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华南地区进口数字PCR技术

来源: 发布时间:2023-04-06

常规PCR和实时荧光PCR定量检测都需要已知拷贝数的标准DNA制定标准曲线,由于样品测定在各种条件上不会完全一致,会造成PCR扩增效率的差异,从而影响定量结果的准确性。而ddPCR不受标准曲线和扩增动力学影响,可以进行定量。如何在双通道设置及双探针标记的情况下实现多重检测?不同位点的双探针检测体系中引物和探针采用不同的终浓度,这样阳性微滴的终点FAM/HEX荧光信号强度就会不同,利用阳性微滴不同的“分簇(cluster)”来区分不同的突变位点。采用对应的KRAS野生型和突变型细胞系对双重ddPCR检测体系的性能进行验证。结果显示除了Q61H位点外,其他位点的检测体系在54C的情况下均能很好的区分4个明显的cluster。三重ddPCR检测体系存在的问题:不同位点检测体系之间的cross-reactivity。华南地区进口数字PCR技术

产物越短,往往扩增效率越高。模板二级结构(Templatesecondarystructure):PCR变性中和变性后的单链DNA不够稳定,容易自发折叠形成二级结构。应避免可形成稳定二级结构的模板链区域,因为如果模板链形成的二级结构在退火温度下稳定存在,定位在模板链二级结构处的引物将无法同模板链相结合。使用mfold可预测引物待结合的区域是否存在复杂的二级结构。设计引物时,尽量使引物定位在模板二级结构以外的序列上。避免具有4个以上相同的连续碱基的区域(Avoid>4repeatsofsamebases):以避免延伸阶段聚合酶“滑动(PolymeraseSlippage)”。选择GC含量(GCContent)在50-60%之间的区域。如果高GC含量区域不可避免,可以尝试提高退火温度,并使用添加剂,例如甘油,珠三角全自动多重数字PCR试剂盒目前dPCR中体积优化方法以光学显微镜观测为主。

PCR已成为分子诊断领域重要的技术手段之一,占据分子诊断市场的半壁江山。数字PCR是一代PCR技术,也是当前灵敏度和定量精度比较高的分子检测技术。但数字PCR使用成本仍然相对较高,检测靶点数少(一般≤6靶点/反应),阻碍了其在临床中的大规模应用,提高数字PCR的多重检测能力迫在眉睫。基于荧光通道数的增加和基于探针浓度梯度增加,均可以在一定程度上提高数字PCR检测重数,然而只能达到"线性"增加的目的。基于探针浓度梯度的多重检测技术虽然光'f明显增加多重能力,但由于无法避免交叉反应现象,不能确保获得位点特异性的分簇,因此稳定性不足、灵敏度较差,难以满足临床级别的数据要求。而基于创新的且数字PCR独特适用的荧光编码技术可以实现“指数”级的多重检测,颠覆性的提高数字PCR检测重数,覆盖临床应用多场景需求。

数字PCR系统的分散方式决定了分散数量,其结果基于统计的方法进行定量,增加反应单元数量(统计样本量),可以增加其检测的容量和动态检测线性范围达到和qPCR相近的动态范围,同时减小一个反应单元中包含多个分子所造成的误差,达到提高灵敏度和准确度。影响dPCR定量结果的因素包括:仪器采用的分散方式与数量、溶液稀释方法、分散体积的准确性以及结果表达方式。分散方式与数量由数字PCR系统决定,分散体积和结果表达方式需要实验人员在实验过程中优化得到。20世纪末,Bert Vogelstein等提出数字PCR的概念。

基于微滴的QX100dPCR仪,利用油包水技术,将样品平均分配到20000个微滴油包水中,利用微滴分析仪对微滴进行分析。2012年RainDance公司推出了RainDropdPCR仪,在高压气体驱动下,将每个标准反应体系分割成包含100万至1000万个皮升级别微滴的反应乳液。数字PCR就形成了2大派别,芯片式和微滴式。不论是哪种数字PCR,其原理都是有限稀释,终点PCR和泊松分布。将含有核酸模板的标准PCR反应体系,平均分配成几万个PCR反应,分配到芯片或微滴中,使每个反应中尽可能含有一个模板分子,进行单分子模板PCR反应,通过读取荧光信号的有或无进行计数,经过统计学泊松分布的校准进行定量。数字以灵敏度和准确度测量突变的变异程度、检测稀有的DNA靶拷贝以及解析拷贝数变?异状态。苏州全自动多重数字PCR分析应用

数字PCR是定量技术,基于单分子PCR方法来进行计数的核酸定量,是一种定量的方法。华南地区进口数字PCR技术

精细化学品主要应用于农业、建筑业、纺织业、医药业、电子设备等行业。随着下游各行业的进一步发展,对精细化工材料的需求数量上升,性能要求进一步提高,精细化工行业与下**业之间的关系变得更加紧密。精细化工中间体产品**性强,需要建立特定销售渠道,能否与客户保持长期业务合作,将对服务型企业日常经营和长远发展构成重大影响。精细化工中间体的质量和纯度直接影响到终端产品的性能和品质。近年来,世界主要大型农药、医药生产企业为了节省销售研发支出,提高效率,降低危险,纷纷将产品战略的重点集中于**终产品的研究和市场开拓,而将涉及大量专有技术的中间体转向对外采购,充分利用外部的优势资源,重新确认、配置企业的内部资源。随着社会经济的进一步发展,人们对电子、汽车、机械工业、建筑新材料、新能源及新型环保材料的需求将进一步上升,电子与信息化学品、表面工程化学品、医药化学品等将得到进一步的发展,全球范围内精细化学品市场规模将保持高于传统化工行业的速度飞速增长。华南地区进口数字PCR技术

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