对特定类型基因修饰细胞产品的特殊考虑鉴于基因修饰细胞的产品种类繁多、各有特点,除上述一般技术要求外,还应基于产品的特性进行相应的特殊考虑。本指导原则列举了以下三种情形的特殊考虑。CAR或TCR修饰的免疫细胞对于嵌合抗原受体(Chimericantigenreceptor,CAR)或T细胞受体(Tcellreceptor,TCR)修饰的免疫细胞,应尽可能采用多种方法评估其靶点相关毒性和脱靶毒性风险。对于靶点相关毒性,应采用体外方法深入分析靶点在人体qiguan、组织和细胞中的表达分布情况,基因表达分析库和文献调研也可能会有助于阐明靶点在不同病理生理状态下的表达是否存在差异。应采用表达和不表达靶抗原的细胞作为靶细胞进行体外试验,确认CAR或TCR修饰的免疫细胞可特异性的识别和杀伤靶细胞。拷贝数,是指某基因(可以是质粒)在某一生物的基因组中的个数。南京CAR-T载体拷贝数方法
ddPCR与qPCR在监测CART细胞拷贝数灵敏度比较,CAR-T细胞免疫zhiliao发展迅速,CAR-T细胞zhiliao后的动力学监测对患者随访至关重要,对指导接受CAR-T细胞zhiliao的患者的临床决策也很重要。在给药前,CAR-T细胞产品内的转基因副本信息,如载体副本数量,对保证患者的安全性非常重要。目前还缺乏开放区域定量检测CAR-T细胞的实验方法。一些机构已经建立了内部分析来监测CAR-T细胞频率。2022年2月11日,MARIA?LUISASCHUBERT等团队在INTERNATIONALJOURNALOFONCOLOGY上发表了题为:Comparisonofsinglecopygene?basedduplexquantitativePCRanddigitaldropletPCRformonitoringofexpansionofCD19?directedCARTcellsintreatedpatients的研究,将德国海德堡大学医院建立的定量(q)PCR检测方法,即基于单拷贝基因的qPCR与德国汉堡-埃彭多夫大学医学中心建立的数字液滴PCR检测方法进行了比较。这两种方法都是duli开发的,能够准确并定量比较CAR-T细胞频率,并在临床监测中起到重要作用。 连云港腺相关病毒载体拷贝数安评用于检测单个CAR-T细胞的慢病毒载体拷贝数的方法。
人工构建的质粒载体分类:高拷贝数的质粒载体,ColE1、pMB1派生质粒具有高拷贝数的特点。适合大量增殖克隆基因,或需要大量表达的基因产物。低拷贝数的质粒载体,由pSC101派生来的载体特点是分子量小的拷贝数。它有特殊的用途:当有些被克隆的基因的表达产物过多时会严重影响寄主菌的正常代谢活动,导致寄主菌的死亡时,就需要低拷贝的载体。失控的质粒载体,这是一类温度敏感型复制控制质粒。如pBEU1、pBEU2。插入失活型克隆载体。载体的克隆位点位于其某一个选择性标记基因内部。如pDF41、pDF42。正选择的质粒载体,直接选择转化后的细胞。只有带有选择标记基因的转化菌细胞才能在选择培养基上生长。
拷贝数,是指某基因(可以是质粒)在某一生物的基因组中的个数。单拷贝就是该基因在该生物基因组中只有一个,多拷贝则指有多个。在细菌细胞中,根据复制特性,质粒分严紧型和松弛型两类,前者在细胞中只含1?2个,而后者含10?15个以上。恒定的拷贝数与质粒复制控制系统、宿主细胞遗传背景及生长条件有关。拷贝数变异(Copynumbervariation,CNV)是由基因组发生重排而导致的,一般指长度为1kb以上的基因组大片段的拷贝数增加或者减少,主要表现为亚显微水平的缺失和重复。载体拷贝数安评,可咨询上海唯可生物。
一般情况下重组载体基因较少整合到基因组中,但近年来已发现载体基因整合到特定基因座中导致的可能性。建议设计时充分考虑重组载体的安全性,关注目的基因的启动子选择、给药剂量、整合区域等多种相关因素。建议对病毒载体进行全基因组测序。另外,也可将病毒载体转导目标细胞后,对整合有载体序列的细胞基因组进行测序,说明载体骨架及目的基因序列的准确性。对于整合型载体还应考虑插入突变的风险,应对插入位点进行分析并说明对细胞存在的潜在的安全性影响,并对分析方法的合理性进行说明。CAR-T载体拷贝数检测服务,欢迎来电咨询!浙江慢病毒载体拷贝数安全性评价
检测细胞中病毒载体拷贝数的引物和探针、试剂盒、方法。南京CAR-T载体拷贝数方法
穿梭质粒:是指一类人工构建的具有两种不同复制起点和筛选,因而可以在两种不同类群宿主中存活和复制的质粒载体。此概念不仅用于不同的微生物菌群之间,也可以推广到真核生物表达载体的构建,如用于枯草的pBE2、酵母的pPIC9K、哺乳动物表达载体pMT2和用于植物细胞的Ti质粒。这些穿梭质粒不仅可以在大肠杆菌中复制扩增,也可以在相应的枯草、酵母、动物或植物细胞中扩增和表达。这样利于对质粒的分子生物学操作和大量制备。质粒的不相容性:通俗来说,就是一山不能容二虎。但是作为科学来说,我们需要一个严谨的定义。“利用同一复制系统的两个质粒会在复制和随后向自细胞的分配过程中彼此竞争,这样的质粒在细菌培养物中不能和平共处,这种现象称之为不相容性”。南京CAR-T载体拷贝数方法