质谱成像(Mass Spectrometry Imaging, MSI)作为一种新型的分子影像技术,能够直接从生物组织中获得大量已知或未知的内源性代谢物和外源***物等分子的结构、含量和空间分布信息。相对于其他成像方法(如荧光成像、放射性标记成像等),该技术无需化学或放射性标记、不需复杂样品前处理,具有高特异性、高通量和空间信息保留的突出优势。质谱成像技术可以实现生物组织中上千代谢物的定性、定量和定位分析,结合生物信息学分析,发展为空间代谢组学方法,可从生物组织原位发现差异代谢物,并识别其生物学功能。鹿明生物购入空间代谢组学,并构建深度空间代谢组学的完整解决方案。山西空间代谢组学
收集了15名前列腺*患者共计45份新鲜冷冻组织**样本,进行空间代谢组学分析。从而实现对良性区域和**、NCE(包括正常腺体和增生)和**的不同组织类型的代谢组和脂质组学研究。样品和分析概述成功鉴定了 27 种代谢物和 44 种脂质,发现NCE(非*上皮细胞)、基质细胞和**组织代谢存在明显差异。欧易生物鹿明生物丰富的项目实战经验1、已落地执行项目100+,其中包括药物在组织中的分布、多种疾病类型和不同处理手段下组织中代谢物的空间成像检测。2、检测组织样本类型20+。青海空间代谢组学研究意义空间代谢组学基本研究流程。
通过空间代谢组学测量了四种转基因小鼠模型(肺*(LC)、RCC、HCC和T-ALL)中甘油磷脂(GPs)的含量,发现在不同的**中,MYC诱导改变了磷酸酰甘油(PGs)的丰度(图 4A),能够增加了大多数PG物质。MYC失活后,PG丰度恢复到基础水平(图 4B)。PGs由磷脂酸(PA)通过向3-磷酸甘油中添加两种FA形成,因此,PG诱导可以建立在MYC促进的FA增加的基础上。然而,在体内PGs相对于其他GPs的相对优先合成,这意味着MYC有除FA合成之外的其他方式调节脂肪生成。
AFADESI-MSI空间代谢组学:中文标题:一种基于分子组织学的高灵敏高覆盖质谱成像方法用于检测功能性代谢物研究对象:大鼠肾脏,大鼠脑和人食道*组织发表期刊:AdvancedScience影响因子:16.806运用生物技术:AFADESI-MSI空间代谢组学2018年11月中国医学科学院药物研究所再帕尔·阿不力孜教授、贺玖明研究员课题组在Advanced Science发表的研究论文,通过优化的空气动力辅助解吸电喷雾质谱成像(AFADESI-MSI)技术,绘制了生物样本中超过1500种代谢物的空间分布图谱,将功能代谢物的时空变化与组织结构和生物功能联系起来。本研究开发了一种灵敏且覆盖度广的AFADESI-MSI方法,用于原位分析组织上的代谢物并发现特异性生物标志物。通过非靶向分析,在大鼠脑、肾脏和人食道*组织中观察到数千种代谢物,为分子组织学研究提供了有力的分析工具。空间代谢组学找出其代谢物的差异,提供定量检测。
队列1:收集手术切除的食管腺*(EA)组织和与之匹配的健康食管上皮组织(MHEE)。队列2:收集健康食管上皮组织(来自健康志愿者,HEE)和未经***的食管炎(IEE)、巴雷特化生(BM)、巴雷特增生(BD)和食管腺*(EA)活检样本,用于发现食管腺*发展进程中甘油磷脂的变化,以及队列1的外部验证。样本制备:样本制成冰冻组织切片,并结合H&E染色。研究方法:空间代谢组学;qPCR检测甘油磷脂合成通路中基因的表达;细胞转染沉默ACYL基因;免疫组化用于分析队列1样本中脂肪酸从头合成通路关键酶的表达。空间代谢组学,代谢组数据库。青海空间代谢组学研究意义
空间代谢组技术特点。山西空间代谢组学
空间代谢组学:绘制了不同代谢物在组织内浓度的图像,直观显示了代谢物在NCE细胞、基质细胞和**细胞的浓度差异。在正离子和负离子模式下检测到的质量分别用红色加号和蓝色减号表示。组织边缘用黑色边框勾勒出轮廓,但**区域还包含一些无法单独注释的*细胞与基质的区域。ADP=二磷酸腺苷,ATP=三磷酸腺苷,GPEA=甘油磷酰乙醇胺,HBCt=羟基丁酰肉碱,HE=苏木精和伊红,LPC=溶血磷脂酰胆碱,NAA=N-乙酰天冬氨酸,PE=磷脂酰乙醇胺,PI=磷脂酰肌醇山西空间代谢组学
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