欧易生物自引进10x Visium空间转录组以来已经完成了上百例样本测序，在样本包埋、切片、实验和数据分析上积累了大量宝贵的经验。本次培训班旨在跟广大科研工作者介绍空间转录组的研究热点和方案设计，分享欧易生物在样本处理、实验和数据挖掘上的成功经验，助力各位科研工作者取得新的突破。招生对象：A、对空间转录组感兴趣，期望了解空间转录组技术，或近期准备开展空间转录组测序项目B、项目已经开展，需要深入挖掘数据的科研工作者。空间转录组测序技术在进行 HE 染色的同时需要保证获取组织基因表达信息。海南空间转录组使用

许多当前时代空间转录组技术的基础都是在自七十年代以来的几十年间建立的。例如，于1976 年首先使用紫外线激光来切割组织。当前流行的技术，例如空间转录组学（ST）和 10X Visium 依靠这种微阵列技术，区别就在于是从放置在微阵列载玻片上的组织上而不是从溶液中来捕获转录本信息。当前时代的空间转录组技术大致分为五类方向：激光显微切割（LCM），单分子荧光原位杂交（smFISH），靶向原位测序（ISS），原位阵列捕获和 其他非成像技术。吉林技术空间转录组尽管前传时代的空间技术被迅速弃用，但其思想和方法是当今时代空间转录组学发展的基础。

美国脑计划启动的 BICCN 项目，该项目将整合不同类型细胞的分子、解剖学和生理学特性，创建小鼠脑细胞 3D 参考图谱，同时也将基于人类和非人类灵长类脑组织样本，绘制脑细胞参考图谱 ，其涉及空间转录组学技术主要包括 MERFISH 和 seqFISH。一些实现空间转录组学的重要技术，可以追溯到二十世纪七十年代，长期以来，各种形式的原位杂交技术（ISH）已用于可视化空间中的基因表达。从技术原理中不难看出，空间转录组技术重要为特殊的载玻片。

和单细胞转录组一样，空间转录组也可以进行细胞间通讯分析，区别在于空间位置信息可以同时用于识别潜在的细胞间相互作用。通常通过了解配体受体（LR）对并测试 LR 对是否更有可能在邻近细胞或 spot 中表达来完成?；褂泻芏嗥渌嘈偷姆治隹捎糜诳占渥甲檠?，包括基因模式的识别，空间区域的转录组定义， 基因间的相互作用推断，转录本的亚细胞定位以及基于H＆E图像的基因表达估算等。1. 欧易生物具有上百例空间转录组项目执行经验，致力通过质量的服务，助力各位科研工作者取得新的突破?？占渥甲榈奶跣温肽孀紀ligo(dT)引物在显微镜载玻片表面的有序附着。

转录本的空间位置信息可以通过在原位阵列上捕获的组织切片中的转录本来获取，目前已有多种技术策略被开发报道， 如空间转录组技术（Spatial Transcriptomics，ST）和 Visium 技术，通过将包含空间位置信息的条形码、UMI 标签、poly-dT 的探针固定在商用微阵列载玻片上，来捕获包含 poly(A) 尾巴的转录本，并获取全转录组水平的基因表达及位置信息。一些无需成像即可计算重建空间基因表达模式所需信息的技术也被开发了出来，其中之一就是是 DNA 显微技术，它记录 cDNA 之间的接近度，该信息可用于重建转录本之间的相对位置。空间转录组细胞通讯分析方法简介及实操。浙江欧易生物空间转录组多少钱

空间转录组这对于发育生物学等众多领域的研究都具有重要的意义。海南空间转录组使用

10x Genomics空间转录组的实现原理是什么？10x Genomics空间转录组用于文库构建的每张载玻片上有四个捕获区域，每个捕获区域的大小为6.5x6.5mm，包含5000个被条形码标记的点（barcoded spots），每个点的直径为55 μm，点和点之间中心的距离为100 μm，并且每个点都有一个barcode序列。组织切片的细胞中会释放出mRNA，迁移到每个spot的mRNA会被标记上相应的barcode序列，然后进行文库构建并进行测序。根据数据的条形码信息对数据进行分析，以确定哪些数据来自哪个位置，从而实现空间基因表达的可视化。 海南空间转录组使用

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