并含有能用于探针捕捉杂交实验的足够信息。这一长度范围的产物可以通过采用两步扩增循环方法得到,从而减少扩增时间。其他PCR方法有不同的佳产物长度。例如,通过定量的RNA-PCR检测基因表达时,产物应该足够大以便构成竞争性模板,这样,产物和竞争物都能够在凝胶上很容易的分辨出来。这些产物一般在250~750bp范围内。⑦补充说明若在cDNA序列内找寻PCR引物,需特别注意两点:首先,尽力将引物和产物保持在mRNA的编码区域内,因为这是生成蛋白质的独特序列,不像3’末端非编码区域与许多其他mRNA有同源性;第二,尽力把引物放在不同的外显子上,以便使RNA特异的PCR产物与从污染DNA中产生的产物在大小上相区别。若PCR的目的是克隆一个基因或cDNA的特异序列,产物的大小是根据具体应用预选的。在这里,计算机程序可以提供关于期望区域侧翼选择引物对的信息。在选择用来扩增来自不同物种DNA的引物时,应避开mRNA的5’和3’末端非翻译区序列,因为它们可能没有任何的同源性。3.简并引物设计①设计简并引物时,一定要检查靶扩增区域选定氨基酸遗传密码的简并度。很显然,我们期望选择简并度低的氨基酸,达到提高特异性的目的。②充分注意物种对于密码子的偏好性。 PCR技术不仅可用于基础研究,还适用于日常的临床诊断、法医学调查和农业生物技术研究。国产PCR仪厂家供应
而引物3’末端后5到6个核苷酸的错配应尽可能的少。如果3’末端的错配过多,通过降低反应的退火温度来补偿这种错配不会有什么效果,反应几乎注定要失败。引物3’末端的另一个问题是防止一对引物内的同源性。应特别注意引物不能互补,尤其是在3’末端。引物间的互补将导致不想要的引物双链体的出现,这样获得的PCR产物其实是引物自身的扩增。这将会在引物双链体产物和天然模板之间产生竞争PCR状态,从而影响扩增成功。引物3’末端的稳定性由引物3’末端的碱基组成决定,一般考虑末端5个碱基的ΔG。此值的大小对扩增有较大的影响,负值大,则3’末端稳定性高,扩增效率更高,同时也更易于异位引发。需要注意的是,引物3’末端应尽量避免T。实验证明,以T结尾的引物即使与T,G或C错配仍可有效延伸。⑥PCR产物的长度及在耙序列内的位置所有的计算机程序都提供对PCR产物长度范围的选择。一般说来,PCR产物长度对扩增效率有影响。特定的应用情况下,PCR产物长度部分取决于模板材料。预期产物的特定长度经常取决于应用的需要。若目的是建立测定特异DN段的临床检验方法,120~300bp的小DNA扩增产物可能是好的。产物应具有好的特异性和高的产生效率。 力康高校科研PCR仪厂家直供PCR扩增过程中,荧光定量PCR仪通过荧光信号,对PCR进程进行实时检测。
选择该物种使用频率高的密码子,以降低引物的简并性。③应努力避免3’末端的简并,对于大多数氨基酸残基来说,意味着引物3’末端不要位于密码子的第三位。④在一些多义位置使用脱氧次黄嘌呤(dI)代替简并碱基。4.测序引物设计当然,测序引物的设计一般都由测序公司来完成,如果需要自己设计的话;那么除了按照上面所提到的引物设计通用标准外,还需要注意两点:①测序引物的特异性的标准掌握应该更严格一些,也就是说设计时更优先考虑特异性。因为在测序反应中,如果引物与模板在非预期位置退火并引发链延伸,会对结果对来很大的干扰甚至造成结果无法识读。②测序引物的Tm值适当高一些。现在大部分测序反应均选用耐热的测序级DNA聚合酶来催化,并采用PCR的热循环程序。选用的测序引物的Tm值稍高一些,有助于使反应顺利跨过待测模板的二级结构区,也有助于降低非特异反应。5.探针的设计探针的设计,根据不同的用途各有其设计特点,这里只是就通用的原则进行讨论:①探针的长短一般在20-50核苷酸之间,过长合成成本高,且易出现聚合酶合成错误,杂交时间长。太短则特异性下降。②注意G和C的含量努力控制在40-60%,同时一种碱基连续重复不超过4个,以免非特异性杂交产生。
