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北京代谢组学平台建设

来源: 发布时间:2022-11-09

GC-MS代谢组学和 LC-MS代谢组学研究:盐度的变化会影响甲壳类动物的生长、***和疾病状态。文章作者通过非靶代谢组学对青蟹适应盐度急性下降过程中的代谢变化进行了研究,利用GC-MS和LC-MS数据联合分析了青蟹应对盐度急性下降情况的主要代谢途径。研究结果表明,在急性低盐胁迫下,青蟹通过甘油磷脂代谢物调节生物膜的结构发生变化,然后通过ABCs转运蛋白运输氨基酸和碳水化合物,实现细胞内外的渗透平衡。此项研究体现了组学技术在机制研究中的重要作用。王春琳课题组深耕青蟹研究,近些年来探索青蟹对环境的适应变化也在各大期刊上发表:项目文章|iTRAQ蛋白组学助力宁波大学越冬期间拟穴青蟹代谢变化研究项目文章|两篇背靠背,王春琳、王欢课题组揭示拟穴青蟹适应盐度骤降的代谢机理非靶标代谢组学预实验,周期短,报告快,专业可信耐。北京代谢组学平台建设

代谢组学+转录组学研究:2022年2月,中国海洋大学食品科学与工程学院刘尊英教授课题组在《Foods》期刊发表的题为“Dissecting of the AI-2/LuxS Mediated Growth Characteristics and Bacteriostatic Ability of Lactiplantibacillus plantarum SS-128 by Integration of Transcriptomics and Metabolomics”的研究成果,通过转录组学和代谢组学等研究方法,发现植物乳孢杆菌可以通过AI-2/luxs介导的群体感应(QS)系统来调节其生长特性和代谢,该系统是参与食品安全的正调控因子,这将有助于研究植物乳孢杆菌的生物保护控制潜力,特别是在食品工业生物技术中的应用。浙江植物代谢组学的研究代谢组学热图聚类分析 火山图 散点图如何绘制。

双平台代谢组学研究,2022年4月,鹿明生物合作客户中国医学科学院医药生物技术研究所李亮课题组在Environmental Pollution期刊发表了题为“Potential urinary biomarkers in young adults with short-term exposure to particulate matter and bioaerosols identified using an unbiased metabolomic approach”的研究成果,通过LC-MS+GC-MS双平台代谢组学研究方法,发现了空气中颗粒物和生物气溶胶暴露有关的尿液生物标志物,并揭示了循环暴露于清洁和污染空气环境的年轻健康人的尿液代谢特征的动态变化。鹿明生物技术支持及生信分析同事为该文章做出相应贡献,为署名作者。

GC-MS非靶向代谢组学等研究方法:2021年10月,广东石油化工大学环境科学与工程学院孙建腾教授课题组在《Chemosphere》期刊发表的题为“Metabolomic analysis and oxidative stress response reveals the toxicity in Escherichia coli induced by organophosphate flame retardants tris (2-chloroethyl) phosphate and triphenyl phosphate”的研究成果,通过GC-MS非靶向代谢组学等研究方法,发现包括糖酵解/糖异生、磷酸戊糖代谢、嘌呤代谢、谷胱甘肽代谢、胺素代谢,丙氨酸和天冬氨酸等代谢途径被破坏。大多数差异表达的代谢物被下调,表明有机磷阻燃剂对代谢功能和关键代谢途径有抑制作用。本研究揭示了生物中有机磷阻燃剂对环境产生的风险提供了新的见解。读懂代谢组学 代谢组学的研究范畴。

GC-MS非靶向代谢组学研究,2022年2月,上海市农业科学院食用菌研究所鲍大鹏研究员课题组在《Frontiers in Microbiology》期刊发表的题为“Oxidative Stress and Autophagy Are Important Processes in Post Ripeness and Brown Film Formation in Mycelium of Lentinula edodes”的研究成果,通过iTRAQ标记定量蛋白组学、GC-MS非靶向代谢组学等技术对香菇菌丝进行定量蛋白质组学和代谢组学分析,发现氧化应激和自噬是香菇菌丝后熟转色重要过程,并对其在蛋白质组和代谢组水平上的分子机制有了新的认识。中文标题:氧化应激和自噬是香菇菌丝后熟转色形成的重要过程发表期刊:FrontiersinMicrobiology影响因子:5.64作者单位:上海市农业科学院食用菌研究所涉及的欧易/鹿明生物服务产品:iTRAQ标记定量蛋白组学、GC-MS非靶向代谢组学。代谢组学分析 代谢组学检测 代谢组学价格 代谢组学数据分析流程 。江苏代谢组学.ppt

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非靶向代谢组学研究:利用番茄的自然变异确定番茄复合体中果实多酚的途径结构和代谢调控ExploitingNaturalVariationinTomatotoDefinePathwayStructureandMetabolicRegulationofFruitPolyphenolicsintheLycopersicumComplex研究对象:番茄组织发表期刊:MolecularPlant影响因子:13.164组学技术:LC-MS靶向代谢组学、GC-MS非靶代谢组(双平台代谢组学),本研究通过表征构成八种不同番茄多酚代谢网络的潜在生物合成和修饰反应,阐明了八种番茄复合体多酚生物合成的整个生物合成框架,并对相关代谢物和结构基因进行了详细注释,并运用LC-MS/GC-MS双平台代谢组学方法为辅助育种提供帮助。此外,番茄果实成熟过程中的代谢变化为今后基于遗传的代谢工程设计提供了研究方向,并为研究其他重要植物物种中特定的代谢物的功能提供了理论依据。北京代谢组学平台建设

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