LC-MS靶向代谢组+16S微生物多样性检测研究。题目:粪便微生物可以区分酒精性肝炎引起的酒精摄入量,但不能区分疾病的严重程度期刊:HepatologyIF=17.425研究思路:*样本类型:人粪便*检测平台:LC-MS靶向代谢组、16S微生物多样性检测为了表征酒精性肝炎有关的粪便微生物生态学,考察微生物组变化和疾病严重程度的关系,推断微生物生态学变化的功能相关性,本文作者将中度或重度酒精性肝炎患者(MAH和SAH)的粪便微生物组与健康(HC)和重度饮酒对照组(HDC)进行比较,通过16SrRNA基因测序鉴定微生物群分类,使用LC/MS平台测量粪便短链脂肪酸(SCFA)含量。重度饮酒患者与健康对照组相比、重度饮酒组与酒精性肝炎相比,均可以发现明显的微生物组特征分布。但微生物分类不能区分中度和重度酒精性肝炎。在酒精性肝炎患者中,粪便中短链脂肪酸与产生SCFA的微生物菌群均减少,可以推断出,酒精性肝炎患者的粪便微生物组有明显的变化,与酒精性肝炎的严重程度无关。**话代谢、代谢组学实验设计、数据解读分析、数据库介绍及使用流程。上海发酵液代谢组学
土壤代谢物可以间接反映微生物代谢过程的变化,使用基于GC-MS的非靶向代谢组学,在土壤样品***鉴定272种代谢物并对其进行非靶向代谢组学定量,定量结果表明AgNPs暴露***改变了土壤代谢物的分布。通过参数VIP>1.5,在土壤中鉴定出20种具有重要变化的代谢物(图3I),除少数几个代谢物上调,大多数代谢物减少,表明AgNPs暴露通常会对土壤微生物的代谢产生负面影响。土壤代谢组学可以揭示土壤微生物群落如何在分子水平上应对AgNPs并作出反应,包括毒性机制和***策略。上海发酵液代谢组学代谢组学 研究一站式服务平台。
代谢组学数据提供了COVID-19患者各阶段循环代谢物特征的综合观点,并确定了葡萄糖代谢和尿素循环的代谢重编程是COVID-19的潜在病理机制。在****病程的不同阶段,靶向宿主代谢可能是一种可行的方法。非靶向代谢组学分析中,发现队列中的样品共鉴定出2466个代谢物峰,负离子模式631个、正离子模式下的1835个;通过筛选,鉴定出240种代谢物。轻症组的代谢物与正常组部分重合,而重症组和恢复组很容易区分(图1B)。240个代谢物中有193个与COVID-19***相关(图1C)。火山图显示了不同组代谢物与正常组相比上调下调的情况(图1D);与正常组对比,***上调的代谢物:轻症组有48个,严重组有59个,恢复组有64个;***下调的代谢物:轻症组有33个,重症组有29个,恢复组有34个。使用靶向代谢组学分析;首先根据发现队列中59名受试者的血清代谢物(4个样本因体积小而被排除);定量到了199种代谢物。根据不同组的浓度,将199个代谢物分为16个簇;然后根据恢复组的代谢物是否恢复到正常水平将这些簇分为三组。
双平台代谢组学研究,2022年4月,鹿明生物合作客户中国医学科学院医药生物技术研究所李亮课题组在Environmental Pollution期刊发表了题为“Potential urinary biomarkers in young adults with short-term exposure to particulate matter and bioaerosols identified using an unbiased metabolomic approach”的研究成果,通过LC-MS+GC-MS双平台代谢组学研究方法,发现了空气中颗粒物和生物气溶胶暴露有关的尿液生物标志物,并揭示了循环暴露于清洁和污染空气环境的年轻健康人的尿液代谢特征的动态变化。鹿明生物技术支持及生信分析同事为该文章做出相应贡献,为署名作者。代谢组学热图聚类分析 火山图 散点图如何绘制。
非靶向代谢组学研究:利用番茄的自然变异确定番茄复合体中果实多酚的途径结构和代谢调控ExploitingNaturalVariationinTomatotoDefinePathwayStructureandMetabolicRegulationofFruitPolyphenolicsintheLycopersicumComplex研究对象:番茄组织发表期刊:MolecularPlant影响因子:13.164组学技术:LC-MS靶向代谢组学、GC-MS非靶代谢组(双平台代谢组学),本研究通过表征构成八种不同番茄多酚代谢网络的潜在生物合成和修饰反应,阐明了八种番茄复合体多酚生物合成的整个生物合成框架,并对相关代谢物和结构基因进行了详细注释,并运用LC-MS/GC-MS双平台代谢组学方法为辅助育种提供帮助。此外,番茄果实成熟过程中的代谢变化为今后基于遗传的代谢工程设计提供了研究方向,并为研究其他重要植物物种中特定的代谢物的功能提供了理论依据。代谢组学、空间代谢组学多组学联合分析服务。北京代谢组学测样
代谢组学研究技术与应用、代谢组学数据库。上海发酵液代谢组学
GC-MS非靶向代谢组学等研究方法:2021年10月,广东石油化工大学环境科学与工程学院孙建腾教授课题组在《Chemosphere》期刊发表的题为“Metabolomic analysis and oxidative stress response reveals the toxicity in Escherichia coli induced by organophosphate flame retardants tris (2-chloroethyl) phosphate and triphenyl phosphate”的研究成果,通过GC-MS非靶向代谢组学等研究方法,发现包括糖酵解/糖异生、磷酸戊糖代谢、嘌呤代谢、谷胱甘肽代谢、胺素代谢,丙氨酸和天冬氨酸等代谢途径被破坏。大多数差异表达的代谢物被下调,表明有机磷阻燃剂对代谢功能和关键代谢途径有抑制作用。本研究揭示了生物中有机磷阻燃剂对环境产生的风险提供了新的见解。上海发酵液代谢组学
上海欧易生物医学科技有限公司正式组建于2009-03-10,将通过提供以科研服务,科研检测,学术研究,技术咨询等服务于于一体的组合服务。业务涵盖了科研服务,科研检测,学术研究,技术咨询等诸多领域,尤其科研服务,科研检测,学术研究,技术咨询中具有强劲优势,完成了一大批具特色和时代特征的医药健康项目;同时在设计原创、科技创新、标准规范等方面推动行业发展。我们在发展业务的同时,进一步推动了品牌价值完善。随着业务能力的增长,以及品牌价值的提升,也逐渐形成医药健康综合一体化能力。欧易生物始终保持在医药健康领域优先的前提下,不断优化业务结构。在科研服务,科研检测,学术研究,技术咨询等领域承揽了一大批高精尖项目,积极为更多医药健康企业提供服务。