蛋白组学技术可以提供细胞状态和调控的功能信息，本研究建立了单细胞蛋白组学方法，实现了高灵敏度的蛋白组学检测。该技术有助于揭示疾病的发病机制，探讨预后和风险相关的不同肾脏疾病亚型中的蛋白组学异质性和独特的蛋白标志物，为药物靶点***提供希望。大规模单细胞分析对于捕获复杂细胞系统中的生物异质性至关重要，但*基于RNA技术的单细胞转录组学数据并不能很好地**蛋白质水平上的变化。而单细胞蛋白组学技术能够从蛋白质水平上破译细胞机制并且获得更多的信息。蛋白组学研究必看的经典综述。辽宁蛋白组学火山图

4D蛋白质组学分析发现，不同的病因和疾病的严重程度中蛋白表达存在差异。严重的疾病同急性期的蛋白的增加，补体系统蛋白及功能相关的蛋白相关；通过COVID-19和健康组对比，发现了49%的差异分析物；和脓毒症相比，G-CSF，IL-8等在严重的COVID-19患者中含量更低；蛋白和临床相关性分析则发现临床特征和某些蛋白呈强相关性。本研究通过4D蛋白组学技术结合其他组学技术及免疫技术，确定了COVID-19免疫特征和宿主反应等相关因素，并为进一步COVID-19的***打下了良好的基础。山东蛋白组学与代谢组学4D-蛋白组+代谢组双平台知识干货带您。

本研究通过生理和蛋白质组学分析在冬油菜中鉴定了大量的冷胁迫响应蛋白。探讨了冬油菜耐冻性增强的机理和低温胁迫对冬油菜形态和生理生化变化的影响。文章以耐冻型Longyou 7和冷敏感型Lenox为材料，通过iTRAQ标记蛋白组学和转录组学分析，揭示了谷胱甘肽转移酶活性、碳水化合物结合和谷胱甘肽结合、代谢过程及IAA反应与冷应激反应密切相关，鉴定出了Longyou 7和Lenox之间的DAPs，这些DAPs参与氨基酸、碳水化合物、脂质和能量代谢，对提高冬油菜的耐冻性发挥了重要作用。

作者通过泛素化蛋白组学分析鉴定了茶树作根中的泛素化蛋白质。中文标题：氮调节茶树根中茶氨酸和黄酮类化合物的生物合成：多组学分析揭示的蛋白质水平调节研究对象：茶树根发表期刊：JournalofAgriculturalandFoodChemistry影响因子：5.279发表时间：2021年9月1日发表单位：安徽农业大学运用生物技术：TMT蛋白质组学、泛素化蛋白质组学(其中部分数据分析由鹿明生物提供技术支持)。本文分析了氮缺乏下茶树根部的茶氨酸和黄酮类代谢，通过蛋白质组和泛素化蛋白质组结合转录组数据探索了调节机制。本文的多组学数据整合分析思路值得借鉴。定量蛋白质组学 蛋白质进行质谱检测未知蛋白进行全检测。

作者运用iTRAQ标记定量蛋白组学对种子发育过程中蛋白质表达的定量比较，同时进行GO和KEGG通路富集分析。结果表明所有鉴定的蛋白被分为29类，主要涉及翻译和碳水化合物代谢。并且作者绘制了p值小于0.01的前20条KEGG通路的气泡图。在三对比较中，普遍富集的途径包括脂肪酸降解、苯丙素生物合成和脂肪酸代谢。其中，参与α-亚麻酸代谢的DAPs在S3 vs. S1组和S4 vs. S1组中都非常活跃。为了评估转录组和蛋白质组之间的一致性，以及了解转录后的mRNA在蛋白质水平上是如何表现的，作者进行了RNA-seq和iTRAQ分析的联合分析。证明DEGs和DAPs参与类黄酮的生物合成和脂肪酸代谢。蛋白质组学多组学分析蛋白质组学研究进展。浙江蛋白组学差异

蛋白组学常见研究模式,蛋白样本准备注意事项以及经典案例解读。辽宁蛋白组学火山图

TMT标记定量蛋白质组学研究案例：2021年12月威尔康奈尔医学中心和纪念斯隆凯特琳**中心的Linda T. Vahdat 和 Vivek Mittal教授课题组在Nature Communications期刊发表的题为 “Copper depletion modulates mitochondrial oxidative phosphorylation to impair triple negative breast cancer metastasis”的研究成果，通过蛋白质组学和代谢组学研究方法，发现了高度转移性 SOX2/OCT4+ 细胞的离散亚群表现出细胞内铜水平升高特征，探究了TM 介导的复合物 IV 失活确定为 SOX2/OCT4+ 细胞群中的主要代谢缺陷，AMPK/mTORC1 能量传感器为重要的下游途径。描绘了铜-代谢-转移轴，为高风险三阴性乳腺*患者的下一代治疗方法提供了理论依据。中文标题：铜耗竭调节线粒体氧化磷酸化以损害三阴性乳腺*转移研究对象：高风险三阴性乳腺*(TNBC)发表期刊：NatureCommunications影响因子：14.919发表时间：2021年12月合作单位：纪念斯隆凯特琳**中心，Sandra和EdwardMeyer**中心运用关键生物技术：TMT标记定量蛋白质组学和靶向代谢组学辽宁蛋白组学火山图

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