在净化车间内工作的人员应穿着符合要求的工作服。工作服的选材、式样及穿戴方式应与生产操作和空气洁净度级别要求相适应,并不得混用。洁净工作服的质地应光滑、不产生静电、不脱落纤维和颗粒性物质。无菌工作服必须包盖全部毛发、胡须及脚部,并能阻留人体脱落物。不同空气洁净度级别使用的工作服应当分别清洗、整理,必要时消毒或灭菌。工作服洗涤、灭菌时不应带入附加的颗粒物质。工作服应制定清洗周期。进入各个区域必须严格按照单一方向进行,不同的工作区域使用不同的工作服(例如不同的颜色)。工作人员离开时,不得将工作服带出。实验室应建立、执行人员进出洁净区的清洁程序和管理制度,人员清洁程序合理。实验室需要至少配备两名专业实验员,能够处理样品、提取核酸及核酸扩增,熟练掌握超净工作台、生物安全柜、自动提取仪、实时荧光定量PCR的使用,加强生物安全方面的培训,避免实验室污染。荧光定量PCR仪是以荧光染料或荧光标记探针侦测每次聚合酶链锁反应(PCR)循环后产物总量。
1993年,美国科学家Mulis众望所归地获得了诺贝尔化学奖,他所取得的成就是发明了PCR技术。PCR,中文译为聚合酶链式反应,其实是一种DNA的快速扩增技术,其扩增效率之高就象核裂变的“链式反应”那样。PCR技术通过两个短的称为引物的DNA小片段和一种耐热的酶的作用,可以在3个小时内把特定的DNA量提高1000万倍。这种技术一问世,立刻引起了分子生物学研究的一场**,人们利用这种轰动全世界的技术很快就把微观领域的生物学研究地往前推了一步。可以这么说,PCR技术使分子生物学研究一下子获得了突破,而且随着PCR技术的日趋完善,PCR在人类社会生活中的应用也越来越。比如说在“DNA指纹”中我们提到,科学家们只需要一根头发甚至一个细胞就可以完成DNA指纹的鉴定工作,这里实际上就要采用PCR技术,因为一个细胞中的DNA含量实在太少了,人们根本不可能检测到它的指纹;有了PCR技术就好办了,通过PCR技术把这个细胞中的DN断扩增1000万倍,这样DNA量就足够作指纹鉴定了。再比如,在医院里检验血液中的某种病毒,有时病毒量极少(例如病毒携带者),通过传统的检查方法费力又费时,这时PCR技术也许就可以帮上忙。可以先选定这种病毒DNA上的一段DNA,设计合适的引物DNA。 PCR扩增仪通常由热盖部件、热循环部件、传动部件、控制部件和电源部件等部分组成。上海实验室PCR仪价格便宜
实时荧光定量PCR仪主要应用于临床医学检测、生物医药研发、食品行业、科研院校等。国产PCR仪厂家供应
PCR仪的基本原理类似于DNA的天然复制过程,其特异性依赖于与靶序列两端互补的寡核苷酸引物。PCR由变性--退火--延伸三个基本反应步骤构成:1、模板DNA的变性:模板DNA经加热至93℃左右一定时间后,使模板DNA双链或经PCR扩增形成的双链DNA解离,使之成为单链,以便它与引物结合,为下轮反应作准备;2、模板DNA与引物的退火(复性):模板DNA经加热变性成单链后,温度降至55℃左右,引物与模板DNA单链的互补序列配对结合;3、引物的延伸:DNA模板--引物结合物在TaqDNA聚合酶的作用下,以dNTP为反应原料,靶序列为模板,按碱基配对与半保留复制原理,合成一条新的与模板DNA链互补的半保留复制链重复循环变性--退火--延伸三过程,就可获得更多的“半保留复制链",而且这种新链又可成为下次循环的模板。每完成一个循环需2~4分钟,2~3小时就能将待扩目的基因扩增放大几百万倍(Plateau)。到达平台期所需循环次数取决于样品中模板的拷贝。在此同时认识到蛋白质是接受RNA的遗传信息而合成的。50年代Zamecnik等在形态学和分离的亚细胞组分实验中已发现微粒体(microsome)是细胞内蛋白质合成的部位。 国产PCR仪厂家供应
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