2021年12月，南京农业大学动物医学学院杨倩教授及生命科学学院林建副教授，于Cell＆Bioscience(IF:7.133) 在线发表了IBDV ***鸡法氏囊的单细胞测序的***研究成果。研究工作内容的主要承担者为Abid Ullah Shah博士。欧易生物提供高通量单细胞转录组测序（10x Genoimics单细胞转录组测序）技术支持。该研究从鸡传染性法氏囊病毒的鼻腔***入手，一方面***阐述了IBDV 通过鸡鼻腔传播至法氏囊的传播途径及病毒***主要靶细胞；另一方面，研究初步阐明家禽细胞应用RNAi抵抗IBDV的分子机制，为高效防控家禽RNA病毒奠定理论基础。单细胞测序数据的背景噪声大。单个细胞 RNA 含量很少，扩增和捕获效率的微小变化。重庆效果单细胞测序
单细胞悬液制备难于标准化。
基于酶学的样本处理方法，大都会存在一定程度的解离偏好性，即不同的酶处理不同的组织往往会有不太一样的「效果」，而这种效果不仅*反应在细胞得率，细胞活性和细胞碎片等参数上，往往也会在**终细胞类型有所反映，比如可能会导致部分稀有细胞的丢失，细胞比例的失真等，从而偏离组织的真实状态。另外，细胞悬液的制备过程较长，通常需要3-5小时，这个过程会导致细胞处于「应激状态」中，转录的过程可能已经发生变化，偏离临床实验的终点设计，会对结果的判断造成一定的影响。针对如上问题，欧易团队从已发表的高影响力的文献中，汇总出针对不同类型组织的处理方法，确保实验结果与文献并轨（同频）。对于应激问题，我们也开发出了低温解离方法，使样本始终处于「休眠」状态，从而保证了样本符合临床取样终点，还原其生物学的真实状态。另外细胞核测序也是一个替代的选择，对样本的要求较低，可以解锁大量临床信息明确、低温冷冻的标本。细胞核制备也不依赖于酶学，全程在低温环境，也能真实还原样本的临床状态。欧易在细胞核测序的核悬液准备上积累了很多经验。 安徽效果单细胞测序单细胞蛋白组和代谢组受制于质谱仪器的灵敏度，目前还存在一定的难度。
肝*是全球**相关死亡的第四大原因，肝细胞*（HCC）是肝*的主要形式。目前对于肝*的***手段通常是手术切除，但较高的术后复发率降低了患者的生存率，尤其是术后 2 年内的早期复发占整体 HCC 复发病例的 70%。本研究中作者通过单细胞转录组测序对原发及早期复发性 HCC 患者的**微环境进行深入探索，试图发现更有效的***策略。 材料：原发及早期复发性肝细胞***及配对*旁组织 期刊：Cell 方法：MIRALCS, 10x Genomics 影响因子：38.635 研究目的：描述原发及早期复发性 HCC **微环境特征。
欧易生物单细胞测序近期高分文章不断，在接下来的几篇单细胞文献解读软文里，我们将为大家持续送上近期合作发表的单细胞文献解读。本篇文章为大家解读今年5月由上海交通大学附属上海市第一人民医院刘堃团队在Diabetes(IF9.461)期刊发表的关于2型糖尿病小鼠视网膜组织的分子图谱和异质性的相关成果。
材料：3只2型糖尿病模型小鼠(db/db)；3只对照小鼠(db/m)的视网膜组织
期刊：Diabetes
发表时间：2021年5月
方法：欧易生物10xGenomicsscRNA-seq 早期受技术限制，单细胞层面的研究往往***在单个细胞或者微量群体细胞水平，能够检测到的信息相对有限。
h5Seurat 文件格式是专门为存储和分析多模态单细胞和空间表达数据而设计的，比如 CITE-seq 或 10X Visium 技术。它能够保存所有分子信息和相关描述的数据，包括降维信息、空间坐标以及细胞群标签等。HDF 是用于存储和分发科学数据的一种自我描述、多对象文件格式。HDF 由美国国家超级计算应用中心（NCSA）创建，以满足不同群体的科学家在不同工程项目领域之需要。后来由一个非盈利组织 HDF Group 支持，其版本包括了 HDF4 和现在大量使用的 HDF5。过去 5 年里，单细胞测序技术的快速发展极大地加速了生物医学领域的相关研究。陕西单细胞测序报价
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