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美国进口数字PCR系统

来源: 发布时间:2023-02-28

现有dPCR分析方法采用荧光探针和基于光的检测方法来鉴定扩增产物。这些方法要求足够的靶分子扩增以产生足以被检测到的信号,但可能会导致额外的错误或偏差,因此,希望能够提供一种改进的、用于检测样品内感兴趣的核酸的方法,其采用替代性分析方法,具有提高的准确度和精确度,并且其具有可以与基于dPCR的方法关联使用的灵敏度。dPCR还在样品内进行单一反应,但是所述样品被分离成大量的分区(partition),并且所述反应在每个分区中单独进行。这种分离允许对核酸量进行灵敏的测量。DPCR已被证明可有效用于研究基因序列中的变异,例如拷贝数变异或点突变。dPCR被称作第三代PCR技术,但dPCR技术的广泛应用逐渐显现出一些不足之处。美国进口数字PCR系统

作为时下的热点技术,数字PCR是将核酸样品分配到大量单独、平行的微反应单元(nL,纳升级别)中,使得每个反应单元中尽可能含有1个模板分子,并在此基础上进行扩增、检测和分布统计,从而实现靶标分子的比较 计数。(图:数字PCR技术原理)根据微反应单元的不同形式,数字PCR产品可分为微板式、微滴式和芯片式等。目前,市场上主要的数字PCR产品主要是基于微滴式和芯片式,如Bio-Rad公司的QX200微滴式系统和ThermoFisher公司的QuantStudio系统等。与一、二代PCR技术相比,数字PCR具有很多优势:一是特异性、灵敏性均有显著提高;二是在不依赖内参和标准曲线的前提下,可直接得到比较 量化指标;三是微反应单元相互独立、封闭,避免了PCR抑制剂及不同核酸分子扩增产物间的相互干扰,准确度和可重复性较高。数字PCR性能特点PCR本质上是将一个传统的PCR反应分成了数万个PCR反应。

微滴数字PCR主要是将两种互不相溶的液体,以其中一种作为连续相(油),另一种作为分散相(水),在水/油两相表面张力和剪切共同作用下分散相以微小体积单元的形式存在于连续中,从而成液滴。这种液滴式的反应腔室具有体积小、样品间无扩散等优势。在ddPCR中,利用微滴发生器可以一次生成数万乃至百万个纳升甚至皮升级别的单个油包水微滴,作为数字PCR的样品分散载体。这里,液滴中包裹了单拷贝DNA模板和PCR反应液,然后将液滴收集在PCR反应管中进行扩增。?PCR反应结束后检测每个微滴的荧光信号。目前Bio-Rad公司的QX100系统、QX200系统均为采用液滴技术的数字PCR系统。图6.Bio-Rad的液滴数字PCR系统

在PCR进行的过程中,首先是引物和探针分别结合,然后开始扩增。如果一个微滴当中有目标基因的片段,Taqman探针就会被酶切碎,荧光基团和淬灭基团分离。在后面的检测过程中,荧光基团被激发光路激发之后就会发荧光。如果没有,Taqman探针就不会被切碎,在后面的检测过程中,荧光基团吸收到激发光的能量,就会被淬灭基团给淬灭,那么仪器就检测不到这个微滴的信号。检测的过程中,并不是说一个样本中检测到了几个亮点,这个反应当中就有几个目标基因的拷贝。因为目标基因的片段,在微滴当中的分布,是符合泊松分布的(也就是说进不进的概率相等,并且相互独立)。所以,一个发光的微滴中,可能有一个或者三个四个,甚至更多个目标基因的拷贝。因此,发光的微滴数与原始的基因拷贝数并不是一对一的对应关系。杨雁峰博士坚信数字PCR是可以应用于无创产前筛查的理想技术之一,这也是他2016年创立塔歌生物的初衷。

naica®六通道微滴芯片数字PCR系统,源于crystal微滴芯片数字PCR技术,自动化微滴生成和扩增,每个样本孔可实现6荧光通道的检测,智能化识别微滴并进行质控,3小时内即可获得至少6个靶标基因的一定程度上拷贝数浓度,融合传统微滴式和芯片式优势,被称为下一代数字PCR技术。只需一步移液操作,将PCR反应液加载于创新型微流控芯片,naica®六通道微滴芯片数字PCR系统即可自动生成单层平铺的2D微滴阵列,随后对每个微滴进行温度均匀一致的PCR扩增后,进行六通道荧光信号采集,计数阴阳性微滴,通过泊松分布计算获得靶标基因一定程度上拷贝数浓度。影响dPCR定量结果的因素:仪器采用的分散方式与数量、溶液稀释方法、分散体积的准确性以及结果表达方式。广州进口数字PCR样品回收

dPCR的结果统计方式有2种,一种是采用标记多种颜色,另一种采用概率统计的数据处理方法。美国进口数字PCR系统

数字PCR产品的发展,为不同场景下的多样化核酸检测需求提供了新的思路,尤其是在医学检验方面,在 性疾病早期检测、病症的液体活检、无创产前检查等领域展现出良好的应用前景。实现 性疾病早期高效检测——以病毒为例,有病毒检测、和临床样本病毒载量评估He监测环境病毒载量二代荧光定量PCR检测技术是目前病毒检测的"金标准",但由于病毒探针结合位点突变、样本病毒载量不足等原因,在临床检测过程中经常出现假阴性结果,由于数字PCR具有更高的灵敏度、精细度,以及其适合痕量样本检测的特性,能够检测出荧光定量PCR检测过程中错过的 ,可作为后者的补充。在人群筛查及临床诊疗中,为科学选取采样方式,需要评估不同临床样本病毒载量,如鼻咽拭子、血尿、粪便、肺泡灌洗液等,由于数字PCR可提供一定程度上量化指标,为采样方法的选取提供了参考,从而提高检出率。在外防输入的战略要求下,环境病毒检测工作尤为重要,数字PCR可对低核酸丰度样本进行有效检测,包括从不同环境中取样的样本,如病房、医院卫生间、实验室等等,在病情防控中起到了不可忽视的作用。此外,数字PCR的应用场景还有病程不同阶段的病毒载量评估、核酸参考品制备、抗病毒药物研发等环节。美国进口数字PCR系统

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