空间代谢组学研究作者对P493-6B细胞淋巴瘤系(BCL)进行了全基因组表达谱、核突变和ChIP分析,发现MYC诱导增加了包括ACLY、ACACA、FASN和SCD1及其相关蛋白在内的脂肪酸(FA)合成基因的mRNA表达,在MYC诱导的肝细胞*(HCC)、急性白血病(T-ALL)和肾细胞*(RCC)的三种体内转基因小鼠模型中也有类似表达。还发现MYC与这些FA合成基因的启动子结合并启动mRNA转录,如甲羟戊酸和胆固醇途径基因的启动子。为了了解MYC和SREBP1之间的相互作用,作者首先,对这两种蛋白进行ChIP和re-ChIP分析,证明MYC和SREBP1都可以发现与FA合成基因启动子中的相同DNA分子结合(图1)。SREBP1的敲低也降低了FA合成基因的表达,但不降低MYC基因的表达。其次,ChIP的MYC与启动子结合,不仅调节FA合成基因的表达,还调节糖酵解和谷氨酰胺分解基因的表达。因此,MYC似乎会依次调节参与脂质合成的基因:首先诱导葡萄糖和谷氨酰胺,然后诱导FA合成相关基因。通过RNA测序(RNA-seq)发现,增加MYC水平会引起糖酵解、谷氨酰胺分解和FA合成。空间代谢组三个维度的分析。辽宁空间代谢组学与空间转录组
空间代谢组学:中文标题:MYC*基因与固醇调节元件结合蛋白协同调节**生长所必需的脂肪生成研究对象:小鼠发表期刊:CellMetabolism影响因子:27.287合作单位:斯坦福大学运用生物技术:空间代谢组学、CHIP、RNA-seq、NMR和IHC等MYC是一种原*基因,在细胞增殖、凋亡、分化等多种细胞生物学过程中发挥作用,其易位、扩增或表达异常常与多种**的发***展有关。近年来关于MYC在脂质代谢中的研究很多,据了解MYC与脂肪酸合成相关酶密切相关;致*基因MYC刺激细胞生长需要脂质来组装新的细胞膜,但是否*由MYC调节还是与其他因素协同调节尚不清楚。因此本文主要是揭示MYC诱导的**中脂质生成的机制。重庆空间代谢组学与空间转录组欧易生物空间代谢组学适合整体方案,助力科研,。
以上结果表明,AFADESI-MSI方法可以直接检测极性代谢产物,并具有高特异性,能呈现其在大脑微区分布的图像。3.在大鼠脑中绘制微区代谢网络图要了解大脑的结构区域发生的复杂代谢过程,不仅应准确表征代谢物,还要研究其相关性。从大鼠脑微区中提取代谢谱进行代谢网络重建。从15个微区提取的MSI数据进行峰挑选和峰对齐(图1F),包括松果体、中脑导水管、脑桥、梨状皮质、延髓、丘脑、纹状体、海马、胼胝体、嗅球、大脑皮层、小脑皮层、穹窿、小脑延髓和丘脑。
空间代谢组学:食道腺*是全球第八大崔常见的恶性**发病率正在持续上升,但存活率仍然很低,目前急需新的工具来提高早期诊断和精确***。脂质代谢紊乱与**的发***展密切相关,大多数脂质以甘油磷脂(GPLs)的形式储存在双分子膜中,基于甘油磷脂具有较稳定的物理化学性质,因此将其作为疾病诊断的生物标志物具有重要意义。质谱成像(MSI)可在几分钟内对冷冻切片组织的**磷脂体量化并进行客观诊断。然而,MSI是否能客观识别原发性食管腺*目前尚不清楚,这是一个重大的挑战,因为该微环境复杂,组织类型的表型相似。空间代谢组学 技术咨询中心。
空间代谢组学:质谱成像技术近二十年来,随着质谱离子化技术的不断发展,质谱成像技术因其能够直观、快速、简便地呈现出分子在细胞或组织中的结构、空间与时间分布等信息,越来越受到大家的关注。并且质谱成像技术也被***的用在**疾病研究、药物前期发现等各领域的高质量文章中,为生物标志物的高灵敏度探测和药物代谢精确成像研究奠定了基础,下面进入到质谱“画”时代~是什么?有多少?在哪里?回答以上“灵魂”3问,首先需要了解他们之间的关系。质谱是通过采集化合物的质荷比,获得定性和定量的信息,进而去探究物质本身包含的化合物“是什么?”和“有多少?”这两个根本性问题。《空间代谢组科研应用手册》是一本集聚空间代谢组学的由来、发展、原理及应用的科研专业读物。贵州空间代谢组学翻译
质谱成像空间代谢组学方法及其应用研究进展。辽宁空间代谢组学与空间转录组
空间代谢组学研究:一区 | IF:14.553多发性硬化症的相关空间代谢组学研究。本文为伦敦帝国理工学院Zoltan Takats教授课题组在ACS central science期刊发表的题为“Correlated Heterospectral Lipidomics for Biomolecular Profiling of Remyelination in Multiple Sclerosis"的研究成果,通过拉曼+空间代谢组学+IHC研究方法,发现了新形成的髓鞘与正常髓鞘具有不同的脂质成分,探究了多发性硬化中再髓鞘化形成的机理,描绘了用于关联生物分子结构和髓鞘成分的分子成像图谱,为评估再髓鞘化***提供新策略。辽宁空间代谢组学与空间转录组
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