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吉林酵母文库做什么

来源: 发布时间:2023-03-01

通过传统的酵母双杂交系统,以PtDAL1为诱饵,筛选样本来源于不同年龄段的油松cDNA文库。将获得的阳性克隆,10个一组,挑选到1个96孔板的PCR板孔中,获得10*96个阳性克隆的96孔板。以其中阳性克隆mix为模板,进行PCR扩增,并将所有的PCR产物进行纯化。使用纯化后的PCR产物,进行打断后构建二代测序文库,通过NGS测序,获得6G的阳性克隆数据。通过分析二代测序数据,获得阳性克隆基因信息(去冗余后获得135个互作子,包含21个TFs,2个TRs及酶类、热激蛋白、RNA结合等蛋白,部分见表1)。挑选重要的候选基因进行一对一验证(图2)。与拟南芥中同源基因AGL6的蛋白互作网络进行比对分析。对DAL1互作蛋白(DIPs)的基因表达谱、启动子中的顺势作用元件功能进行分析,并对DIPs进行GO注释(图3)。综合生信分析结果,构建针叶树老化途径的调控模型(图4)。博士期间长期从事酵母单/双杂交文库构建及筛选的工作。吉林酵母文库做什么

酵母双杂交还可以这么用?Y2H-seq 揭示不老松年龄。***小欧又给大家带来了一篇酵母双杂交结合高通量测序技术的应用文章。北京林业大学钮世辉老师团队,在传统的酵母双杂交技术流程基础上,巧妙的结合了NGS技术,优化建立了Y2H-seq技术,**缩短了常规的筛库后测序验证周期,节约了实验成本。文章中应用Y2H-seq技术,对不老松年龄密码进行了有趣的研究,其中所用酵母双杂交文库由欧易生物协助完成。众所周知,酵母双杂交技术是研究蛋白相互作用的利器。目前已知的蛋白质相互作用至少有一半是通过酵母双杂交技术发现的。但是做过酵母杂交实验的小伙伴也都知道蛋白筛选较容易,但是筛选后,想知道获得的阳性克隆都对应的是啥基因,所花费的人力物力相当不小。有困难解决困难,勇敢牛牛不怕困难。山东酵母文库多少钱酵母文库筛库欧易生物。

酵母双杂交文库:本研究通过蓝/红光诱导青蒿中青蒿素生物合成基因的表达,使用转录组分析确定了一个WRKY转录因子AaWRKY9,可明显***青蒿素生物合成相关基因的表达。实验表明AaWRKY9通过光依赖JA信号通路调节,在青蒿素生物合成中发挥重要作用,AaWRKY9通过与AaDBR2和AaGSW1的启动子结合正向调节青蒿素的积累。此外,JA信号通路中的抑制因子AaJAZ9与AaWRKY9相互作用,并抑制其转录***活性,而在MeJA存在情况下,AaJAZ9被降解,AaWRKY9的转录***活性增加,进而促进青蒿素生物合成基因的表达。酵母双杂交文库结果表明,AaWRKY9有助于光和JA信号调节青蒿素的生物合成,为两种信号途径在植物次生代谢物合成中的整合调控提供了新见解。

水稻转录因子文库筛选服务:近几年,中国科学院分子植物科学***创新中心王二涛课题组在植物根瘤共生和菌根共生领域取得三项可以写入教科书级的研究成果。尤其是近两年,已经连续发表了Cell、Nature、MP和PNAS等高水平文章。此外,王二涛研究员也是第二届"科学探索奖"的获得者,肯定他在植物-微生物共生营养交换和菌根共生信号受体发现方面的贡献。2021年10月12日,分子植物***中心王二涛研究团队在Cell上发表题为“磷信号中枢网络调控菌根共生)”的封面论文。***绘制了水稻-丛枝菌根共生的转录调控网络,发现植物直接磷营养吸收途径(根途径)和共生磷营养吸收途径(共生途径)均是受到植物的磷信号网络统一调控,回答了菌根共生领域"自我调节"这一困扰领域的重要科学问题。欧易生物CEO肖云平先生也参与了此项研究。文中水稻转录因子文库筛选服务由欧易生物提供。酵母文库已知蛋白互作灵活定制建库。

蛋白被泛素化后(即蛋白上结合了泛素),意味着将要被运往蛋白酶体降解,一般用于降解细胞内老弱病残蛋白,再回收利用。同时也被用于排除异己,抵御外敌。该过程需要一系列酶介导:泛素***酶(E1)、泛素偶联酶(E2)和泛素E3连接酶(E3)。其中E3是起特异性识别作用的,即决定谁该被降解,不能把好同志降解掉。所以E3基因很多,植物中主要有四种类型:HECT、RING、U-box和CRLs。其中CRLs是植物中含量**丰富的E3连接酶。本研究中,通过酵母双杂交筛选到的标题蛋白MdBT2,整好是CRLs亚家族之一。因此作者推测MdBT2可能在与ApNMV1a结合后,起到了促进其泛素化和降解的作用。酵母文库筛选做文库筛选前,首先需要检测你的诱饵的自***活性和对酵母的毒性。吉林实力酵母文库

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目前,欧易生物负责该水稻转录因子文库的维护和保存工作,并对广大水稻科研工作者提供转录因子筛选服务。如去年欧易生物助力中国科学院分子植物科学***创新中心的王二涛老师应用该文库对水稻-丛枝菌根进行了深入研究,成功构建了水稻-丛枝菌转录调控网络,结果发表于《Cell》封面。截至文章发表,该文库已收录了1683个水稻转录因子,隶属于54个家族,覆盖预测的水稻转录因子总量的70%。文库中水稻转录因子的a基因信息来源于PlantTFDB和KOME数据库。文库载体使用pGADT7,酵母菌株使用Y187,每一个转录因子菌株**保存于96孔板中。吉林酵母文库做什么

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