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吉林蛋白组学技术

来源: 发布时间:2022-06-24

综上所述,本研究应用RNA-seq转录组分析结合iTRAQ蛋白质组学技术,探讨油茶种子不同成熟期储量积累的动态变化。此外,作者还探讨了黄酮类化合物和脂肪酸的生物合成和代谢可能的调控机制。许多功能转录本(16530)和蛋白质物种(1228)的模式发生了***变化,其中317个DAPs被转录组结果覆盖。结合结构基因(蛋白)或转录因子的表达谱及相应化合物的含量,对重要代谢产物的调控网络进行了探讨。结果表明,黄酮类化合物的合成能力在种子成熟过程中逐渐减弱,而脂肪酸的合成能力则先升高后下降。蛋白组学翻译后修饰筛选,检测,鉴定,定性,定量。吉林蛋白组学技术

运用生物技术:TMT标记定量蛋白质组学、PRM蛋白靶向验证由鹿明生物提供技术支持:2021年12月,上海交通大学张荻课题组在Frontiers in Plant Science发表题为 TMT-Based Quantitative Proteomic Analysis Reveals the Physiological Regulatory Networks of Embryo Dehydration Protection in Lotus(Nelumbo nucifera)的研究成果,通过TMT标记蛋白质组学和平行反应监测蛋白靶向验证(PRM)技术研究方法,构建了莲花胚胎脱水保护的生理调控网络。为揭示荷花种子长寿的脱水保护机制提供了新的见解。吉林蛋白组学技术蛋白质组学,Label Free/iTRAQ/dia/MRM/PRM。

蛋白质是生命活动的主要执行者,而蛋白质磷酸化修饰是生物体内**重要的共价修饰方式之一,真核生物体内有超过三分之一的蛋白可以发生磷酸化修饰。蛋白质的磷酸化和去磷酸化这一可逆过程调节着包括细胞增殖、发育、分化、信号转导、细胞凋亡、神经活动、肌肉收缩及**发生等过程在内的所有生命活动。单一的磷酸化蛋白质组学只能解释蛋白磷酸化水平发生的变化,而[黄金搭档]——蛋白质组与磷酸化蛋白质组联合分析,则在揭示疾病相关特性、筛选疾病生物标志物、寻找药物靶点等方面发挥了更加重要的作用。

采用RNA-Seq转录组学分析和DIA蛋白质组学分析,研究了AC和AL对db/db小鼠的影响。转录组分析共鉴定出16812种不同的蛋白质编码转录本。其中,2837个(约16.9%)在正常组和对照组之间有***差异,表明db/db小鼠在转录水平上与野生型小鼠***不同。与对照组相比,共有3749个基因因摄入AC而发生***改变(2201个下调,1548个上调),560个基因(430个下调,130个上调)因摄入AL而发生***改变(图3B)。DIA蛋白质组学分析鉴定出2729种蛋白质。正常组和对照组之间共发现1059个(约占总鉴定蛋白质的38.8%)DEPs,AC处理有230个蛋白质发生***变化(109个上调,121个下调),AL处理有211个蛋白质发生***变化(116个上调,95个下调)。蛋白组学近期研究进展的盘点。

蛋白质组定量到了10,529种蛋白质,磷酸化蛋白质组定量到了来自9,832个磷酸化蛋白的62,879个磷酸化位点。基因组确定了包括TP53、KRAS、FGFR2、IDH1/2、BAP1、ARID1A和PBRM1在内的16个***改变的**驱动基因(图1A)。与西方iCCA人群队列相比,本文队列显示出更高的KRAS突变频率和更低的IDH1、ARID1A和TERT突变频率(图1B)。在FU-iCCA队列中观察到黄曲霉***和马兜铃酸特征(图1C)。通过比较具有或不具有黄曲霉***特征的所有**的多组学数据,发现具有黄曲霉***特征的**显示出DNA修复和细胞周期通路的上调以及细胞凋亡、***炎症和免疫通路的下调(图1E)。进一步分析显示,TP53突变与黄曲霉***特征***相关(图1F和1G)。蛋白组学—精选文章推荐。北京蛋白组学

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中文标题:肉桂酸和肉桂醛改善肝葡萄糖脂代谢的机制:多组学提供的见解研究对象:小鼠发表期刊:FrontiersinNutrition影响因子:6.576发表时间:2022年1月11日合作单位:北京中医药大学健康培养教育部重点实验室,北京中医药大学健康栽培北京市重点实验室,北京中医药大学科学技术系运用组学关键技术:转录组学、DIA蛋白组学、PRM靶向蛋白验证(皆由欧易/鹿明生物提供技术支持)。目前,改善饮食被认为是**安全有效的***和预防代谢性疾病的方法,其中肉桂(主要是肉桂属植物八角肉桂和桂皮)及其成分被证明具有多种***作用,包括抗糖尿病、减轻体重、低脂血症和增强胰岛素敏感性。因此,使用膳食补充剂和来自肉桂的化学物质来控制血糖和血脂可能成为***代谢类疾病的新方法。吉林蛋白组学技术

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