA分子具有较高的稳定性和特异性,可以特异性地识别和结合目标RNA分子,从而在逆转录反应中作为反向引物扩增目标cDNA。此外,由于茎环结构的RNA分子与目标RNA分子的碱基序列互补,因此茎环法逆转录技术可以避免随机引物引起的非特异扩增。逆转录经常与细胞恶性转化有关,艾滋、乙肝等很多疾病也有逆转录过程。
miRNA逆转录茎环法:首先需要进行RNA样品制备,可选的方法有:离心柱法抽提(不必去除gDNA);传统Trizol法抽提(需要去除gDNA)。miRNA正向引物:需要分别设计。是否采用通用引物视情况而定,正向引物与通用反向引物不会形成二聚体时才能用。取200ul的PCR管,根据所得每组RNA的浓度C,每孔加入1000ng总RNA,按公式1000ng/C计算出所需RNA的体积x。然后按建议的20μL反应体系说明,依次向200μL的PCR管内加入下列试剂:加样结束后,移液器吹打混匀,低速离心数秒。将逆转录PCR管放入PCR扩增仪内,调整参数:37℃15min(反转录反应),85℃5s(反转录酶的失活反应),4℃∞。反应结束后根据实验需要进行荧光定量PCR或放入-20℃冰箱保存。说明:此处可以选择U6下游引物作为U6的逆转录引物,注意相应地调整无酶水的体积和反应温度。逆转录实验完成反应后要及时保存和处理PCR产物,并记录实验数据和结果等。上海一步法逆转录稳定性高
逆转录实验反应过程中需控制反应温度,时间和pH值等指标。上海一步法逆转录稳定性高
miRNA的加尾法逆转录和qPCR,miRNA加尾法逆转录:增加miRNA逆转录产物长度较直接的方法就是增加miRNA的长度,即在miRNA的3端后面添加一段序列,然后进行逆转录反应。因此,加尾法是由两个酶共同作用完成的,它们分别是PolyA聚合酶和逆转录酶。PolyA聚合酶负责给miRNA加上PolyA尾,增加其长度。之后逆转录引物结合到PolyA序列上,由逆转录酶完成加长版cDNA的合成。miRNA的加尾法逆转录和qPCR中的qPCR:miRNA荧光定量PCR的过程跟普通mRNA的相似,但由于加尾法逆转录产物的5端均为通用序列,因此其qPCR反向引物都是相同的(通用引物R),不同的是根据miRNA序列设计的正向引物。正向引物的特异性就变得非常重要。对于内参,生工生物的miRNA加尾法首先链cDNA合成试剂盒(B532451)中内置了内参U6的正向引物,使用该引物与通用引物R即可进行内参U6的扩增。上海一步法逆转录稳定性高