miRNA逆转录茎环法:首先需要进行RNA样品制备,可选的方法有:离心柱法抽提(不必去除gDNA);传统Trizol法抽提(需要去除gDNA)。miRNA正向引物:需要分别设计。是否采用通用引物视情况而定,正向引物与通用反向引物不会形成二聚体时才能用。取200ul的PCR管,根据所得每组RNA的浓度C,每孔加入1000ng总RNA,按公式1000ng/C计算出所需RNA的体积x。然后按建议的20μL反应体系说明,依次向200μL的PCR管内加入下列试剂:加样结束后,移液器吹打混匀,低速离心数秒。将逆转录PCR管放入PCR扩增仪内,调整参数:37℃15min(反转录反应),85℃5s(反转录酶的失活反应),4℃∞。反应结束后根据实验需要进行荧光定量PCR或放入-20℃冰箱保存。说明:此处可以选择U6下游引物作为U6的逆转录引物,注意相应地调整无酶水的体积和反应温度。逆转录过程中的缺陷会导致错误扩增和偏差。北京加尾法逆转录酶报价
逆转录的发现有重要的理论意义和实践意义。(1)在致死病毒的研究中发现了病基因,在人类一些病细胞如膀胱病、小细胞肺病等细胞中,也分离出与病毒病基因相同的碱基序列,称为细胞病基因或原病基因。病基因的发现为疙瘩发病机理的研究提供了很有前途的线索。(2)在实际工作中有助于基因工程的实施。由于目的基因的转录产物易于制备,可将mRNA反向转录形成DNA用以获得目的基因。逆转录酶实验操作注意事项:RNA提取一定要迅速,样本要新鲜,组织尽量在液氮中研磨;RNA提取完马上进行逆转录不要拖延,新提的RNA很容易降解;逆转录反应过程,需建立无RNAase环境,以避免模板RNA降解。RNase是RNA水解酶的统称,包含RNaseA,RNaseH等,RNaseA可以水解单双链RNA,RNaseH主要水解RNA与DNA杂交双链中的RNA。北京加尾法逆转录酶报价逆转录现象说明:至少在某些生物中,RNA同样兼有遗传信息传递和表达功能。
茎环法逆转录是一种逆转录反应的技术,它利用茎环结构的RNA分子作为反向引物,在逆转录过程中特异性地扩增目标RNA分子。该技术在分子生物学和医学研究中得到了普遍的应用,特别是在RNA的研究和检测中具有独特的优势。茎环法逆转录技术的基本原理是利用逆转录酶和茎环结构的RNA作为反向引物,将RNA逆转录成cDNA,并在PCR反应中扩增。茎环结构的RNA分子具有较高的稳定性和特异性,可以特异性地识别和结合目标RNA分子,从而在逆转录反应中作为反向引物扩增目标cDNA。此外,由于茎环结构的RNA分子与目标RNA分子的碱基序列互补,因此茎环法逆转录技术可以避免随机引物引起的非特异扩增。
逆转录实验步骤:用SSⅢ逆转录酶进行RT(20ul体积)1、准备0、65ml的EP管。2、冰上操作:在EP管中加入10ulDEPC水,1ul引物,1ul模板RNA,1uldNTP,短暂离心。3、65℃水浴5分钟后,立刻0℃冰水浴至少1分钟。4、短暂离心后,冰上操作:加入4ul5×First-StrandBuffer,1ul0.1MDTT,1ulRNAseInhibitor,1ulSSⅢ逆转录酶。5、短暂离心。6、50℃水浴60分钟进行逆转录。7、70℃水浴15分钟灭活逆转录酶。8、-20℃保存,或立即进行PCR。MCERTmix含有比例优化的Oligo(dT)和RandomPrimers,使cDNA合成可从RNA转录本的各个区域起始,并具有相同的逆转录效率,较大程度保证qPCR结果的真实性和可重复性。逆转录是一种将RNA反转录为DNA的生物化学过程。
逆转录酶还有DNA内切酶活性,这可能与病毒基因整合到宿主细胞染色体DNA中有关。逆转录酶的发现对于遗传工程技术起了很大的推动作用,它已成为一种重要的工具酶。用组织细胞提取mRNA并以它为模板,在逆转录酶的作用下,合成出互补的cDNA,由此可构建出cDNA文库(cDNAlibrary),从中筛选特异的目的基因,这是在基因工程技术中较常用的获得目的基因的方法。简要过程表示:逆转录酶的作用是以dNTP为底物,以RNA为模板,tRNA(主要是色氨酸tRNA)为引物,在tRNA3'-末端上,按5'→3'方向,合成一条与RNA模板互补的cDNA单链,它与RNA模板形成RNA-cDNA杂交体。随后又在反转录酶的作用下,水解掉RNA链,再以cDNA为模板合成第二条DNA链。至此,完成由RNA指导的DNA合成过程。病毒复制方式:逆转录病毒(属于RNA病毒):RNA→DNA→RNA。拟逆转录病毒(属于DNA病毒):DNA→RNA→DNA。逆转录实验中可以通过qPCR检测逆转录反应效果。上海miQP2反转录纯度高
逆转录实验在反应前应将各反应试剂混匀,避免试剂沉淀或剪切。北京加尾法逆转录酶报价
反转录酶的注意事项,引物的选择,OligodT:选择OligodT时,要求RNA必须有PolyA,所以真核生物的mRNA都适用。适合长链甚至全长mRNA的RT,所以对RNA样品的质量要求较高,较好不要有明显的DNA污染、RNA降解和RNA断裂。假如想探索新的mRNA进行RT反应,建议推荐使用OligodT引物。使用OligodT引物要比随机引物和特异性引物的稳定性要好。特异性引物:特异性引物只能用你设计引物时的下游引物做RT,引物设计质量影响RT的结果,而且不同引物退火温度本来就不相同,所以按照说明书按照一个温度做不是较佳选择,一般不推荐。北京加尾法逆转录酶报价