脱靶来自于这些技术所携带的功能基团，如碱基编辑的脱氨酶和先导编辑的逆转录酶，不依赖sgRNA结合基因组DNA的情况下产生的脱靶。为检测第二类脱靶现象，研究者需要针对每种技术设计专门的检测方法。1) R-loop seq在碱基编辑开发早期，虽然靶位点的编辑效率很高，但研究者也很快发现脱氨酶会在游离的时候随机修饰暴露的DNA单链，导致大量的脱靶位点。为降低这类脱靶现象的发生，研究者设计了R-loop seq，以dSaCas9结合DNA形成R-loop，暴露出DNA单链，为碱基编辑的脱氨酶提供一个固定的脱靶位点，然后以该位点的编辑效率反映碱基编辑脱氨酶的脱靶程度。选择潜在的脱靶位点，例如选择gRNA预测网站上Top 5潜在脱靶位点，进行Sanger测序单克隆；武汉育种脱靶检测服务

近几年，细胞和基因zhiliao（cell & gene therapy，CGT）领域发展迅猛，在多个方向取得了重大突破，以anti-CD19和BCMA为代的多种CAR-T免疫细胞疗法攻克了一部分血液瘤，多种AAV疗法也给一些难以成药的罕见病提供了有效的zhiliao方案。另一方面，基于CRISPR基因编辑技术的众多基因疗法也进展迅速，较早体外基因编辑疗法较快今年年底能够上市（CRISPR Therapeutics CTX001），体内基因编辑疗法取得了不错的临床数据（Intellia Therapeutics NTLA-2001），使用CRISPR技术制造的通用型CAR-T疗法也是免疫细胞疗法发展的一大趋势（Caribou Biosciences CB-010）。广州种子基因脱靶检测方法脱靶检测CRO，推荐唯可生物，实验实力强，专业性高，检测效率高，结果准确率高。

CRISPR/Cas系统是细菌和古细菌在不断进化的过程中产生的适应性免疫防御机制，它应用CRISPR RNA（crRNA）以碱基互补的形式引导相应的Cas蛋白识别入侵的外源基因组，并对其DNA进行剪切，用以保护自身的基因组免受外源核酸如噬菌体、病毒等的干扰和破坏。经过人为改造后，可在真核细胞中实现高度灵活且特异的基因组编辑，通过设计特异性向导RNA(Single guide RNA, sgRNA)序列与靶序列进行碱基配对，从而引导Cas蛋白结合到靶序列处，行使DNA切割功能，然后利用细胞的非同源性末端连接(Non-homologous end joining, NHEJ)或同源重组(Homologous recombination,HR)修复机制对断裂的DNA进行插入缺失(Indel)、修复(Repair)或替换(Replacement)。由于其相对于锌指核酸酶(ZFNs)和转录jihuo因子样效应物核酸酶(TALENs)技术更易于操作，而且更高效，因而被广运用于对基因组特定位点进行靶向编辑。

R-loop seq虽然不是一种真正意义上的脱靶位点检测方法，但能为碱基编辑脱氨酶的脱靶提供一种度量方法，以便于之后的脱氨酶点突变优化，来降低脱靶的发生几率。2) Detect-seqCRISPR衍生技术由于其复杂性，检测其脱靶位点的hexin思路是捕获实验过程中的关键中间产物或者终产物。这种设计思路下，目前较为成功的是检测碱基编辑CBE脱靶位点的Detect-seq[13]。CBE的原理是将dC脱氨变为dU，迫使其对侧的dG变为dA，较终将碱基对从C-G转变为T-A。Detect-seq便是针对中间态的dU，使用Uracil DNA Glycosylase (UDG)，去除U碱基后，替换为带Biotin的U碱基，捕获碱基编辑的脱靶位点，并且sgRNA依赖和sgRNA不依赖的脱靶位点都能找到。该方法类似检测DNA甲基化的重亚硫酸盐测序法，通过处理特定的碱基，可以捕获全基因组上的CBE脱靶位点。种子基因脱靶检测机构推荐唯可。

改进Cas变体使用SpCas9和SaCas9 变体：已研发出诸如SpCas9-Nickase、dCas9 、dCas9–FokI、xCas9、Cas9-NG、evoCas9、SpCas9 – HFI、eSpCas9和Hypa-Cas9等多种Cas变体，可降低脱靶效应。改进的Cas9同源物具有更广的PAM功能和特异性：实验表明Cpf1、CRISPR-Cpf1-RNP可降低脱靶效应。CRISPR 递送方法：基于病毒的递送方法：腺病毒 (AdV) 显示出整合到靶细胞基因组中的微弱潜力，这一特征有利于限制脱靶效应。然而，AdVs 会引发免疫反应，目前还不能完全排除它与宿主基因组整合的可能性。非病毒递送方法：当sgRNA和Cas9以RNP复合物形式传递时，电穿孔显示植物原生质体中的脱靶突变数量很低。通过脂质体介导的转染传递RNP复合物显示，与质粒DNA转染相比，脱靶突变的发生率较小。脱靶检测报告，推荐唯可生物，实验实力强，专业性高，检测效率高，结果准确率高。广州crispr/cas9脱靶检测安评

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TCR修饰免疫细胞的脱靶毒性可通过评估TCR与人体自身抗原肽的交叉识别能力来评估。首先，应采用体外试验测定TCR修饰的免疫细胞与人自身抗原肽-HLA（与递呈靶抗原肽的HLA等位基因相同）复合物的亲和力，并说明抗原肽的选择依据及选择范围。此外，还应研究其他相关或不相关的蛋白中是否含有靶抗原肽序列。如果TCR与人自身抗原肽有交叉反应可能，应确定靶抗原肽的较小识别基序（motif），并采用计算机预测分析评估交叉反应性。如果计算机预测可识别出具有潜在交叉反应性的抗原肽，应在体外测定TCR修饰免疫细胞对表达相应蛋白或递呈相应抗原肽的的细胞的识别能力。如果不能排除交叉反应性，应基于含有潜在交叉反应性抗原肽的蛋白的表达模式以及TCR与潜在交叉反应性抗原肽的亲和力来进行风险评估。为获得TCR与其他等位HLA潜在交叉反应性的信息，应进行充分的HLA交叉反应性筛选。对于TCR修饰的T细胞，还应关注引入TCR链和内源性TCR之间的错配可能性，应描述和说明旨在降低错配可能性的TCR设计策略。武汉育种脱靶检测服务